服务和费用
MD Anderson PGC设施用户的说明
服务请求
所有服务请求将通过Web Portal进行iLab的
- 使用MD安德森凭据登录到您的iLab帐户起始目的的服务请求
- 要要求基因组服务，请单击“请求服务”选项卡
- 要在Illumina Iscan上进行成像，请单击“计划设备”选项卡
- 用户将根据扫描的芯片数量而不是仪器时间来收费
请注意:请用户查看“服务清单”下的基本价格;然而，所有的最终价格取决于设施的批准。
如需客户服务和其他信息，请联系张迪dizhang@mdanderson.org。
生物样本和数据访问
BioPexecen和/或数据访问（仅适用于MD Anderson用户）需要完成和批准正式申请红帽
- 批准之后，请访问“请求服务”启动生物样本请求
有关的红帽子申请过程中有任何疑问，请联系挥掌在huizhang@mdanderson.org
相同的定价内部，外部网络和UT系统
外部网络机构：
- 贝勒医学院
- 赖斯大学
- 休斯顿大学
- 得克萨斯州A＆生物科学与技术的M个健康科学中心研究所
PGC FY21价格表
Illumina的微阵列
该PGC微阵列服务提供全方位的高含量（全基因组或定位），高通量基因型，基因表达和DNA甲基化谱，以促进分子改变和疾病的人类基因组研究。
PGC微阵列服务管线包括使用GenomeStudio的样品质量检查，样品制备，靶杂交，珠芯片成像和数据分析。请联系PGC设施，了解有关可用服务类型，样品要求，工作流，定价和时间表的更多详细信息。
下面描述的许多阵列具有允许半定制设计的附加容量。
的Infinium全球筛选阵列-24
一种经济的新一代全球基因分型阵列结合了多民族的基因组范围的内容，策划的临床研究变种，和质量控制（QC）标记。188bet体育网址
55美元/样本
Infinium Oncoarray-500,000 beadchip
能够筛选50万个SNPs与全基因组25万个标签SNPs的骨干。其他SNPs包括乳腺癌、结直肠癌、肺癌、卵巢癌和前列腺癌的遗传变异;血统;定量特征;遗传药理学;以及对常见癌症易感位点的精细定位。
$ 77％的样本
Infinium免疫阵列-24珠芯片
检测人体免疫系统的遗传变异。从HumanImmuno V1 BeadChip芯片，补充有GWAS确定的用于治疗自身免疫和炎性疾病基因座整合的内容。
每种样品51美元
Infinium Core-24珠芯片
含有各种世界人口，诱惑，重点聚焦内容的基因组 - 宽标签SNP，以及包括多达300,000个半定制标记的能力。
$ 59％的样本
的Infinium外显子组-24 BeadChip芯片
丰富推定的功能外显子变异，由> 24000个标记组成，来自广泛的人群，包括欧洲、非洲、中国和西班牙血统;常见的人类疾病，如2型糖尿病、癌症、代谢和精神疾病。
$ 57％样本
英飞纳姆CoreExome-24 BeadChip
包括Infinium Core-24和Exome-24珠芯片的含量。Plus为性确认，线粒体DNA，祖先，indel和拷贝数变异（CNV）分析提供额外的常见变体关联覆盖范围。
每样65美元
Infinium Global Diversity Array-8 BeadChip
启用在不同人群的多基因风险评分的开发和表征的遗传结构。建立在对基因组的横人口插补优化的高密度单核苷酸多态性（SNP）全球骨干。
每样118美元
的Infinium Omni5Exome-4 BeadChip芯片
提供了全基因组基因分型和拷贝数变异（CNV）的研究功能外显子的内容。还用于遗传变异体优化下降到1％的次要等位基因频率（MAF）。
$ 335每样本
Infinium HD Iselect-24珠芯片
高清晰度(HD: 3072至90000 BeadTypes)或高吞吐量(HTS: 90001至700,000 BeadTypes)定制设计的BeadChip。支持多达700k自定义目标(SNPs, indels和CNVs)。如需研究设计和咨询，请咨询PGC。
价格要求
其他Illumina公司数组
其他Illumina Infinium基因分型阵列和甲基化阵列(如MethylationEPIC BeadChip)可以在PGC运行。
价格要求
*对于网络外机构，请登录到的iLAB看到价格信息，或联系的PGC经理。
Taqman SNP基因分型
荧光定量基因检测允许低通量候选基因和基因分型的通路中的研究。预先设计或定制设计的TaqMan探针和目标特异性引物被纳入实时PCR检测上应用生物系统公司Vii7或Fluidigm公司的BioMark HD系统上运行。在TaqMan测定可从微阵列分析可以用于独立地验证全基因组基因座鉴定。
启动
- 不到1,000个样本：每SNP $ 365
- 1000个或更多样品：每SNP 600美元
基因分型
- 不到1000倍的样品：每个样品$ 0.62每SNP
- 1000-2000样品：每个样品$ 0.56每SNP
- 超过2000个样本:每个样本每SNP 0.45美元
电镀
- 384孔格式：每个样品$ 0.27
生物标本申请(MD Anderson调查者专用)
从残留诊断血液(血液标本研究和资源，BSRR)计划和其他资源基因组DNA可用。188bet体育网址所有申请应通过红帽在iLab链接。在获得数据和生物标本获取委员会(DBAC)批准后，应通过iLAB发起样品分发请求。
残留的生物自发DNA
- 样品1-96:每个样品28.00美元
- 样本97及以上*:每个样本$12.50
* 100个样品:96 * $28.00 + 4 * $12.50
附加服务（具有确认的PGC项目）
- 学习设计和咨询：75美元/小时
- 定制的DNA提取：28 $ /每个样品
- DNA重新净化/清理（前96个样品）：每个样品22美元
- DNA重新净化/清理（前96个样本）：每种样品15美元
- 量子位:$ 5 / /样品
*对于网络外机构，请登录iLAB查看价格信息，或联系PGC经理
Illumina公司ISCAN
iScan系统是一种高精度、高通量荧光芯片扫描仪，用于从基因分型到DNA甲基化分析的无数Illumina阵列的基因组分析。该系统与一个机器人工作站连接，每天可以扫描数百个阵列样本。
用户可以通过PGC ILAB在线预订仪器时间。扫描服务是为了辅助使用仅（即用户不允许扫描自己的筹码）。用户将不会被收取仪器时间;所有费用将基于扫描的芯片数量。
- 使用ISCAN的Illumina Beadchip：55美元/芯片