乳腺癌和妇科癌症的研究结果可能具有未来临床应用的潜力

在对近2600例妇科和乳腺肿瘤的泛癌分析中，发现了5种先前未知的亚型

MD安德森新闻发布2018年4月5日

188bet体育网址研究人员得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学已发现的约肿瘤的分子特征基于从乳腺肿瘤2,579和四种不同类型的妇科癌症的综合分析和鉴定先前未知的癌症亚型的新信息令人吃惊的量。这些新的发现可能会为今后治疗研究的跳板。

从多体制努力为首结果热汗Akbani博士，副教授生物信息学和计算生物学发表在本周的癌细胞。

这项研究是PanCancer阿特拉斯，其目的是通过检查全套通过癌症基因组图谱（TCGA），美国国家癌症研究所（NCI）的共同努力可用肿瘤回答关于癌症大首要问题和国家人类的一部分基因组研究所（188bet体育网址NHGRI）。这项研究是在总结癌症类型的数组映射关键基因组的变化并提供加速我们对癌症分子基础的认识社区资源的PanCancer Atlas和TCGA使命的几个之一。

“我们的目标是，以确定共享和独特的分子特征，临床显著亚型和潜在的治疗靶点，” Akbani说。“我们先前证实在五个乳腺和妇科肿瘤类型确定的相似性和耐人寻味的发现在这些疾病的先前的研究没有发现分子的关系。许多的意见有可能影响预后和/或治疗的相关性，虽然这项研究照亮任何临床的可能性将需要大量额外的研究，他们将准备用于实际应用之前“。188bet体育网址

该研究的主要成果包括：

  • 采用16个键的分子特征，团队确定了五个预后癌症亚型和发展的决定“树”是患者分成基于六亚型特点在临床实验室评估的。
  • 识别其它亚型高白细胞数量，提高潜在影响在未来免疫治疗。
  • 发现显著雌激素受体调节的长的非编码RNA（lncRNAs）和基因和lncRNAs之间的相互作用“网络”的存在。
  • 观察许多遗传畸变，包括61体细胞拷贝数改变（的SCNA）和46个显著突变基因（冲锋枪）。十一的SCNA和冲锋枪的每五个类型肿瘤的早期TCGA的研究还没有确定。

Akbani说:“这项研究提供了一个广泛的，对妇科和乳腺癌分子特征进行策划的地图集，我们相信在未来的许多年里，它将成为该领域研究人员有用的一个起点。”188bet体育网址

John Weinstein, M.D., Ph.D., chair of Bioinformatics & Computational Biology, and a member of the research team added that “the study complements other integrative TCGA Pan-Cancer Atlas projects that have painted molecular portraits of about 11,000 patient tumors in 33 cancer types.”

MD安德森研究的参与者包括阿尼尔Korkut，博士;鲁帕Kanchi，博士;Apurva赫格德;沃尔特·勒努瓦;文斌刘博士;刘岳鑫，博士;Visweswaran Ravikumar;阿文德饶，博士;安德烈·舒尔茨博士;许斌李; Keith Baggerly, Ph.D.; and John Weinstein, M.D., Ph.D., all of the Department of Bioinformatics & Computational Biology; Anil Sood, M.D., Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine; Alexander Lazar, M.D., Ph.D., Pathology; Jason Roszik, Ph.D.,; Genomic Medicine; and Gordon Mills, M.D., Ph.D., and Christopher Vellano, Ph.D., Systems Biology.

其他参与机构包括Broad研究所，马萨诸塞州剑桥的;温安洛研究所，大急流188bet体育网址城，密歇根州;医药，休斯敦贝勒医学院;技术，索尔纳，瑞典皇家工学院;比利时根特大学;休斯顿大学;研究的巴克衰老研究所，诺瓦托，加利福188bet体育网址尼亚州;加州大学旧金山分校;迈克尔·史密斯基因科学中心，温哥华，B.C;巴西圣保罗大学; Mayo Clinic College of Medicine, Rochester, Minn.; Dana Farber Cancer Institute, Boston; The University of Kansas Medical Center, Kansas City; University of Washington, Seattle; Medical College of Wisconsin, Milwaukee; University of Oklahoma Health Sciences Center, Oklahoma City; University of Alabama, Birmingham; University of Maryland School of Medicine, Baltimore; Institute of Human Virology, Abuja, Nigeria; Chang Gung University, Taoyun, Taiwan; Wake Forest Baptist Health Center, Winston-Salem, N.C.; University of New South Wales, Sydney; Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles; Leukemia Therapeutics, LLC, Hull, Mass,; National Cancer Institute, Bethesda, Md.; and New York University Langone Health, New York.

本研究由国家癌症研究所(U54 HG003273、U54 HG003067、U54 HG003079、U24 CA143799、U24 CA143840、U24 CA143845、U24 CA143845、U24 CA143858、U24 143866、U24 CA143867、U24 CA143882、U24 CA143883、U24 CA144025、U24 CA210949、U24 CA210950、P30 CA016672、P50 CA136393)资助。