表观基因组学分析的核心
服务
- 表观基因组学分析的核心
- DNA甲基化分析服务
- 高通量的ChIP服务
表观基因组分析核心(EpiCore)是由癌症表观遗传学中心和表观遗传学和分子致癌系资助的。该核心的总体目标是促进研究人员努力定义表观遗传机制，即改变染色质状态以在正常和疾病条件下调节转188bet体育网址录。
我们的宗旨
该表观基因组学剖析核心积极参与，并通过提供服务来分析后天的改变和染色质辅助功能有助于在MD安德森和整个德州医学中心不断增长的表观遗传学界。我们目前的业务主要集中在DNA甲基化分析，ATAC-SEQ，和高通量染色质免疫沉淀（ChIP）。
EpiCore概述
DNA甲基化分析服务
发生在DNA特定位点的甲基化事件是最早确定的染色质表观遗传修饰之一。DNA甲基化对正常发育至关重要，与许多关键过程相关，如印迹。DNA甲基化，可以逆转，通常影响基因转录。当甲基化发生在基因组调控元件中时尤其如此。因此，DNA甲基化模式的改变反映了重要的表观遗传变化。DNA甲基化分析服务通过广泛的方法为研究人员提供全球和基因特异性DNA甲基化分析的途径。
我们的服务包括:
•与调查咨询，以选择分析的最佳方法
• 样品制备
•分析设计
•用于研究DNA甲基化的常用基因特异性和全基因组方法的样本处理:
- PyroMeth
- RRBS
- 甲基SEQ
•总体DNA甲基化的评价通过焦磷酸测序为重复元件的分析（例如LINE-1和ALU重复）
请联系马科斯Estecio博士（mestecio@mdanderson.org）来调度DNA甲基化分析服务预约和初级咨询。
如需其他行程安排，请使用iLab的
高通量的ChIP-Seq的服务
研究人员对理解染色质动力学感兴趣的一个主要问题是蛋白质- dn188bet体育网址a相互作用如何改变表观遗传景观来改变基因表达。染色质免疫沉淀(ChIP)用于询问特定基因组位点的蛋白质- dna相互作用。ChIP- seq(芯片后进行DNA深度测序)能够识别基因组中染色质结合蛋白富集的区域。高通量ChIP-Seq服务提供了一个创新的、成本效益高的96井平台，提供高质量的、准备测序的文库，用于在全基因组范围内绘制组蛋白修饰、转录共调控因子和转录因子。
我们的服务包括:
•与调查咨询，以选择分析的最佳方法
•从细胞和组织样本中提取高质量的染色质
•使用一组特定的组蛋白标记（下），或研究者优选的抗体验证抗体芯片
-H3K4me3 H3K27me3(发起人)
-H3K4me1 H3K27ac(增强)
-H3K36me3，H3K79me2（基因体）
-H3K9me3（异染色质）
•从免疫沉淀材料制备测序文库
ATAC-Seq服务
表观基因组分析核心(EpiCore)现在提供ATAC-seq(高通量测序测定转座酶可获得染色质)服务。这项服务帮助客户解决有关染色质可达性、转录因子结合和核小体跨基因组定位的科学问题，与更传统的方法相比，减少了线粒体DNA污染。
请联系阿贾殷博士。（ajain@mdanderson.org）安排用于高通量的ChIP-Seq的和ATAC-seq的服务预约和初级咨询。
如需其他行程安排，请使用iLab的
EpiCore工作流程
在与有关研究者的需求和样品要求的核心部分董事的讨论，调查员提交他或她的样品送到
生物信息学技术支持
联系信息
DNA甲基化分析服务
Marcos R. Estecio博士
副主任，表观基因组分析核心
董事，DNA甲基化分析服务
办公电话：713-792-9108
电子邮件:mestecio@mdanderson.org
高通量的ChIP-Seq的服务
阿贾殷博士。
副主任，表观基因组分析核心
导演，高吞吐量的ChIP-Seq的服务
办公电话:713-834-6366
电子邮件:ajain@mdanderson.org