188bet体育网址研究人员揭示个人肺肿瘤基因组多样性

研究结果表明测序局部肿瘤的单个区域将确定驱动突变


MD安德森新闻发布14年10月9日

在局部肺癌已知癌症驱动基因组畸变显得那么始终存在跨肿瘤的肿瘤的一个区域的单个活检是可能识别其中大部分,根据今天在Science上发表的论文。

由得克萨斯大学MD安德森癌症中心大学的科学家领导的研究涉及的科学家称之为基因组异质性,许多不同的变化是驱动肿瘤形成,生长和发展,并有可能复杂化的选择和治疗的潜在功效存在的挑战。

在2012肾细胞癌的一个具有里程碑意义的研究发现,大多数促癌的变化并没有跨越这些肿瘤的所有区域存在,因此单个区域的活检不能提供癌症基因在任何给定的肿瘤的发生很重要的一个很好的代表。

“从我们的肺癌研究中的一个重要的一点是,肿瘤的异质将一种类型的癌症和其他之间变化。我们在肺腺癌中发现的模式是比肾细胞癌完全不同,说:”研究的第一作者张建军张,医学博士,博士讲师基因组医学。

研究人员188bet体育网址从11个手术切除局部肺腺癌进行全基因组测序对48个肿瘤区域,的癌症形式中的上皮组织的所有行肺。手术对于这些非小细胞肺癌是潜在固化剂。

他们确定了7269个突变,发现平均76%的突变,21个已知癌症基因突变中有20个在同一肿瘤的所有区域发现。

“这表明,单一的活检,在适当的深度测序,可能被证明是关于这组肺癌中已知的癌症基因的突变非常丰富,”论文的资深作者安德鲁Futreal,博士,基因医学和教授说:罗伯特A.韦尔奇的持有人所优秀的大学讲座教授化学在MD安德森。

可能与复发有关
肿瘤内的基因组异质性可以描述为树状结构。主干代表肿瘤所有区域的突变,分支代表仅在某些区域发现的突变,较小或“私有”分支代表仅在一个区域发现的变异。

树干突变,如20癌基因突变,研究人员在整个肺肿瘤的所有区域发现,较早出现,与后来发生的比在树干分支突变。188bet体育网址

在中位随访21个月,三复发11例患者了。所有这三个有分支的突变,40%,只限于少数或肿瘤的甚至一个区域的比例较大,相比这种突变的只有17%在那些谁不复发发现。

张和Futreal警告说,这些数字都太小,从得出结论;还需要更多的研究证实复发,这些分支突变的负担之间的关系。

“如果相关,这意味着这些分支突变的某些方面可能复发,要么被某种肿瘤的生物学方面的代理,我们还不认识或有突变发生以后,传授更激进的特征,或两者的某种组合,“Futreal说。

张说,该团队正在开展一项针对早期肺腺癌的更大规模的研究,以研究分支突变与术后复发之间的关系。研究结果将有助于对复发风险较高的患者进行分层,并允许进行手术后药物治疗的临床试验以防止复发。早期肺癌的标准治疗是单纯的手术,有30%到50%的复发率。

《科学》杂志还将发表一篇由英国癌症研究中心的科学家领导的得出同样结论的论文。188bet体育网址在2012年来到MD安德森之前,福特拉尔曾在维康基金会桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)的癌症基因组项目工作。Futreal和他的长期同事,英国癌症研究所的医学博士、博士Charles Swanton领导了2012年的肾细胞癌研究,研究结果发表在《新英188bet体育网址格兰医学杂志》上。

共同作者与Futreal,张和项目共同负责人伊格纳西奥Wistuba,医学博士,教授和转化分子病理学的椅子是藤本淳弥博士和智婉周还的平移分子病理学;Jianhua Zhang, Ph.D., Xingzhi Song, Ph.D., Sahil Seth, Harshad Mahadeshwar, Alexei Protopopov, Ph.D., Huandon Sun, and Jiabin Tang, Ph.D., of MD Anderson’s Institute for Applied Cancer Science; Yu Cao, Curtis Gumbs, and Latasha Little of Genomic Medicine; Kathryn Gold, M.D., William William, M.D., John Heymach, M.D., Ph.D., and Waun Ki Hong, M.D., of Thoracic/Head and Neck Medical Oncology; Stephen Swisher, M.D., of Thoracic and Cardiovascular Surgery; J. Jack Lee, Ph.D., of Biostatistics, Jiexin Zhang of Bioinformatics and Computational Biology; Neda Khalor, M.D., and Cesar Moran, M.D., of Pathology; Xifeng Wu and Yuanquing Ye of Epidemiology; and David Wedge, Ph.D., of the Cancer Genome Project, Wellcome Trust Sanger Institute, U.K.

这项研究是188bet体育网址由来自德克萨斯的癌症预防研究所资助,德州大学系统明星奖,美国国防部,a . Lavoy摩尔养老基金,韦尔奇基金会和国家癌症研究所资助的美国国立卫生研究院包括肺癌专业卓越计划的研究(P50CA70907)共享的德克萨斯大学西南医学中心和MD安德森,MD Anderson的NCI癌症中心资助基金(CA016672)和NIH的T32学术肿瘤学医学研究培训(CA009666)。188bet体育网址