2017年4月10日
MD安德森的科学家们正在解开胆管癌的复杂性
由斯科特梅维尔称
由MD安德森研究人员领导的广泛基因组分析为探索一种罕见且致命类型的肝癌的治疗开辟了新的途径。188bet体育网址
胆管癌是一种胆管癌,治疗方法是化疗和手术。它在美国发生得更为频繁,发病率从1973年的每10万人0.44例上升到2012年的每10万人1.18例。新诊断出这种疾病的患者的中位生存时间不到一年。
由…共同领导的团队劳伦斯邝博士,助理教授转化的分子病理学,通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)对患者样本进行了整合基因组分析,确定了治疗IDH1或IDH2基因突变肿瘤的两个潜在靶点。
“针对IDH突变的药物正在进行临床研究。到目前为止,它们似乎并没有很好地发挥作用,所以我们的想法是,从这些发现的见解将允许我们设计联合疗法,更有效地治疗胆管癌。”Kwong说。
研究人员确定的潜在目标包括一个关键的代谢途径和另一个参与甲基化的途径——188bet体育网址基因的化学沉默。
“我们的实验室正在寻找idh突变肿瘤模型,并在临床前测试其中一些想法,”Kwong说。
这种转化研究,将人类肿瘤的信息带回实验188bet体育网址室实验,研究人员将获得必要的理解,以开发新的治疗方法,用于临床试验,是MD安德森针对胆管癌的新多学科努力的一个重要方面。
500000美元的礼物从珍妮特m和乔治·j .第三Ehni房地产和最初的100000美元的礼物琳达·A·布卢姆胆管癌研究基金将资助重大基础设施投资更好地研究这个疾病,包括一个集成的分子和病理学biorepository包括冷冻肿瘤样本,188bet体育网址血液和组织阵列以及与样本相关的临床信息。
Kwong说:“这将为进行额外的实验、改进肿瘤分析和开发新的胆管癌细胞系提供新的能力。”“这种癌症的细胞系很少。”
这个重要的胆道癌实验室正在建设中
通过Ignacio Wistuba,医学博士翻译分子病理学的主席说Milind Javle,医学博士胃肠肿瘤学教授。
Javle领导着胆道癌症小组,该小组包括外科医生、胃肠肿瘤学家、病理学家、放射肿瘤学家和放射诊断学家。MD安德森每年治疗400多名胆管癌患者,这是世界上最大的临床项目之一。
Kwong和他的同事分析了38个胆管癌患者的样本,这些患者没有接受过放疗或化疗,也没有乙肝、丙肝或肝吸虫(已知的胆管癌风险因素)。通过尽量减少肿瘤中已知的和潜在的分子异质性来源,研究人员希望对驱动这种疾病的其他不同因素有一个清晰的了解。188bet体育网址
他们进行了全外显子组测序、RNA测序,分析了基因拷贝数、DNA甲基化和蛋白质表达,并将结果发表在了《科学》杂志上细胞的报道.
大约20%的样本在原始样本集和另外15个样本集中有IDH1或IDH2突变。IDH突变体具有明显的mRNA、拷贝数和DNA甲基化特征。
“所有的IDH突变体都增加了线粒体基因的表达,”邝说,“而且它们的DNA发生了高甲基化。我们发现肿瘤抑制基因ARID1A被IDH突变体高甲基化和沉默。”
idh突变肿瘤中修饰染色质、基因包装和组蛋白(构成染色体并影响甲基化)的基因也低表达。
“我们认为ARID1A是线粒体和染色质基因表达之间的联系,”邝说。
该团队将在其临床前研究中研究调节甲基化的EZH2抑制剂,以及阻止氧化磷酸化的药物,氧化磷酸化是线粒体的主要代谢功能。
此外,研究人员比较了胆管癌、肝细胞癌188bet体育网址(最常见的肝癌)和胰腺肿瘤的特征。他们在肝细胞癌肿瘤和胆管癌肿瘤的一个亚群中发现了惊人的相似之处,这与一种新兴的观点相一致,即肝肿瘤包含一系列连续的分子类型。
“虽然还需要更大规模的研究来验证和识别进一步的分子亚类,但我们的结果提供了一个原则的证明,胆管癌的亚类具有独特的、多层次的分子特征,这提示了潜在的治疗方法,”Kwong和同事写道。