目前,妨碍了胃肠道肿瘤有效治疗的两个最大限制是(1)普遍缺乏有效的靶向疗法,(2)缺乏预测性生物标志物,以帮助肿瘤学家确定哪些个体患者将受益于标准化疗或有针对性的疗法目前正在开发。沉别实验室雇用实验和计算科学家们旨在直接解决这两个问题,并在此过程中提高世界各地结肠直肠癌和阑尾癌症患者的生活。
新一代测序(NGS)技术的出现带来了医学基因组时代,并与超过10万的肿瘤测序全世界现在是非常清楚,癌症是一个非常异质性疾病。像雪花一样,每个肿瘤是独一无二的。通过使用高通量功能基因组筛选CRISPR-Cas9现在我们将了解哪些这些差异是重要的,然后用这些知识来确定每个病人的最佳治疗配对描述技术(DNAseq,RNA测序,ChIPseq,RPPA)。
188bet体育网址研究焦点
- 通过组合CRISPR-CAS9屏幕在癌细胞系中系统的,多条件遗传相互作用。
- 保守合成致死相互作用的识别,网络特征和机械调查。
- 原发性患者衍生细胞系和PDX模型中的功能基因组筛选。
- 癌细胞和机器学习的分层模型预测药物反应。
- 阑尾腺癌(AA)和临床前模型中测试的分子特征来识别成药AA特定漏洞。
- 单细胞和空间分辨测序技术对肠内异质性的表征
新闻媒体
2021年8月25日
沉博士在Cancerwise故事精选“4阑尾癌的问题,回答”
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2020年1月15日
沉实验室高兴地欢迎研究生刘洋
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2019年10月1日
JP沉接收MD安德森GI孢子职业提升计划奖
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2019年8月24日
沉实验室欢迎博士后索尼克·科威特
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2019年6月20日
沉实验室欢迎Kangyu Lin,研究调查员188bet体育网址
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2019年3月1日
JP Shen获得了UT上升的明星奖
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2019年1月1日
JP沉授予美国国立卫生研究院,K22奖
正在进行的研究支188bet体育网址持
德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址
美国国立卫生研究院,K22 CA 234406-01
高通量功能基因组学指南精密肿瘤学胃肠道肿瘤
NIH,MD安德森GI孢子职业提升计划奖
亚型特异性的漏洞在大肠癌中:一个功能基因组方法
UT新星奖
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