来认识一下尼古拉斯·纳文博士。
尼古拉斯·纳文博士。
基础科学部遗传学系
关于纳林博士
Navin博士是MD安德森癌症中心的副教授,在生物信息学系联合任命。他是德克萨斯州博士大学安德森癌症中心Uthealth研究生院的教师。他也是CPRIT单细胞基因组中心(单核)的董事和MD安德森先进技术基因组学核心(ATGC)的联合主任。
他在迈克尔威廉博士的指导下,在寒冷的春天港实验室进行了他的研究生培训和博士后训练。在此期间,他发明了第一单细胞DNA测序方法(单核测序),用于测序哺乳动物细胞的基因组(Navin等,2011,性质。)。这项工作在建立单细胞基因组学领域时发挥了关键作用。Navin实验室继续处于单细胞癌基因组学领域的最前沿,他们发现了三阴性乳腺癌中的拷贝数演化的标点模型(Gao等,2016年,自然遗传学),并阐明了角色致素phentoypes乳腺癌进化中的亚基突变(Wang等,2014年,性质)。
Navin博士的团队继续致力于开发单细胞DNA和RNA测序的新技术,以及用于分析产生的大规模数据集的创新计算和统计方法。这些方法正被应用于肿瘤侵袭、转移和治疗耐药性的研究。他的实验室与MD安德森的领先肿瘤学家和病理学家密切合作,将这些技术转化为临床,在那里他们准备对降低人类患者的发病率产生重大影响。
Navin博士获得了许多著名的奖项,以表彰他的工作,包括Damon-Runyon创新者奖、AAAS Wachtel奖、ACS研究学者奖、Wilson Stone奖、Randall创新者奖和MD Anderson总裁卓越研究奖。188bet体育网址
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目前标题和隶属关系
主要任命
德克萨斯大学基础医学研究所遗传学系副教授,休斯敦医学博士,安德森癌症中心188bet体育网址
休斯敦德克萨斯大学MD安德森癌症中心基础科学研究部遗传学研究室CPRIT单细胞基因组学中心主任188bet体育网址
德克萨斯大学安德森癌症中心遗传学、基础科学研究部门高级技术基因组核心联席主任188bet体育网址
双/联合/辅助预约
副教授副教授,德克萨斯州德克萨斯州和德克萨斯群岛大学,休斯顿,德克萨斯州大学
德克萨斯州德克萨斯大学安德森癌症中心副教授Uthealth研究生生物医学科学院,休斯顿,德克萨斯州
188bet体育网址研究兴趣
单细胞基因组学;癌症演变;液体活检基因组学;计算生物学
我们集团已率先单细胞基因组测序技术,这是我们适用于理解人类癌症,包括肿瘤发生,侵袭,转移和治疗性复杂的生物过程的发展。我们研究癌症的进化过程,其中克隆经历选择和扩张响应于选择压力。我们了解肿瘤的复杂的生态系统,其由肿瘤细胞和间质细胞类型之间的相互作用复杂的维护。我们的使命是为了获得能够被用来改善生活和减少发病癌症患者的肿瘤质量演化的新知识。在MD安德森,我们有得天独厚的优势,以我们的基因组技术转化为诊所,在那里,他们正准备做早期发现,诊断和癌症患者的治疗策略产生重大影响。
教育与培训
授予学位教育
2010年 | 冷泉港实验室和石溪大学,冷泉港,纽约,美国,博士,分子遗传学 |
2003年 | 美国纽约萨拉托加斯普林斯Skidmore学院,理学学士,细胞生物学 |
研究生培训
2010-2011 | 纽约冷泉港冷泉港实验室癌症遗传学博士后研究员 |
经验与服务
学术任命
2011 - 2016年,德克萨斯大学安德森癌症中心定量科学部生物信息学和计算生物学系助理教授
助理科学研究系助理教授,德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州,TX,2011年休斯顿,2016年188bet体育网址
助理教授,德克萨斯大学MD安德森癌症中心的生物医学科学的UTHealth研究生院,休斯顿大学,得克萨斯州,2011至16年
