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我们实验室的长期目标是改善胰腺癌患者令人沮丧的生存率,它现在是美国第三大最常见的癌症相关死亡原因。我们的实验室一直是胰腺导管腺癌(PDAC)和其他变异肿瘤基因组测序团队的组成部分,包括胰腺囊性肿瘤和胰腺神经内分泌肿瘤。在我们实188bet体育网址验室进行的研究是完全转译的,因为我们总是保持视线到诊所作为首要目标之一。Maitra实验室的广泛研究领域可以概188bet体育网址括如下:
胰腺癌中表观驾驶员的功能注释
除了广泛的遗传改变之外,现在显而易见的是,表观遗传机制也是人类癌症的进化和进展的核心。许多表观遗传司机被牵连,因为在PDAC中被异常改变,包括罗盘状复合物的成员(MLL3,KDM6A,SetD2)及SWI/SNF家族成员(ARID1A,叫做PBRM1)。我们的实验室目前正在使用体外和转基工程动物模型的组合进行PDAC的表述司机及其效应途径的严格审计。这些研究是与艾哈迈德中心的古普塔实验室合作。除了驾驶员突变的功能注释之外,我们还探索了新的合成致死关系,这些关系将导致靶向患者患者的靶向疗法。
胰腺囊性肿瘤的小鼠模型
胰腺癌不会出现De Novo,而是通过组织学上可辨别的病变,其是微观(胰腺上皮内瘤或PANIN)或宏观囊肿(最常见的,导管内乳头状乳糖瘤或IPMNS)。我们的实验室已参与阐明多年的PDAC前体病变的分子下限,包括IPMNS中的关键驾驶基因的鉴定。我们目前正在开发动物模型,旨在重新培养人类IPMNS的同源遗传学,其中目的使用这些小鼠作为早期胰腺炎早期检测,定量成像和靶向治疗的生物相关平台。突出的例子包括表达突变GNA和KRA等位基因的条件模型,这些模型在一起的人类IPMNS多达96%的人。这些小鼠普遍地在子集中的进展中发育囊性病变,以侵入性癌症。
液体活检用于治疗分层和疾病监测
我们的实验室已经实施了一个强大的管道获取液体活检的PDAC患者在MD安德森疾病的所有阶段。从这些液体活检中,我们获得了细胞游离DNA (cfDNA)、外泌体和循环肿瘤细胞(CTCs)。我们已经生成了用于分离外泌体的优化方案,这些外泌体具有易于下一代测序(NGS)的高度保存的核酸,以及基于微流体的平台用于分离活ctc。这些研究是在胰腺癌月亮拍摄®(由Maitra领导),为PDAC在治疗和进展的自然历史中提供了前所未有的空间和时间异质性。
通过全基因组测序和外泌体DNA (ExoDNA)拷贝数分析评估的转移性PDAC中肿瘤基因组进化的例子。