大数据=大收益为癌症研究188bet体育网址

这些科学的“寻宝者”是MD安德森的研究人员188bet体育网址生物信息学和计算生物学部门。他们有耐心和技术来分析堆积如山的信息，并找到一个宝贵的数据静脉，这将大大有助于我们理解癌症的内部工作。他们相信，“分子谱分析”可能是开发新疗法的母体矿脉。

它们包括韩亮，博士，谁是自信的抗癌药物休止符的未来在很大程度上分子谱。这是一个技术，科学家用它来分析单个患者的肿瘤，以确定遗传特性和任何独特生物标志物。生物标志物是分子能够指示的病症或疾病的存在，并且越来越多地被用来测量身体如何响应治疗。

“通过从多种癌症类型分析数据，我们可以评估预测模型，并确定基因的改变，导致肿瘤的形成，”他说。“这不会是由只来自一个癌症类型看肿瘤数据获得的。”

伪(基因)科学和超星系团

梁还领导了一项研究古怪的假基因的努力，这是一个基因的不匹配，通常被认为没有目的，因为它失去了蛋白质编码的能力。他最近在《自然通讯》上发表的研究表明，情况并非如此。

从患者的七种癌症审查2800余个样品后，梁的结论是，在很大程度上忽略了假很可能帮助医学专家的新靶点发现新的生物标志物。这些标记将允许医生为患者个体既个性化的治疗和更好地使他们能够预测癌症的存活率。

和梁一样，Roeland Verhaak博士是生物信息学和计算生物学的助理教授基因组医学他还进行了一项大规模的研究，比较了基因在12种肿瘤亚型中的表达方式。他的团队的研究，发表在癌基因今年八月，确定了共享类似疾病的途径和基因表达8癌症“超星”。

在他的研究中，Verhaak确定了一个特别大的癌症超簇，所有这些癌症都有共同的基因突变和表达，DNA变化和细胞增殖。在这个超簇中，TP53蛋白的突变拒绝让细胞死亡，从而导致癌症生长，尽管这些细胞经历了DNA损伤。TP53通常抑制肿瘤生长。

设计数据分析

像许多MD Anderson的科学家一样，Verhaak依靠高科技手段来了解数据库中堆积如山的信息，比如癌症基因组图谱。

为了以系统、自动化的方式处理和分析如此大规模的数据，他和他的同事们开发了rna测序数据分析流水线(Pipeline for RNA-Sequencing data Analysis)，或者普拉达(PRADA)——这是Verhaak的时尚妻子建议的首字母缩写。

与它的时尚同名品牌不同，普拉达没有使用花哨的香水或异国皮革。相反，它涉及一个软件程序，从基因表达水平对遗传信息进行多方面分析，以检测只有科学家才能识别或感兴趣的项目，比如基因内融合变异和同源性评分。

该软件已被广泛使用，并成功地通过癌症基因组图谱计划，以更好地了解脑癌和肾癌。

生物信息学和计算生物学的椅子上，约翰·温斯坦，医学博士，博士，监管部门有许多部门和跨人MD安德森是合作。这包括戈登·米尔斯，医学博士，博士，主席系统生物学,劳伦拜尔斯，医学博士，助理教授胸/头颈内科肿瘤科张炜，博士，北京大学教授病理who将分子数据纳入他们改善癌症预后的工作中。一些中心，如个性化癌症治疗研究所，靶向治疗中心和Kleberg分子标记中心也在关注这一领域的研究。

温斯坦是众所周知，他在上世纪90年代的集群热图，标记过的一些作为早期推出的“后基因组时代的最常见的可视化图标”。

温斯坦在美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)担任基因组学和信息学小组负责人时，完成了一系列基于网络的生物信息学软件包，这些软件包被称为“Miner Suite”。温斯坦基于这些工作完成了这份热图。

该集群热图图形允许调查人员了解复杂的数据和今天是一个常用的生物信息学软件工具。

韦恩斯坦目前领导的小组在分子图谱方面的发现处于前沿。他的研究方法(他为此创造了术语“188bet体育网址integromic”)被描述为“部分实验，部分计算”。

温斯坦的研究小组使用超过两打的微阵列平台和其他技术来解读这被认为是导致癌症的细胞过程的纠结网络。当正确破译，这些过程可以提供用于预防和治疗令人兴奋的新选择。

前美国内政部长斯图尔特·尤德尔曾写道:“采矿就像一个搜索-摧毁任务。科学研究人员，如梁、Verhaak和Weinstein——以及他们在MD Anderson的许多同事——的工作在很大程度上是对我们基因构成本质的探索。深入研究遗传之谜，寻找新的解决方案，也许有一天会摧毁夺去我们健康的癌症。