服务和费用
计算资源
与机构肿瘤护理和研究信息系统(OCRIS)合作,一个有MD Anderson信息系统(IS)部门和供应商的部门,188bet体育网址QIAC提供了一种稳健的计算和沟通资源,用于成像研究。
与一个人的支持团队一起OCRIS拥有的软件开发人员和系统管理员提供专门的团队来实现QIAC应用和管理高性能的Linux服务器,Oracle数据库服务器和海量数据的存储,备份和归档系统,以满足影像诊断等研究机构。188bet体育网址QIAC分配了70 TB的IBM GPFS磁盘存储,具有定期进行的容量规划审查,以确定是否增加存储分配。图像分析软件(例如,MATLAB,3D SliCer,R)可在高性能计算群集中作为多用户网站许可证或开源许可证。QIAC与EPIC一体化,为临床试验团队提供成像分析报告。QIAC已经建立了一种向MD Anderson的大数据平台上传图像分析结果的途径,可以进行对成像,分子,临床,人口统计数据等的交叉学科研究。188bet体育网址
办公空间
适用于教师,员工和学员的适当办公空间。QIAC总部位于3SCR,超过600平方英尺的致敬空间,可容纳18名成像专家和其他技术和管理人员。
费用结构
DICOM图像
DICOM图像去识别
将DICOM图像发送到临床用途的DICOM图像的当前工作流程将保持完整。从扫描仪获取的图像被存档在常规临床PACS中。QIAC将通过去识别过程实现发送DICOM图像的替代流程。
流过QIAC的DICOM图像将被截获。截取的DICOM将删除或匿名的所有PHI。将DICOM图像关联到实际患者的原始标识符将被保留,加密,并存储在Oracle数据库中。
然后,将识别的DICOMS将以稳健的高容量和高性能存储系统存储,运行IBM的一般并行文件系统(GPF)。
DICOM图像质量保证
一旦完成去识别和元数据提取完成,将通知QIAC成像分析师(通过电子邮件),并指向Web界面(QIAC图像QA门户),在那里他们可以在去识别的DICOM图像上执行质量保证(QA)。QA将验证图像质量以及展望的准确性和完整性。
通过QA的DICOM图像将通过另一个Web界面(QIAC Data Explorer)来搜索和检索。失败QC的DICOM图像将触发另一个过程,该过程将导致图像从扫描仪重新生成并通过去识别工作流程重新提交。
DICOM元数据提取
一旦将去识别的DICOM持续到GPFS文件系统中,QIAC系统就会提取元数据(DICOM标签和值),并将它们存储成强大,高度可扩展和多结构的数据库系统(HBase),这将成为主要数据源对于DICOM图像数据查询门户(QIAC数据资源管理器)。QIAC访问和管理门户是用户和管理员接口,可以与外部基础架构集成,如MDA大数据仓库,MDA OEA,EPIC接口等。
DICOM图像分析
QIAC研188bet体育网址究人员将能够访问QIAC数据资源管理器以搜索(基于任何或所有可用属性)并识别感兴趣的图像。然后,它们将能够选择一组图像并提交它们以进行图像分析。这将通过半自动图像分析管道发送图像,该管道将在高性能,高内存计算群集中运行。
图像分析结果也将存储在GPFS文件系统上。除了在文件系统上存储分析结果文件之外,将从结果文件中提取成像功能的全部或某些子集(如QIAC Science Counts指定),并根据需要存储到HBase进行下游数据探索和集成。