资源
我们的软件
CRISPR
ProTiler: CRISPR/Cas9 tilting - sgrna筛选的关键蛋白域从头鉴定的整合管道。
MoPAC:一个闪亮驱动的应用程序,用于分析和可视化多个样品的CRISPR/Cas9屏幕。
MaGeCK:一个基于模型的分析工具,用于从CRISPR/Cas9筛选中识别重要基因。
SSC:一种在CRISPR应用中预测sgRNA活性的在线工具。
CRISPR-DO:一个用于5个基因组(人类、老鼠、苍蝇、蠕虫和斑马鱼)的全基因组设计和优化sgRNA序列的web应用程序
ChIP-seq
CCAT:基于信号噪声模型的ChIP-seq分析工具(非常快!)
ChIPDiff:一种基于隐马尔可夫模型(HMM)的应用,通过比较两个ChIP-seq库来识别差异修饰的组蛋白位点。
基因组分析
GS2A:一种分析工具,用于从肿瘤队列的表达谱中筛选与一组“签名基因”相关的基因。