相同的癌症，不同的时区
MD安德森新闻发布2014年7月30日
发现肿瘤生长中分子钟的作用可能会影响乳腺癌治疗
MD安德森新闻发布07/30/14
正如没有两个人拥有相同的遗传妆容，最近的一项研究表明，乳腺癌患者中没有两个单一肿瘤细胞具有相同的基因组。
事实上，根据肿瘤细胞的不同，它们根据休斯顿大学遗传学系的助理教授，博士教授的一项研究，它们的速度急剧不同。研究结果可能对乳腺癌的诊断和治疗具有重要意义。该研究还188bet体育网址可以协助努力打击乳腺癌患者中抗性化疗的发展。
Navin的研究结果出现在本周的自然问题中，并在肿瘤内的理解中添加了“基因组多样性”。乳腺肿瘤的大型测序研究已经确定了许多普遍的突变，但为多样性提供了有限的洞察力。Navin的团队开发了一种名为NUC-SEQ的新测序方法，揭示了乳腺癌的不同亚型呈现各种肿瘤多样性。
纳林说：“我们发现两个不同的”分子钟“在不同阶段运行，纳文文。“来自三阴性乳腺癌的肿瘤细胞具有增加的突变率，而来自雌激素受体阳性（ER +）乳腺癌的肿瘤细胞没有。”
大约75％的乳腺癌是ER +，并响应激素雌激素而生长。它们通常用激素治疗治疗。三重阴性乳腺癌占所有乳腺癌的15％至25％，并且通常对激素治疗或标准化疗不响应良好。
Navin的团队作为单细胞基因组测序方法开发NUC-SEC，并应用其研究乳腺癌两种类型的细胞突变。结合单细胞分子测序，它们能够概述数千个细胞。
“单细胞基因组学领域的常见问题是无法验证在各个细胞中检测到的突变，”遗传学部的博士后研究员，遗传学博士生和第一次作者进行了研究。“为了解决这个问题，我们将单细胞测序与靶向单分子深度测序合并。这种方法不仅验证突变，还可以测量成千上万的细胞的精确突变频率。“
化疗领域的一个重要问题是在肿瘤中稀有细胞中是否存在预先存在的抗性突变，或者如果它们响应于治疗而自发地出现。
虽然在细菌的几十年中已经研究了这个问题，但在大多数人类癌症中仍然明显差不多，“纳文林说。“我们的数据表明，在化疗之前，可能在肿瘤中预先存在大量不同的突变。因此，我们预计测量基因组多样性将具有预后价值，以确定哪些患者会产生对化疗的抵抗力。“
该研究还表明，基因组多样性也可能具有用于预测肿瘤侵袭，转移和患者存活差的有用的临床应用。
研究中的合作者包括FugoA Mer-Bernstam，M.D.，Investigational Cancer Therapeuts系;韩亮，博士，助理教授，生物信息学和计算生物学;asha multani，博士学位，助理教授，遗传系;Paul Scheet，Ph.D.，流行病学系副教授;Ken Chen，Ph.D.，生物信息学和计算生物学系教授;和王王，博士学位，博士生，遗传学系。
该研究的资金包括国家卫生研究院（R21CA174397-01; TR000371; RO1CA172652; U24CA143883）;国家癌症研究所（1R01CA169244-01; R01CA172652; CA016672; U54CA143798）;Nadia的礼品基金会Damon Runyon-Rachleff Innovator（DRR-25-13）;T.C.Hsu和Alice-Reynolds Kleberg基金会;遗传学和基因组学中心;苏珊G. Komen为治愈;戴尔基金会;和德克萨斯州癌症预防研究所。188bet体育网址