基因研究促进剂对某些癌症如何形成和扩散光棚
跨33癌症类型近9000个肿瘤样品检查揭示增强剂作为治疗靶标关键调节，包括PD-L1
MD安德森新闻发布2018年4月5日
在任何癌症诊断或治疗的心脏是细胞。如果认为所述细胞成分控制基因活化基因调节层的俄罗斯嵌套娃娃，那些越来越小的层内的是非编码DNA称为增强剂的短块。研究在得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学揭示增强剂作为研究用于诊断和/或治疗多种癌症一个显著区域。188bet体育网址
癌症研究人员已188bet体育网址有意促进剂，由于其转基因开启或关闭的能力。数千增强的数万可以驻留在单个细胞，但在深入了解他们的工作是如何逃避了调查。从研究，提供了有关这些电池组件显著新知识，研究结果发表在的2018年4月5日网上发行细胞。
“虽然在癌症发展的促进作用日益得到认可，超过大的患者群增强活动的全基因组的研究还没有完成，”说韩亮，博士，研究铅和副教授生物信息学和计算生物学在得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学。“我们的研究能够说明，对于第一次，增强表达‘景观’在广泛的癌症。”
在癌细胞中，调控网络往往是“重新布线”，导致癌症的发生;但是，这是如何发生的了解是有限的。梁的团队揭示增强子缺失的一块拼图，这表明，在几个关键的结论，其作为治疗目标主要监管机构，包括程序性死亡配体-1（PD-L1）的作用。
PD-L1，蛋白质是抑制免疫系统，使癌症的形成和发展，是许多现有的和新兴的免疫治疗的一个重要目标。从使用RNA测序数据癌症基因组图谱（TCGA），梁球队跨越33的癌症类型中进行的8928个肿瘤样品基因组范围的分析，并确定除了PD-L1相当数量的增强子。
这项研究是PanCancer阿特拉斯，其目的是通过检查全套通过癌症基因组图谱（TCGA），美国国家癌症研究所（NCI）的共同努力可用肿瘤回答关于癌症大首要问题和国家人类的一部分基因组研究所（188bet体育网址NHGRI）。这项研究是在总结癌症类型的数组映射关键基因组的变化并提供加速我们对癌症分子基础的认识社区资源的PanCancer Atlas和TCGA使命的几个之一。
“我们的研究在各种肿瘤中提供增强活动的系统的观点，表明概念新策略，以抑制关键治疗目标，”梁说。
该团队还演示了如何促进剂可以作为生物标志物，通过增强的检查后认为目标脾酪氨酸激酶（SYK），往往与多种类型的晚期癌症。在观察病人的生存时间，增强器被证明是预后不良的标志几种癌症类型。
根据他们的分析TCGA，梁的团队还提出了染色质模式 - “包装”周围的DNA - 可能是一个重要的贡献者，某些增强的激活过程，它提供了深入了解突变和克隆演变成某些癌症如何遗传。
“如果发生差异细胞生长的经过多代的变化在染色质组织在一个单一的肿瘤祖细胞可能造成肿瘤之间的显着区别，”梁文冲说。“染色质组织可以通过组蛋白基因突变，这是经常出现在癌症大幅改造。”
The team’s observation of enhancers’ unique abilities to be both “on” and “off” switches throughout the cancer genome provided new data about tumor clonal evolution – the step-by-step cellular process by which cancer forms, and revealed a number of enhancers associated with genes tied to cancer. Liang adds that further efforts are required to investigate the potential of enhancers in clinical applications.
MD安德森研究小组成员包括汉宸，博士;春燕李，博士;鑫鑫鹏博士;志成周，博士;和约翰·温斯坦，医学博士，博士，一切生物信息学和计算生物学系。这项研究是TCGA计划，美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所的联合努力的一部分。188bet体育网址
资金来自美国国立卫生研究院（CA175486，CA209851和CA016672）和得克萨斯州的肿瘤防治研究所（RP140462）。188bet体育网址