文义王,博士。
生物信息学与计算生物学系,基础科学划分
关于王博士
王文义教授是一名具有统计学和生物学学术背景的大数据科学家。她的主要兴趣在于利用数据争论来理解癌症多元组学产生的大数据。她的实验室的统计方法和工具开发是由数据驱动的,并通过解决重要和新颖的生物学问题来激发动力。
她的实验网站是:https://din.mdacc.tmc.edu/~ wwang7/.
目前标题和隶属关系
主要约会
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学,德克萨斯州和德克萨斯州和德克萨斯州癌症中心的探矿科学系教授
双/联合/辅助预约
德克萨斯州德克萨斯州和德斯逊癌症中心大学,德克萨斯州安德森大学,德克萨斯州德克萨斯州大学的生物统计学系教授
德克萨斯A&M大学统计系教授,大学站,TX
188bet体育网址研究兴趣
实验室目前的主要研究重点是:188bet体育网址
1)利用转录组和基因组数据(组间组)的计算反褶积,从大样本和单细胞测序数据中获得肿瘤异质性和进化。我们的目标是了解a)肿瘤微环境可能导致不同的预后或治疗反应结果,b)正常组织中细胞-细胞相互作用的分子机制。
2)个性化癌症风险预测模型,使用TP53突变相关的Li-Fraumeni综合征作为疾病模型;和新颖的统计建模和研究设计,以进一步了解TP53突变的泛癌影响。
该实验室根据需要使用统计/计算工具箱,包括深度学习方法。我们目前的重点是高维数据的混合建模和机器学习。
教育与培训
授予教育
2007年 | Johns Hopkins Bloomberg公共卫生学院,巴尔的摩,MD,美国,博士,生物统计数据 |
2003年 | 哥伦比亚大学医师和外科医生,纽约,纽约,美国,马,人类营养 |
2001年 | 复旦大学,上海,CHN,BS,生物学 |
经验与服务
行政任命/职责
招生委员会成员,GSBS,休斯顿,德克萨斯州,2018 - 2020
定量科学计划联合主任,德克萨斯大学休斯顿,休斯顿,TX,2014 - 2018年生物医学科学研究生院
其他的约会/责任
大学成员,贝勒医学院定量计算生物学研究生课程,休斯顿,TX,2017 - 至今
选定的出版物
同行评审文章
- 高F,Pan X,Dodd-Eaton EB,Reco CV,Montierth MD,Bojadzieva J,Mai Pl,Zelley K,Johnson Ve,Braun D,Nichols Ke,Garber Je,Savage SA,强大的LC,Wang W.基于谱系的预测模型鉴定了锂呋喃氏综合征的家庭中有害De Novo突变的载体。Genome Res 30(8):1170-1180,2020。E-PUB 2020. PMID:32817165。
- Shin Sj,Li J,Ning J,Bojadzieva J,强大LC,王W.贝叶斯估计半公制复发事件模型,其应用于锂弗拉梅尼综合征多发性癌症的渗透估计。生物统计学21(3):467-482,2020。E-PUB 2018. PMID:30445420。
- 王伟,王文强.利用逆矩先验对生存数据进行贝叶斯变量选择。中国科学院生物医学工程研究所。e-Pub 2020。PMID: 33456641。
- McCarthy DJ,Rostom R,Huang Y,Kunz DJ,DaneCek P,Bonder MJ,Hagai T,Lyu R,Hipsci Consortium,Wang W,Gaffney DJ,Simons Bd,Stegle O,Teichmann SA.Cardelino:体细胞克隆子结构和单细胞转录om的计算集成。NAT方法17(4):414-421,2020。E-PUB 2020. PMID:32203388。
- Gerstung M,Jolly C,Leshchiner I,Dentro SC,Gonzalez S,Rosebrock D,Mitchell TJ,Rubanova Y,Anur P,Yu K,Tarabichi M,Deshwar A,Wintersinger J,Kleinheinz K,Vázquez-Garcíai,Haase K,Jerman L,Sengupta S,Macintyre G,Malikic S,Donmez N,Livitz DG,CMero M,Demeulemeester J,Schumacher S,Fan Y,Yao X,Lee J,Schlesner M,Boutros PC,Bowtell DD,Zhu,Getz G,Imielinski M,Beroukhim R,Sahinalp Sc,Ji Y,Peifer M,Markowetz F,Mustonen V,Yuan K,Wang W,Morris QD,PCAWG演进&异质性工作组,Spellman Pt,Wedge DC,Van Lo P,PCAWG联盟.进化史2,658名癌症。自然578(7793):122-128,2020。E-PUB 2020. PMID:32025013。
