新平台优化组合癌症治疗
生物信息学方法预测结合临床前和临床研究结果改善
MD安德森新闻稿2022年4月12日
抽象性 :LB119
188bet体育网址得克萨斯大学研究员MDAnderson癌症中心开发出一个新的生物信息平台,预测以共生肿瘤变换为基础对一组病人最优处理组合回溯验证研究工具选择组合提高临床前和临床研究的患者结果
研究结果今天提交188bet体育网址美国癌症研究协会2022年度会议由主调查员Anil Kordut博士助理教授生物信息学计算生物.研究结果今天还发布癌症发现.
平台调用变换特征分解组合处理整合机器学习和癌症信息学算法分析生物肿瘤特征-包括基因变异、拷贝数变换、基因表达式和蛋白表达式异常-并识别多药可能针对的频繁共生变换
Kordut表示:「我们的最终目标是提高精密肿瘤效果并创造有意义的病人福利帮助发现并选择与肿瘤分子组成相匹配的组合法 来克服当前领域某些挑战的工具
定点疗法改善许多癌症患者的临床结果,但单例治疗对单目标往往导致抗治癌症细胞常依赖并发变换,如两条信号路径变换驱动肿瘤演化越来越多的证据表明,同时识别和锁定两种变换可增加持久响应,Kordut解释
188bet体育网址由Korkut和博士后同僚Subin Li博士设计并使用ReFLECT工具开发系统公正方法以匹配病人最优组合法
使用ReFlecect分析全卡数据集MDAnderson并公开提供源码,包括预处理病人肿瘤样本、细胞线和从病人衍生染色色体(PDXs),代表10,000多病人和33种癌症类型产生201个病人群,每个组由单可作用生物标志定义,如单作用生物标志EGFR变异或PD-L1过分表达
团队生成相容修改签名 可能可操作治疗目标 指向子分组188bet体育网址在所有组别中,研究人员共识别2 166组合,至少有1个经食品药管局批准的代理匹配共生变换归根结底,45%的初步分析所包括的病人与至少一种组合理疗相匹配
188bet体育网址研究人员通过回溯分析公开前科和临床研究验证ReFlecte方法,比较这些试验中使用与REFlecte匹配组合与工具不匹配组合
PDX模型前临床试验中,REFLECT匹配组合肿瘤中值下降34.5%,非匹配组合增加5.1%。类似地,免步生存率高与匹配组合188bet体育网址研究人员还展示了REFLECT组合比对用最高单代理模型定义的其他人高协同评分
188bet体育网址研究者们还回溯验证临床环境方法,通过I-PREDICT测试可用数据验证,I-PREDICT测试评价多种不同类型癌症复方法实验中的病人接受REFLECT预测最有益组合比其他组合长得多PFS和总体生存
在这次研究中,团队还开发出详细相容变换地图,与特定免疫特征并存地图显示许多常见变换常伴有免疫法响应标志,例如脱氧核糖核酸修复缺陷和特定子元调控器水平变化研究结果显示,应进一步研究以这些路径为对象的疗法,作为改进的选项免疫理疗响应
iflicte概念尚需额外验证, 我们期望大好机会将工作化为实学福利,未来预处理病人样本多组化剖面图可加载REPLECT管道生成共变签名,允许医生考虑精密组合法以适应这些病人的分子剖面图
未来,这一方法将获益于改善信息学资源,以更好地匹配RNA和蛋白质层次的改变-Kordut解释188bet体育网址研究者还计划扩展研究范围,以更好地解决并预测匹配毒品组合的毒性最后,未来研究还力求解决肿瘤内部的巨大异质性问题,这可能影响对定向疗法的响应
188bet体育网址国家卫生研究所/国家癌症研究所支持研究(P30CA016672、U01CA253472-01A1、5UL1TR003167-02、7R01CA206025-06)、Overian癌症研究联盟协作研究奖、癌症信息学创新基金、得克萨斯癌症预防和研究所(RP170640)MD安德森染色癌症月球射击®国防部(W81WH-18-0678)、网络生物资源局和国家普通医学学院(GM103504)
除Kordut和Li外MDAnderson高中延博士D.D.博士和Behnaz Bozorgui博士D.所有生物信息学计算生物学Parisa Imanirad系统生物博士David Menter博士和Scott Kopetz博士帕特里克GPilieMD切片医学肿瘤TimothyYap研究癌症解析学博士协作作者包括:Elisabeth Dowling博士,休士顿赖斯大学Jacob Elnaggar,路易斯安那州立大学健康科学中心新奥尔良AugustinLuna博士,波士顿Dana-Farber癌症学院Chris Sander 波士顿Dana-Farber癌症学院和哈佛医学院完整披露列表随整页查找来.