伪原可以提供更明确的对生物标志物的理解
MD Anderson新闻发布2014年7月07日
MD安德森新闻发布07/07/14
唉,毫无疑问的伪歌曲。
功能失调,不受欢迎,似乎很少使用,这些贫困的基因亲属都失去了蛋白质编码能力。它们含有物质对生物体的生存不是必不可少的,并且是用于去除基因组废物的“最后停止”。
不再。伪合金的日子可能已经到达休斯顿德克萨斯州长安德森癌症中心大学的科学家。
汉良,博士,癌症中心生物信息学系和计算生物学系的助理教授正在推进这些大幅忽视但越来越有吸引力的遗传奇怪的知识。他和他的团队完成了一项研究,即在代表七种癌症类型的2,808名患者样本中产生假基因表达谱。这意味着分析3780亿RNA序列,测量接近10,000个假置的表达水平。
结果表明,假基因表达分析科学可能很好地发挥关键作用,在解释癌症如何通过帮助医学专家发现新的生物标志物。该研究的研究结果显示在今天的自然通信问题中。
对生物标志物的理解对于靶向特异性肿瘤部位的疗法以及对患者的含量有关各种癌症和治疗的新洞察力来说都很重要。生物标志物是可以表明存在病情或疾病的分子,并且越来越多地用于测量身体如何应对疗法。基于生物标志物的患者的定制治疗,建立了个性化药物的新兴领域。
梁的学习是新颖的,因为对伪原的理解依赖于分析大量患者样品。以前的研究受到患者样品组的大小的限制。梁的团队分析了癌症基因组阿特拉斯研究计划提供的数据。188bet体育网址该计划得到国家癌症研究所和国家人类基因组研究所在国家健康机构中的支持,并正在寻找20多种不同类型癌症的基因组变化。188bet体育网址
“该研究调查了七种癌症亚型,包括乳腺癌,肾,卵巢,结直肠癌,肺和子宫的亚型亚型。”“穿过癌症类型,假基因表达揭示的肿瘤亚型显示出与其他分子数据定义的亚型的广泛且强的相似性。”
梁认为,该研究突出了伪影蛋白表达分析作为一种新的“黄金标准”,用于研究癌症机制并发现预后生物标志物。这些生物标志物将允许医学专家更准确地预测癌症生存率。
“单独伪表达可以准确地分类子宫内膜癌的主要亚型,”梁说。“令人惊讶的是,在肾癌中,假基因表达亚型不仅与患者存活率显着相关,而且还可以帮助分层与临床变量组合的患者。”
其他合作机构包括贝勒医学院,德克萨斯大学德克萨斯州立大学公共卫生学院休斯顿。
该研究由国家卫生研究院(NIH)(CA143883,CA016672),NIH / MD Anderson子宫孢子职业发展奖,以及迈克尔和苏珊戴尔基金会资助的癌症医学的个性化洛林戴尔计划。