根据您的实验要求，我们提供多种RNA或DNA样本的深度测序实验方案。在许多情况下，多个样本可以成功地分析在每个车道的测序运行。给定车道的多样性受实验所需的读取深度的限制。

下表提供了对各种实验的典型多样性和测序需求、Core的样本需求和估计成本的指导。更详细的信息，请致电或电子邮件与核心员工安排会议。

价格如有变动，恕不另行通知。

服务	样本类型	最少	最低 用量 (ng /µL)	质量	额外的要求
RNA-seq
总RNA Seq	总RNA	1.5μg.	One hundred.	RIN > 8.0	DNase治疗
信使rna Seq	总RNA	2µg	200	RIN > 8.0	不需要DNase处理
microrna的Seq	总RNA	2µg	200	RIN > 8.0	不需要DNase处理

^{*注意:RRBS和WGBS文库均由DNA甲基化分析核心(DNA Methylation Analysis Core)制备，并由科技园NGS核心(Science Park NGS Core)进行测序。}

服务类型	测序	多重性(样本/巷)	预计#读取	成本/巷* *
RNA-seq
差异表达（Truseq链状总RNA）	76 nt，配对结束	8	> 20米	$ 3,372
差异表达(TruSeq链mRNA)	76 nt，配对结束	8	> 20米	$ 2,684
新型转录本(TruSeq链总RNA)	76 nt，配对结束	4	> 40米	2516美元
microrna的*	36元,单一的阅读	12	> 8M.	2836美元
DNA-SEQ.
人类外显子组	76 nt，配对结束	4	> 40米	2820美元
鼠标外显子组	76 nt，配对结束	4	> 40米	$ 3,122
ChIP-seq	36元，单读	6	> 18米	查询
还原亚硫酸氢盐测序(RRBS)	36件，成对端	4	> 24米(20 x覆盖率)	1810美元
亚硫酸氢盐全基因组测序(WGBS)	76元双端或100元双端***	1	查询	查询

<sup>*注意:miRNA样品通常可以多路复用，每道最多48个样品。
* *注意:成本基于HiSeq 3000计算。如果使用NextSeq 500，这个估计会有所不同。成本是样品制备和测序成本的总和。一旦你决定了测序的类型(读取长度，单端或成对端)和多样性(每个车道的样本数量)，成本可以在下表中的参数中计算。
* * *注意:取决于准备好的WGBS库的大小范围。</sup>

样品制备	NGS用户组成员价格	MDACC教员, UT系统，BCM w/ MOU价格	*外部无线网络价格	数量
TruSeq链总RNA**	266.05美元	321.47美元	514.35美元	每一个样品
TruSeq链mRNA	182.05美元	237.47美元	379.95美元	每一个样品
QuantSeq 3' mRNA-Seq Library Prep (Lexogen)	58.83美元	77.98美元	124.77美元	每一个样品
超低输入RNA cDNA Synthesis (Clontech SMART-Seq v4)	162美元	202美元	256美元	每一个样品
文库准备超低输入RNA (Illumina NexteraXT)(不包括cDNA合成)	55美元	100美元	160美元	每一个样品
TruSeq RNA Access Library Prep(用于从FFPE组织中分离的人RNA)	275美元	444美元	710.40美元	每一个样品
microRNA-seq (Illumina公司装备)	176.34美元	$ 286.03	430.83美元	每一个样品
microRNA-seq(内包)	122.80美元			每一个样品
芯片SEQ（NEB ULTRA KIT）（用珠子清洁定价）	118.96美元	163.30美元	261.28美元	每一个样品
ChIP-seq (KAPA Hyper kit)(含珠子清理价格)	117.82美元	162.15美元	259.45美元	每一个样品
Exome-seq	175.09美元	312.19美元	493.19美元	每个样本(不包括捕获)
外显子组捕获鼠标	875.79美元	985.46美元	1130 .26美元	每个样本(1-4个样本/捕获)
人类外显子组捕获	$ 566.19.	675.86美元	820.66美元	每个样本(1-4个样本/捕获)
还原亚硫酸氢盐Seq	245美元			每一个样品
亚硫酸氢盐全基因组测序(WGBS)	255美元			每一个图书馆

<sup>*注意:这些价格不包括我们机构可以收集的任何开销成本。
* *注意:请联系核心员工咨询套件选择。</sup>

服务	NGS用户组成员 价格(每车道)	MDACC学院，UT系统 BCM w /备忘录 价格(每车道)	*外部网络外 价格(每车道)
HiSeq 3000
50 bp，单读	966.41美元	1100 .71元	美元2177 .47点
75 bp，配对端	美元1746 .41点	1880 .71元	美元3425 .47点
100bp，配对端	2089美元收	2223 .91点	3974 .59点
150 bp，成对端	2431美元	2565 .55美元	4521 .22元
NextSeq 500
高输出:
75 bp，单读	1632 .95美元	美元1853 .96点	美元3238 .11点
75 bp，配对端	美元3085 .83点	$ 3,306.84	美元5562 .72点
150 bp，成对端	4904 .79	5125 .80美元	美元8473 .06点
中期输出:
75 bp，配对端	1232 .55美元	1453 .56点美元	$ 2,597.47
150 bp，成对端	美元1941 .83点	2162 .84元	3732美元收
MiSeq
50 bp，单读(v2化学)	$ 948.99	美元1132 .53点	1358 .78点
150 bp，配对末端(v2化学)	1202 .19元	美元1481 .73点	$ 1,707.98.
300 bp，单读(v2化学)	1202 .19元	美元1481 .73点	$ 1,707.98.
300 bp，配对端(v3化学)	1782 .99美元	美元2177 .73点	美元2403 .98点

^{*注意:这些价格不包括我们机构可以收集的任何开销成本。}