CPRIT儿童实体肿瘤综合数据资源核心

• 全基因组测序（WGS）
• 全基因组测序（WES）
• RNA测序

平台和仪器

• NovaSeq 6000
• Ilumina HiSeq 4000
• Ilumina HiSeq 3000
• Ilumina HiSeq 2000
• Ilumina NextSeq 500
• Ilumina MiSeq
• Ilumina CBOT
• Covaris S200
• 蓝皮平

免疫组织化学（IHC）或多重由于以下优化抗体的单重使用面板：

• 免疫检查站
• 髓源抑制细胞（MDSC的）
• T细胞

流式细胞仪/质谱术/复用的离子束成像（MIBI）面板可用于以下情况：

• T细胞
• B细胞
• NK细胞
• 树突状细胞
• T细胞上的共刺激和共抑制分子

功能评估

• T细胞活化的流式细胞术检测
• ELISPOT
• 新抗原发现
• T细胞受体（TCR）和B细胞受体（BCR）的识别

宿主因素

• 细胞因子分析

平台和仪器

• 中尺度发现（MSD）
• Luminex公司
• ELISA
• 自动IHC / IF（徕卡^TM值，AT2的Aperio^TM值，的Aperio /精灵^TM值， 精灵^TM值;威达^TM值，威达/通知^TM值， 通知^TM值）
• 免疫荧光系统（蛋白石^TM值-tsa系统多重威达IF，威达^TM值仪（Perkin Elmer，威达/通知^TM值
• MediMachine（肿瘤组织的分解）-flow染色采集与分析（BD CantoII，BD Fortessa X20）

DNA甲基化

• 基因特异性和全基因组的方法
  • 硫酸氢盐测序
  • 减少表示亚硫酸氢盐测序（RRBS）
  • 全基因组硫酸氢盐测序（WGBS）
  • 焦磷酸测序DNA甲基化分析（PMA）

高通量的ChIP-Seq的

• 组蛋白修饰
  • 组蛋白H3-K4-ME3，组蛋白H3-K27-ME3（发起人）
  • 组蛋白H3-K4-ME1，组蛋白H3-K27-AC（增强）
  • 组蛋白H3-K36-ME3，组蛋白H3-K79-ME2（基因体）
  • 组蛋白H3-K9-ME3（异）
  • 转录因子（如需要）

平台和仪器

• PyroMark Q96ID
• Ilumina HiSeq 3000
• Ilumina NextSeq 500
• Ilumina MISeq
• Ilumina CBOT
• Bioruptor双床超声仪
• Covaris S200
• 蓝皮平
• 安捷伦2100生物分析仪
• 安捷伦2200 TapeStation

• 高灵敏度LC / MS / MS分析
• RPPA（肿瘤组织和培养的细胞）

平台和仪器

• 高分辨率，精确质量（HRAM） - Orbitrap质谱融合Tribrid质谱仪。
• 矩阵-Assisted激光解吸电离（MALDI）（4700 MALDI TOF / TOF质谱）
• 三重四极杆（TSQ Quantiva三重四极杆质谱仪