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- Maura F、Agnelli L、Leongamornlert D、Bolli N、Chan WC、Dodero A、Carniti C、Heavican TB、Pellegrinelli A、Pruneri G、Butler A、Bhosle SG、Chiappella A、Di Rocco A、Zinzani PL、Zaja F、Piva R、Inghirami G、Wang W、Palomero T、Iqbal J、Neri A、Campbell PJ、Corradini P.整合转录和突变数据简化了外周t细胞淋巴瘤的分层。中国血液学杂志,2019年,29(6):628-634。e-Pub 2019。PMID: 30829413。
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- Morris JS, Hassan MM, Zohner YE, Wang Z, Xiao L, Rashid A, Haque A, Abdel-Wahab R, Mohamed YI, Ballard KL, Wolff RA, George B, Li L, Allen G, Weylandt M, Li D, Wang W, Raghav K, Yao J, Amin HM, Kaseb AO.肝动物 - 14:生物异质性测量显着提高了对肝细胞癌风险的预测。肝脏。E-PUB 2020. PMID:32931023。
- 全基因组联盟的ICGC / TCGA泛癌分析.全基因组的泛癌分析。自然。e-Pub 2020。
- 王z,kaseb ao,amin hm,哈桑mm,王W.,莫里斯js..在无向图形模型中的贝叶斯边缘回归,以表征癌症中的介性异质性。贾斯卡。
- Ahn J,Morita S,Wang W *,元Y *.使用Dyadic Shared-参数模型与信息缺失数据的纵向二次数据贝叶斯分析。STAT方法MED RES:962280217715051。E-PUB 2017. PMID:28629259。
- nikooienejad a,王W.*,约翰逊ve *。.使用非局部前沿的高维基因组研究中二元成果的贝叶斯变量选择。生物信息学。e-Pub 2016。
- Palculict TB, Ruteshouser EC, Fan Y,王W.,强壮的l,huff v.用全基因组序列鉴定种系Dicer1突变和家族性威尔姆人肿瘤杂合性的丧失。医学遗传学杂志。E-PUB 2015。
- 方,afshar pt,chibber a,mohiyuddin m,风扇y,mu j,gibeling g,bars,asadi nb,gerstein m,koboldt d,王W.,黄色,林H..一种使用SOMITALSEQ准确地检测SO-Matic突变的集合方法。基因组生物学。E-PUB 2015。
书章节
- 王W.,风扇Y,速度T. DNA变体呼叫目标测序数据。在:统计生物信息学的进步:高吞吐量的模型和综合推理。剑桥大学出版社:纽约,2013年。
拨款及合同支持
标题: | TP53中系列种系突变癌症风险预测的统计方法和工具 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 神经视网膜的细胞图谱 |
资金来源: | Chan Zuckerberg Authite Via Subaward Bayly医学院 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 改善李-弗美尼综合征的风险预测:临床保健提供者的实用工具 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 间变性甲状腺癌的肿瘤内异质性:新辅助BRAF和免疫指导治疗的影响 |
资金来源: | MARK研究癌症研究188bet体育网址 |
角色: | 共同主体调查员 |