新癌症模型显示基因早期和浸润性乳腺癌类型之间的联系
开发新的单细胞测序工具提供了访问难以探测单元数据
MD安德森新闻发布2018年1月04,
新会联想模型可以解释常见的早期乳腺癌称为导管原位癌(DCIS)发展更具有攻击性的形式的癌症研究人员说188bet体育网址德克萨斯大学MD安德森癌症中心。
这项研究提供了新的见解如何DCIS导致浸润性导管癌(IDC),并提供一个更清晰的理解这些癌症的一些未被发现的原因。研究结果发表在1月4日在线出版的细胞。发现是由研究人员开发新的分析工具,称为地形单细胞测序(tsc)。188bet体育网址
“虽然DCIS是最常见的早期乳腺癌,常发现在乳房x光检查,10到30%的这种类型的癌症进展IDC”说尼古拉斯·纳文博士。副教授遗传学。“DCIS是如何入侵发生基因仍然了解甚少的由于一些技术挑战组织分析。”
问题在于肿瘤本身,往往个人遗传特征的细胞,称为intratumor异质性。他们独特的细胞化妆可以使治疗更加困难,而较低的肿瘤细胞数量母乳导管使细胞更难发现由于其稀缺性。
纳文的研究小组发现,基因组进化发生在前导管癌克隆可以传播“突破”的薄层组织称为基底膜。他们发现多个从导管癌细胞克隆co-migrate到邻近地区形成侵入性肿瘤。
以前的单细胞DNA测序方法已成为强大的工具为理解intratumor异质性,但他们删除个人信息在组织内肿瘤细胞的精确位置。细胞空间数据是至关重要的,了解肿瘤细胞是否DCIS IDC。tsc更准确的度量和描述特定的单个肿瘤细胞的特征。
“因为tsc提供空间信息单元位置,它代表一个里程碑在先前的方法,只能使用悬浮的细胞,因此失去了所有的空间信息,”纳文表示。“我们假设入侵细胞有着直接的基因家族与一个或多个导管单个细胞,”他说。“我们的数据显示之间的直接基因谱系DCIS和IDC,进一步显示,大多数突变和DNA拷贝数畸变导管内的进化,入侵之前。”
到达这些发现,纳文的研究小组利用外显子组测序和应用tsc - 1293单个细胞从10 DCIS和IDC患者。
“tsc和其他类似的单细胞测序方法蕴含着巨大的潜力开辟新途径的调查早期癌症,”纳文表示。“我们希望这种类型的研究将揭示神秘的问题为什么有些癌症3不进步而其他人变得入侵。”
研究小组的参与者包括安娜Casasent Aislyn Schalck, Ruli高,博士,Emi Sei,博士,Annalyssa长和威廉Pangburn,所有的遗传学部门;生物信息学和计算生物学的Tod Casasent部门;基础Meric-Bernstam,医学博士肿瘤外科学系;和玛丽Edgerton,医学博士博士,病理学系。
这项研究是由莱夫科夫斯基家族基金会,美国国家癌症研究所(1 r01ca169244-01 CA016672);美国癌症协会(129098 -显示- 16 - 092 - 01 - tbg);和Chan-Zuckerberg倡议(hca - a - 1704 - 01668)。