服务
DNA提取
DNA可以从全血、新鲜或冷冻组织、培养细胞和档案组织中提取。方法取决于组织的来源。
FFPE DNA提取及肿瘤组织解剖
- DNA纯化的起始材料应为新鲜切割的FFPE组织切片,最多3片,每片厚度不超过10 μm,表面积不超过250毫米2,可以组合在一种制剂中。
- 以H&E切片为模板标记肿瘤组织区域,即可解剖肿瘤组织。
从Oragene®容器中收集的唾液中提取DNA
- 推荐的唾液量是2毫升®试剂盒中的DNA溶液为2.0 ml。因此,2ml唾液加Oragene的总体积®DNA溶液应为4.0 ml。
- 应在30分钟内收集完整的唾液样本和橙子汁®DNA试剂盒应立即加盖。等待超过30分钟可能会降低DNA的产量和质量。
- 混合Oragene®DNA/唾液样本®倒置DNA小瓶。
血液相关样本的DNA提取
- 如果可能,用EDTA管采集血液以减少DNA降解。然而,其他抗凝剂如ACD(柠檬酸盐)也可成功使用。
- 从血液样本中分离出的DNA数量高度依赖于样本中存在的白细胞数量和血液储存条件。平均从10ml的新鲜血液中分离出350ug的DNA。在-80°C冷冻的样品通常会降低15%的DNA产率。为达到最佳效果,应将血液在4°C下保存5天以下或当天在-80°C下冷冻。
全血DNA提取
- 对于短期保存,新鲜抽取的血样在4°C下保存不超过5天。为获得最佳结果,新鲜血液样本应在采集后尽快送到中心。
- 为了长期保存,血液标本采集后应立即保存在-80°C。
- 核心设备不建议在-20°C条件下保存血液样本。血液在这种温度下储存3天会导致DNA产量下降。在这样的温度下储存2-4周,产量是相同样品的一半。
从白大衣上提取的DNA
- 在加工前,可在-80°C冷冻保存。
从细胞颗粒中提取DNA
- 无论是新鲜的还是冷冻的细胞球都可以用于提取。
血液相关、全血、褐皮和细胞颗粒的标本提交
请提交样品在安全管。直接带到核心的样品可以放在实验室的冰箱里。如果样品需要在-80°C下储存,请直接将样品交给核心的技术人员。
从新鲜冷冻组织或细胞颗粒中提取DNA, RNA和蛋白质
- 固体组织或培养的细胞样本应立即处理或冷冻,以尽量减少内源性核酸酶的活性。
- 将组织切片,厚度不要超过5毫米。细胞应成颗粒状。样品必须立即在液氮或低温恒温器中快速冷冻。
- 如果不需要形态学保存,则将样品无限期地置于-80°C冰箱中,直到DNA或RNA分离。
全血处理淋巴细胞和血浆
- 全血应保存在ACD管和EDTA管中。
- 对于血浆和全血,在可能的情况下将真空容器完全填满,以消除抗凝剂或防腐剂的稀释,并立即将试管轻轻彻底翻转5至10次,使血液混合。
凝胶电泳检测DNA质量
- DNA应保存在TE中,以减少降解的机会。样品的分析浓度可低至5ng/ul。
- 用于成功焦磷酸测序的PCR产物将使用焦磷酸分析设计软件设计的引物进行扩增。生物素修饰是必需的。在AirClean 600 PCR工作站(AirClean Systems)进行无菌PCR制备。
微绿测定法测定DNA
- DNA应储存在TE或低TE中,并防止多次冻融,因为这会导致碎片化,导致微绿浓度较低。
- 由于这种分析的性质(只检测到双链DNA),与分光光度法(260/280)的读数相比,Picogreen读数通常会导致浓度显著降低。Picogreen Assay的DNA定量对于敏感的下游应用如GoldenGate基因分型和Next Generation测序是必要的。
与用户协商
- 在样品加工过程中,我们为用户提供免费咨询。在项目开始前,我们鼓励用户联系BER(联系人:顾健博士,主任),讨论他们的研究需求。188bet体育网址然后,BER工作人员将向用户提供样本收集和准备的指导方针。对于对样品加工有特殊需求的用户,我们将在可能的情况下,通过咨询,开发出适合他们需求的修改服务。此外,在服务开始前,还提供了服务概述和估计的周转时间。
价格单
系统服务 | 2015的价格 |
---|---|
血液DNA提取 | 30美元/血液样本 |
唾液DNA提取 | 22美元/唾液样本 |
同时DNA / RNA /蛋白质提取 | 95美元/样本 |
从新鲜冷冻组织中提取RNA | 50美元/样本 |
冷冻组织的DNA | 28美元/样本 |
FFPE组织的DNA(最多3片/样本) | 38美元/样本 |
#额外的FFPE幻灯片 | 0.50美元/张 |
全血加工 | 6美元/样本 |
凝胶电泳 | 1.50美元/样本 |
Picogreen | 每盘88个样品,售价152美元 |
从新鲜冷冻组织中提取蛋白质 | 18美元/样本 |