徐实验室

欢迎来到徐实验室在MD安德森癌症中心。徐研究集团是科188bet体育网址学园的表观遗传学和分子致癌科的一部分，位于奥斯汀附近的MD Anderson基础科学研究校园。

徐实验室开发了一系列的计算工具，以帮助进行遗传功能性筛网和蛋白质-DNA相互作用的分析。使用这些工具，它们以高吞吐量的方式探索蛋白质功能，监管关系和分子机制。他们目前的研究专注于优化和应188bet体育网址用CRISPR系统，这使得能够对转录因子和表观遗传调节剂进行系统的扰动研究。

徐实验室的长期兴趣是应用计算方法与高通量生物技术合并，以发现转录和表观遗传调控机制。转录因子（TFS）和表观遗传调节因子是核蛋白，其介导基因转录和染色质结构的变化，这反过来有助于建立和维持细胞性状。这些蛋白质通常形成复杂的监管网络以执行其功能。许多TFS和表观遗传调节因子在癌症中突变或失调，导致监管网络中的均衡扰动，导致癌细胞的脆弱性。因此，转录和表观遗传调节的“系统观点”将使新的治疗方法进行治疗癌症患者。

目前的研究领域188bet体育网址：

i）计算建模和预测CRISPR预测目标效率和偏离目标效果

ii）开发高通量CrispRPR筛选方法，用于识别表观遗传调节因子的合成致死性

iii）在TFS和表观遗传调节因子中重新施加Crisprpr屏幕以获得高通量鉴定的基本蛋白质结构域

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