2014年6月30日
挖掘肿瘤预后的分子数据
由罗恩·吉尔摩
任何一位患者在癌症治疗期间和之后的情况如何?这是一个很难回答的问题。
而是一个被称为癌症基因组图谱可能会让我们更深入地了解为什么病人的结果会不同。
地图集,一个项目国家癌症研究所和国家人类基因组研究所188bet体育网址他正在对各种癌症的基因组变化进行分类。该项目于2005年开始,目标是在2014年底完成20至25种癌症的基因组测序和分析。这样的分析将有助于更好地了解这种疾病的基础,并将帮助科学家诊断、治疗和预防癌症。
汉梁博士。,助理教授生物信息学和计算生物学他认为,这种全面的“分子图谱”有朝一日可能有助于识别可能对某些疗法有耐药性的患者,或者指导临床医生根据每个患者独特的基因构成定制治疗策略。
梁对来自癌症基因组图谱的数据进行了多机构研究,包括来自四种癌症类型的953个样本——肺、卵巢、脑和肾。
他说,这项研究的目标是解决来自癌症基因组图谱的分子数据如何以及在多大程度上影响癌症治疗。它揭示了分子谱分析虽然仍处于婴儿期,但最终可能为癌症患者的预后带来希望。
《自然生物技术》杂志6月份网络版上发表了一篇详细介绍他的发现的文章《评估肿瘤类型中癌症基因组和蛋白质组学数据的临床效用》。
梁专注于研究中检测的四种癌症,通过评估多种肿瘤的分子数据(单独或结合患者的年龄和肿瘤分期等临床变量)来预测患者生存的可能性。然后,他开发了一个开放获取数据库,允许研究人员根据数据建立和评估癌症存活预测模型。188bet体育网址
“通过分析来自多种癌症类型的数据,我们能够评估预后模型,并识别导致肿瘤形成的基因改变,”他说。“仅从一种癌症类型的肿瘤数据中获取这一数据是不可能的。”
通过结合分子数据和临床变量,梁观察到四种癌症中的三种:肾、卵巢和肺的预后更好。然而,他警告说,还需要进一步的分析。
其他MD安德森的合作者包括:系统生物学主席Gordon Mills,医学博士;Lauren Byers,医学博士,胸头颈肿瘤医学助理教授,和John Weinstein,医学博士,博士,生物信息学和计算生物学主席。其他参与研究的机构包括贝勒医学院、波士顿的Dana-Farber癌症研究所、加州大学圣克鲁兹分校、波特兰的俄勒冈健康与科学大学、波士顿的马萨诸塞州总医院和奥斯汀的德克萨斯大学。
这项研究由美国国立卫生研究院(NIH)资助(CA143883), (CA175486), (CA016672);国家癌症研究所- md安德森癌症中心子宫孢子职业发展奖;以及由Michael & Susan Dell基金会资助的George S. Hogan遗产和Lorraine Dell生物信息学癌症药物个性化项目。