转移性胃癌的单细胞分析发现与患者结果相关的不同肿瘤细胞群
MD Anderson研188bet体育网址究人员基于调查结果开发了新的预后基因签名
MD安德森新闻发布于2021年1月4日
188bet体育网址德克萨斯大学的研究人员MD安德森癌症中心从腹膜癌症(PC),一种特定形式的转移患者中患有超过45,000名单个细胞胃癌,定义了广泛的细胞异质性,并确定了与患者存活相关的两个不同的亚型。
根据他们的调查结果,今天发布自然医学,研究人员开188bet体育网址发并验证了一种基因表达特征,其能够比其他临床特征更好地预测患者存活。如果在预期研究中验证,该工具可用于分层胃癌患者,并指导它们以获得更有效的治疗策略。
“为了更好地治疗PC患者,首先必须了解腹膜腔中的转移细胞群,”联合通讯作者Linghua Wang,M.D.,Ph.D.,助理教授基因组医学。“这是对迄今为止执行这些细胞的最详细分析。这是单细胞分析的力量 - 我们能够查看每一个单元格并获得景观的照片。“
腹膜癌症是癌细胞浸润并侵入腹膜,腹腔,粘附在胃等器官上的病症。这可能发生在其他胃肠道癌症中,但在晚期胃癌患者中最常见的是,大约45%的患者在某些时候被诊断为PC。该病症导致腹腔内的显着流体积聚,患者的总生存率少于六个月。
“PC代表了一个主要的未满足临床需求,因为我们没有对这些患者提供有效的治疗选择,”联合通讯社Jaffer Ajani,M.D.,教授胃肠治疗肿瘤学。“基于我们的研究结果,我们需要向每位患者进行分析这些细胞,以便提供更量身定制的治疗方案。”
对于本研究,研究人员从20例晚期胃癌中收188bet体育网址集的腹水液中分离PC细胞。十个患者是长期幸存者在PC诊断后幸存下来一年多,10名患者是短期幸存者,在PC诊断后不到六个月才幸存下来。
在进行单细胞RNA测序以分析基因表达后,研究人员能够构建PC细胞的第一“地图”,其描述了存在的各种细胞类型及其功能状态。188bet体育网址存在于肿瘤内的癌细胞的可变性称为细胞内异质性,并且可以导致治疗衰竭,并且作为癌细胞的不同亚型的复发会与给定的治疗不同。
基因表达信息还使研究人员能够确定PC细胞的起源,称为肿瘤细胞谱系。188bet体育网址他们发现,虽然这些是胃癌细胞,但有些似乎源自胃的细胞,而其他人则更像肠的细胞。
“兴趣方面是,通过基于谱系组合物对肿瘤细胞进行分类,我们注意到两组患者,”王说。“更胃状的PC细胞具有激进的表型并且与较短的存活相关。然而,肠状物的PC细胞越来越富侵略性,患者的存活率较长。“
基于这些调查结果,研究人员开发了一种基因签名,其比各种临床188bet体育网址特征更强地预测患者存活。他们验证了患有晚期胃癌和PC患者的第二次患者的签名,并进行了四种大型局部胃癌队列,总共超过1,300名患者。
展望未来,研究人员希望验证前瞻性研究中188bet体育网址的签名,并在更多患者中进行PC细胞进行进一步分析,以鉴定肿瘤细胞谱系可塑性和新治疗靶标的调节机制,这些靶标可以被利用,为患者提供更好的治疗选择。
“这是更好地理解这些癌细胞的单细胞生物学的重要第一步,但我们有更多的工作要做,”Ajani说。“我们预见到了解这一异质性,可以使用一天用于指导对每位患者最有利的临床决策。”
该研究得188bet体育网址到了支持MD安德森, the Andrew Sabin Family Fellowship, the U.S. Department of Defense (CA150334, CA162445, CA160433, CA170906), the National Institutes of Health (S10OD024977-01, CA016672), the Schecter Private Foundation, the River Creek Foundation, the friends and family of Mr. Kevin A. Frankel, the Arthur B. & Marion Myers Trust Fund For Cancer Research, the Scott Petty Foundation, the Stupid Strong Charitable Foundation, the V Foundation For Cancer Research, The Ronnie James Dio Stand Up and Shout Cancer Fund, Mrs. Donna M. Milrod, the friends and family of Mr. Delmer W. Dallas, Mrs. Muna Ibrahim M. Al-Mousa and Dr. Abdul Aziz Sultan, the Park Foundation, the Carlos H. Cantu Family Foundation, and generous support from the Caporella, Smith, Frazier, Oaks, Vanstekelenburg, Planjery, McNeil and Hyland families.
除了王和阿贾尼,合作MD安德森作者包括:王平王,博士,明浩唐,博士,广州汉,博士,邵君张,博士,大鹏浩,博士,双蒂赵,博士。,元鑫王,兴智歌,博士,艳朔楚,博士,剑华张,博士。和安迪Futreal,Ph.D.,所有基因组医学;Kazuto Harada, M.D., Ph.D., Melissa Pool Pizzi, Meina Zhao, Ph.D., Ghia Tatlonghari, Mariela Blum Murphy, M.D., Namita Shanbhag, Ahmed Adel Fouad Abdelhakeem, M.D., and Shumei Song, M.D., Ph.D., all of Gastrointestinal Medical Oncology; Fang Wang, Ph.D., of Bioinformatics and Computational Biology; Yang Lu, M.D., Ph.D., of Nuclear Medicine; Brian D. Badgwell, M.D., of Surgical Oncology; Jeannelyn S. Estrella, M.D., and Sinchita Roy-Chowdhuri, MBBS, Ph.D., both of Pathology; Guang Peng, Ph.D., and Samir Hanash, M.D., Ph.D., both of Clinical Cancer Prevention; George A. Calin, M.D., Ph.D., of Experimental Therapeutics; and Alexander J. Lazar, M.D., Ph.D., of Pathology and Translational Molecular Pathology. Also collaborating on the study was Mingyao Li, University of Pennsylvania School of Medicine, Philadelphia, PA. All authors declare no conflicts of interest.