第一个用于检测单个癌细胞DNA突变的计算机程序被开发出来

发现可能有应用癌症诊断和治疗，个性化医疗

MD安德森新闻发布2016年4月18日

188bet体育网址在研究人员得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学已经宣布了一种检测单个癌细胞DNA突变的新方法，与目前分析数百万个细胞的技术相比，他们认为这种技术可能在癌症诊断和治疗方面有重要应用。研究结果发表在4月18日的网络版上自然方法。

现有技术中，被称为下一代测序（NGS），基因组的措施从百万细胞与单细胞测序较新的方法，称为Monovar的衍生。由MD安德森研究人员开发，Monovar允许科学家188bet体育网址研究从多个单细胞数据。这项研究是，部分由MD安德森的登月计划，一个前所未有的努力，以减少显著从癌症死亡的资助。

“NGS技术已大大提高了我们对人类基因组的认识及其在癌症等疾病的变化，”说肯Chen博士。，生物信息学和计算生物学与自然方法的文章的共同作者的助理教授。“不过，因为NGS测量大量的细胞，组织样品内的基因组变化往往掩盖”。

这导致了称为单细胞测序(SCS)的新技术的发展，该技术在许多生物学领域产生了重大影响，包括癌症研究、神经生物学、微生物学和免疫学，并极大地提高了对癌症中某些肿瘤特征的理解。188bet体育网址Monovar通过更准确地检测被称为单核苷酸变异(SNVs)的DNA构成的微小变化，进一步改进了科学家们发现的“缺乏”的新型SCS的计算工具。

“为了改善SCS数据集中的snv，我们开发了Monovar，”他说尼古拉斯·纳文博士他是遗传学助理教授，也是论文的合著者。“Monovar是一种新的统计方法，能够利用来自多个单细胞的数据来发现snv，并提供非常详细的遗传数据。”

陈纳文状态Monovar将在癌症诊断和治疗显著翻译应用程序，个性化医疗和产前基因诊断，其中个SNV的精确检测病人护理的关键。

现有技术的这种结构设计可以很好地提高研究的不仅仅是癌症等许多生物医学领域。研究人员188bet体育网址认为这是在SCS数据集评估个SNV的重大进步 - 对多种疾病的重要信息。

“近年来，随着南海方法创新来分析数以千计的单细胞与RNA分析并行不久将扩展到DNA的分析，需要准确的DNA变异的检测将继续增长，”陈先生说。“Monovar能够分析大型数据集和处理不同的全基因组的协议，因此它非常适合于多种类型的研究。

其他研究团队188bet体育网址成员包括王勇博士，遗传学，Hamim Zafar博士和Luay Nakhleh博士，莱斯大学，休斯顿。

研究由一个MD安德森登月知识差距奖,美国国立卫生研究院(CA016672和R21CA174397),美国国家癌症研究所(RO1 CA172652和RO1CA169244-01),安德鲁萨宾家庭联谊,莱夫科夫斯基家族基金会,Bosarge家族基金会,H.A.和玛丽k·查普曼慈善基金会,迈克尔和苏珊·戴尔基金会,一个安捷伦大学授予的关系。