2018年11月12日
新一代测序技术支持了乳腺癌、前列腺癌和血癌的研究188bet体育网址
作者:Clayton R. Boldt博士
安德森的载人登月计划™成立的目的是将世界级的临床医生和研究人员团队聚集在一起,以便迅速将科学发现推进到临床,拯救患者的生命。188bet体育网址驱动Moon Shots™工作的是10个188bet体育网址研究平台为项目提供独特的专业知识、技术支持和新颖的基础设施注重13疾病计划.
其中一个平台是癌症基因组学实验室(CGL),这使得moonshots的研究人员能够快速分析遗传信188bet体育网址息,尽可能多地了解病人的肿瘤。CGL的科学经理Maggi Morgan与癌症前线分享了更多关于该平台的工作以及它是如何支持登月计划团队的。
问:你能描述一下CGL和它在登月计划中的工作吗?
答:CGL平台是一个下一代测序实验室,致力于推动对癌症分子基础的深入研究。我们向临床研究人员提供数据,可能会通知188bet体育网址个性化治疗策略并有可能对癌症的检测、管理和治疗产生重大影响。
CGL为所有moonshots团队提供高质量的测序服务。新一代测序是一种可以让研究人员发现可能与癌症进展有因果关系的重要功能突变、基因188bet体育网址和途径的工具。了解肿瘤如何生长、转移和进化的分子基础是至关重要的,因为这些发现可能为早期检测、个性化治疗和改善结果提供方法。到目前为止,我们已经对13次“月球探测”中的7500多个样本进行了测序,产生了40多篇经过同行评审的论文。
问:该平台对MD安德森终结癌症的使命有何贡献?
答:利用下一代测序技术,CGL提供了一个强大的系统性突变发现工具。例如,通过对治疗前后肿瘤的DNA进行测序,研究人员希望了解癌症是如何适应治疗的,以及可能对治疗产生耐药性的。188bet体育网址我们目前正在调查这个问题乳腺癌登月™.
这就是CGL如何帮助发现驱动癌症生长和扩散的潜在分子异常。因此,我们提供了有价值的数据,可能为靶向治疗提供新的途径,最终目标是显著改善MD安德森患者的生活。
问:合作如何增强平台的影响力?
答:CGL与所有的Moon Shots和多个平台合作,包括阿波罗(自适应的以病人为导向的纵向学习和优化)和交易(转译研究加速器)。188bet体育网址虽然CGL不直接提供分析服务,但我们与生物信息学分析团队确保来自多个平台的数据得到适当利用并存储到企业大数据仓库(EBDW)中。
我们的生物信息学团队开发了先进的分析工具,挖掘序列数据并将其转化为结果,供疾病现场团队进行下游分析。此外,所有Moon Shot™数据都存储在EBDW中,成为一种对患者和研究人员都有利的机构资源。188bet体育网址
问:你最引以为傲的项目或成就是什么?
答:我直接与疾病现场PI进行互动,制定提案,然后由Moon Shot领导审查和批准;所以,我对每一个项目都有一种个人联系。也就是说,有几个项目我想强调一下。
的hpv相关癌症moonshot™是一种罕见的hpv相关癌症,治疗选择有限,特别是对于晚期疾病。该团队认为,这是对这种癌症的最大的整体外显子组分析,有可能发现多种癌症基因参与肿瘤的发展。其目标是在2019年美国临床肿瘤学会泌尿生殖肿瘤研讨会上展示结果。
的骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病有一项关于不确定潜力克隆造血(CHIP)的研究,CHIP被定义为在一个或多个白血病相关基因中发现体细胞突变的恶性前状态。该团队和其他人的研究发现,CHIP患者患血液系统恶性肿瘤的风险更高,患治疗相关髓系肿瘤(t-MNs)的风险也更高。这项工作已经由Dr。Koichi高桥和他的同事在柳叶刀肿瘤学和血液的进步.
下一步是利用这些发现来识别特别高风险的t-MNs患者,并制定一种策略来降低风险。该团队正在提出一项10000例患者的研究,以了解CHIP的患病率和预后意义。
问:你认为5年后这个平台会是什么样子?
答:我认为,在五年内,我们将把液体活检作为筛查早期癌症的标准程序,监测治疗反应,并帮助解释为什么一些癌症对治疗具有耐药性。目前,获得高质量测序数据的金标准是使用新鲜活检的肿瘤组织,冷冻或福尔马林固定。然而,这对患者来说是额外的风险和不适。有大量的研究188bet体育网址前列腺癌登月™例如,利用循环肿瘤DNA,这有可能使通过微创手段收集的全肿瘤基因组特征。
问:登月计划是如何使你的工作成为可能的?
答:CGL的独特之处在于,我们与每一个登月计划互动,这是登月计划启动时所设想的多学科团队努力的缩影。我们的工作得益于登月计划,作为回报,我们提供了高质量的科学技术基础设施,从而支持和加快了疾病现场的研究工作。188bet体育网址此外,我们的平台生成的数据将用于推进moonshot团队的工作,并促进与其他平台团队的更多合作。例如,我们与乳腺癌登月计划的合作,为治疗靶点提供了有价值的见解,他们现在正在用联合临床试验中心.