胰腺癌液体活检从肿瘤基因的血源性分组流
MD安德森新闻发布2015年12月17日
MD安德森科学家在从外来体的肿瘤完全基因组的下一代分析
MD安德森新闻发布2015年12月17日
胰腺癌肿瘤波及它们的分子秘密进入血液，脱落的完整DNA和RNA包裹在里面保护的脂质颗粒，使它们成熟与液体活检分析，研究人员在得克萨斯大学MD安德森癌症中心大学的报告到网上188bet体育网址肿瘤学年报。
球队在使用DNA三个病人进行的全基因组，肿瘤的整个外显子组和基因表达分析和RNA中发现的内部的外来体在它们的血液或其它液体生物样品中循环。
“外来体DNA分析和RNA可以让我们做一切可以做掉肿瘤组织活检直接说，”资深作者Anirban迈特拉，M.B.B.S，教授病理和MD安德森的谢赫·艾哈迈德·本·扎耶德·阿勒纳哈扬中心胰腺癌研究室主任。188bet体育网址
这项研究188bet体育网址是在MD安德森的进行登月计划加快从科学知识的临床和预防的进步发展。迈特拉是的共同领导者胰腺癌登月在程序12中的一个。
原理研究的证据打开大门，在多种肿瘤类型的可以用来判断预后，指导靶向治疗和监测治疗液体活检的验证研究。
会议胰腺穿刺活检的挑战
迈特拉和他的同事检测了各种癌症衍生的生物标记物，包括基因突变，插入，删除，拷贝数概况和基因融合，可以作为新抗原作用的 - 新靶点免疫系统。潜在可治疗的突变，包括BRCA2和NOTCH1，进行鉴定。
“全面的液体活检能满足深在身体特征胰腺癌等癌症的主要挑战之一，”迈特拉说。“这些肿瘤很难接入，即使使用针或穿刺活检，所以获得足够的组织，使全新一代测序是困难的。”
正在开发中主要依靠无细胞DNA的其他液体活检发现在血液中循环。血液中的未受保护的DNA通过酶切碎，使无细胞DNA允许一些基因组分析，所述迈特拉，但不是全基因组或整个外显子测序。
无细胞的RNA更容易在血液中被破坏。外来体是保护DNA和RNA货物从内部破坏，保持高质量的样品膜球。
分析基因表达
“全RNA测序是重要的，因为基因组测序告诉你被改变了什么基因，而RNA的分析告诉你实际上正在表达什么异常基因，”他说。“大棚外来体允许我们在分辨率，不适合用无细胞的方法同时做匹配的DNA和RNA的液体活检。”
现在常见的临床实践要求在演示文稿中深部肿瘤只有一个预处理活检。在治疗过程中进行活检会更密切地监测治疗的成功或失败，并帮助研究人员更好地了解治疗反应的癌症基因组的演进方式。188bet体育网址
“肿瘤治疗过程中不断发展。新变化，新途径，新的基因突变出现，”迈特拉说。纳税人通常不包括多点活检。“现在你可以绕过需要组织，并从血液小瓶的全基因组图谱外显子组和转录组，”迈特拉说。
外来体可能实际上描绘出肿瘤的基因组多样性的更完整的画面，因为所有的基因突变存在于原发性和转移性肿瘤会流入通过外来体的液体活检，研究人员指出。188bet体育网址采样肿瘤的某些部分可能只能捕捉到在这一领域的突变，并不能反映其整体基因组多样性。
外来体是从血液样本中的两个病人，也从胸腔积液的患者谁了肺转移隔离。全基因组测序覆盖了人类基因组的91％，而仅有的蛋白质编码基因的外显子测序覆盖95％至99％。
验证更大的样本，多种癌症中
合着者伊格纳西奥Wistuba，医学博士，主席平移分子病理学，与迈特拉和MD安德森其他研究人员合作开发的分析来捕捉外来体和验证在其他“内脏”的办法（深部）的癌症。
迈特拉和Wistuba计划与其他癌症登月开始工作，以开发用于institutionwide临床质量的液体活检的最终目标。
“我们将在更大的人群队列研究验证，并与患者的预后相关我们的调查结果，” Wistuba说。“没有临床应用的是，我们在发展的早期，但它是非常令人兴奋。”
迈特拉持有谢赫哈利法·本·扎耶德·阿勒纳哈扬杰出的大学主席。肿瘤学年鉴是欧洲肿瘤医学学会的官方出版物。
共同作者与迈特拉和Wistuba是共同第一作者弗朗西斯·圣·卢卡斯博士，平移分子病理学的;开尔文Allenson，医学博士，肿瘤外科;和Vincent伯纳德，病理，谁也积极参与生物科学，由MD安德森和休斯顿得克萨斯大学健康科学中心大学共同运营的得克萨斯大学研究生院的研究生;赫克托·阿尔瓦雷斯，医学博士，博士，谁是液体活检平台，在胰腺癌研究中心和出版的共同资深作者的科学管理。188bet体育网址其他共同作者包括乔纳森·卡斯蒂略，博士，董金，医学博士，病理检查的克里斯汀·埃利斯;东辉李，博士，罗伯特·沃尔夫，医学博士，和高利Varadhachary，医学博士，M.B.B.S，胃肠道肿瘤内科的;马修·卡茨，肿瘤外科医学博士的，和Eric Ehli，博士，加雷斯·戴维斯博士和杰森·彼得森博士，AVERA研究所人类遗传学，苏福尔斯，S.D.的
This research was funded by MD Anderson’s Pancreatic Cancer Moon Shot, the Sheikh Ahmed Pancreatic Cancer Research Center, grants from the National Cancer Institute of the National Institutes of Health (5T32CA009599-27, R01CA113669, U01CA196403, U01DK108328, P30CA016672), MD Anderson’s NCI Cancer Center Support Grant (CA16672) for the High Resolution Electron Microscopy Facility, the Translational Molecular Pathology Fellowship at MD Anderson; and the Cancer Prevention and Research Institute of Texas.