该中心为RNA干扰和非编码RNA(RNA中心),在红和查林麦库姆斯研究所癌症的早期检测和治疗建立,是其中一个独特的合作倡议MD安德森癌症中心,贝勒医学院,得克萨斯大学健康科学中心的休斯敦大学,莱斯大学和休斯顿,将着眼于取得见解在癌症发生,发展和传播新发现的RNA的作用大学。
我们的使命是识别,工程师和加快非编码RNA(ncRNA的)发现的突破导致癌症生物标志物和治疗。
我们的短期ojective是建立在现有的在临床研究188bet体育网址MD安德森癌症中心通过与RNA中心的合作和成员建立一个以ncRNA为中心的努力,通过评估、共同开发、促进和传播新的ncRNA技术来推动癌症分子标记的发现。
我们的长期目标是建立一个机构范围内的ncRNA资源,在临床和基础研究的ncRNA和RNAi领域进行合作和提供专业知识。188bet体育网址
联系我们
拉胡尔Mitra博士。
项目总监,RNA中心
电子邮件:rmitra@mdanderson.org要么rnacenter@mdanderson.org
概述
在广泛的领域,从癌症相关的慢性疼痛缓解致命的脑转移瘤的管理承诺,RNA干扰对每一种癌症都有潜在的应用。RNAi为关闭促进癌症生长的基因提供了一种强大和高度特异性的方法。我们的研188bet体育网址究人员的目标是在癌症治疗的整个连续过程中开发这种潜力。
MicroRNA等短或长非编码rna的改变参与了人类癌症的起始、进展和转移。主要的分子变化以基因表达的变化为代表,通常是温和的,并对大量的靶蛋白编码基因造成影响。与正常细胞相比,非编码rna在恶性细胞中广泛表达差异的原因可以通过这些基因在癌症相关基因组区域的位置、表观遗传机制和加工机制的改变来解释。
人类肿瘤中microRNA和其他短或长非编码rna的表达谱已经确定了与诊断、分期、进展、预后和治疗反应相关的特征。此外,基因分析还被用来识别非编码rna,这些rna可能代表活化的致癌途径的下游靶点,或者是与癌症相关的蛋白编码基因。最近的研究表明,miRNAs和非编码超冷冻服务基因是这类难以捉摸的癌症易感基因的主要候选基因,其他类型的非编码rna也参与了导致恶性表型的基因谜局。这些发现可以用来开发诊断和预后有用的标记物,以及开发新的rna为基础的癌症疗法。
RNAi一瞥
RNAi是一种类型的基因疗法,即“沉默”的基因通过破坏蛋白质制造过程。这个过程中,科学家们戏称为“分子生物学中心法则”的声明基本解释:DNA使RNA生成蛋白质。
DNA存在于细胞核中,由数千个基因组成,每个基因都携带着构建特定蛋白质分子的代码或“蓝图”,从而确保由该蛋白质执行特定的细胞功能。(蛋白质几乎完成了细胞的所有功能,包括激活其他基因。)当身体需要一种特定的蛋白质时,它的遗传密码就会从DNA中复制;这种“复制”是一种被称为信使RNA (mRNA)的单链分子。这个过程被称为转录,发生在细胞核中。
但是,蛋白质细胞核以外制造,名为核糖体的微观结构。该基因是至关重要的环节:在“信使”,从DNA拿起蛋白质制造指令,并将它们传递给蛋白质生产核糖体。
RNA干扰包括将miRNAs或siRNAs引入到细胞中,在那里它们靶向、结合并破坏特定的mrnas——有效地关闭特定蛋白质的生产以及它们触发或抑制的任何基因表达。
术语表
RNA-核糖核酸(ribonucleic acid)的首字母缩写,是生物细胞中存在的两种核酸之一(另一种是脱氧核糖核酸,简称DNA)。RNA是由被称为核苷酸的微小分子组成,排列成一条链。RNA运输制造蛋白质所需的信息。
非编码RNA (ncRNA)没有翻译成蛋白质的有功能的RNA分子。ncrna的例子有短干扰rna和小分子rna。
短干扰rna (sirna)-小的双链分子,用于RNA干扰,以防止基因转译成蛋白质。siRNAs也被称为小干扰rna或沉默rna。
微RNA(miRNA的)-能调节蛋白质编码基因表达的小型发夹状单链RNA分子。
核糖核酸干扰(RNAi)-基因沉默的革命性技术。在这项技术中,RNA被引入细胞中,以干扰信使RNA,并阻止它被翻译成蛋白质。
服务
RNA干扰和非编码RNA中心(RNA中心)现在使用Ventana Discovery Ultra为microRNA和非编码RNA分析提供高通量原位杂交(ISH)技术。该核心为确定小鼠和人类组织中的基因表达模式提供设备和服务。
设备:
- VENTANA DISCOVERY ULTRA
灵活性:
- 无与伦比的协议灵活性快速测定开发&
- 运行30个完全独立的协议来改进工作流程
再现性:
- 全自动载玻片处理,烘干染色
- 现成的优化的试剂
- 精确加热每个玻片
材料和方法:
- 冷冻和FFPE组织样品
- microRNA探针或定制的Exiqon LNA探针
- 其他采用LNA技术的ncRNA特异性探针
- 用抗地高辛或抗fitc抗体/AP共轭二抗/ NBT-BCIP底物检测
- 在亮场显微镜下成像
- 数据解释是在研究者的判断(我们将通过使用徕卡应用套件提供的信号的强度的量化)
处理时间:
- 最多7个工作日的miRNA杂交
- 其他ncRNA特异性杂交最多10个工作日
在这个阶段,RNA中心可以提供显色服务。在不久的将来,我们还将提供基于ISH的荧光和多重ISH/IHC。
如需更多信息,包括价格和提交申请,请与RNA中心助理教授张新娜博士联系xzhang12@mdanderson.org。