荣誉与奖励
2019年 | 主席德克萨斯大学德克萨斯大学卓越奖卓越奖188bet体育网址 |
2019年 | 布拉瓦尼克生命科学奖,国家决赛选手 |
2018年 | 教师教育家奖,德克萨斯大学安德森癌症中心 |
2018年 | 在基础研究上达拉斯/沃斯堡活着的传奇教授成就奖,美国德克萨斯大学医学博士的安德森癌症中心188bet体育网址 |
2017年 | 杰克和贝弗利兰德尔杰出癌症治疗奖,兰德尔家庭基金会 |
2017年 | 前列腺癌基金会挑战奖 |
2017年 | 40 40岁以下的奖,斯托尼布鲁克大学 |
2016年 | 德克萨斯大学医学院院长安德森癌症中心院长奖学金 |
2016年 | 萨宾奖学金,安德鲁·萨宾家庭基金会 |
2016年 | 美国癌症188bet体育网址协会研究学者 |
2016年 | 德克萨斯大学安德森癌症中心院长表彰杰出教师 |
2016年 | 学院学者奖,得克萨斯州医学博士安德森癌症中心的大学 |
2015年 | AAAS马丁玫瑰Wachtel先生奖,美国科学促进会 |
2014年 | 教师教育家奖,德克萨斯大学安德森癌症中心 |
2013年 | 徐廷春奖,青年研究员奖 |
2013年 | 威尔逊S。斯通纪念奖 |
2013年 | Damon-Runyon Innovator奖,Damon-Runyon Rachleff基金会 |
2010年 | 青年研究者奖,基因组技术杂志 |
2009年 | T32 NCI奖学金,国家癌症研究所 |
2009年 | 亚伯拉罕奖,石溪大学 |
2008年 | 国王和米勒奖学金,石溪大学 |
2005年 | 冷泉港实验室Lindsey-Goldberg研究员 |
选定的出版物
同行评审文章
- 戴维斯A,Gao R,Navin n. SCOPIT:单细胞测序实验的样本量计算。BMC生物信息学20(1):5662019。PMID:31718533。
- 扎法尔H,纳文N,陈K,Nakhleh大号. SiCloneFit:从单细胞基因组测序数据对肿瘤克隆的群体结构、基因型和系统发育进行贝叶斯推断。基因组研究(11):1847-185912019。PMID:31628257。
- 王峰,梁绍峰,陈凯.SCMarker:单细胞转录组分析的从头抗体标记选择。计算机科学与技术(英文版),2019。PMID: 31658262。
- 科恩PG、希思EI、苏黎塔A、拉美什N、肖L、赛伊、李宁塔皮亚E、图SM、苏布提SK、王J、王X、埃夫斯塔西奥E、汤普森TC、特隆科索P、纳文N、洛格西蒂斯CJ、阿帕里西奥AM.Cabazitaxel Plus Carboplatin用于治疗转移性阉割的前列腺癌症的男性:随机,开放标签,第1-2期试验。刺血针20 ONCOL(10):1432至1443年,2019年PMID:31515154。
- 张勇,熊胜,刘斌,潘V, Celii F, Chau G, Elizondo-Fraire AC, Yang P, You MJ, El-Naggar AK, Navin NE, Lozano G.体细胞Trp53突变差异驱动乳腺癌和转移的进化。土木工程学报9(1):3953,2018。e-Pub 2018。PMID: 30262850。
- Kim C & Gao R, Sei E, Brandt R, Hartman J, Hatshek T, Crosetto N, Foukakis T和Navin N。.耐药演化三重阴性乳腺癌笔下的单细胞测序。细胞173(4):879-893,2018。PMID:29681456。
- Casasent AK,Schalck A,高R,SEI E,龙甲,Pangburn W,Casasent T,梅里克-Bernstam楼埃杰顿ME,NE纳文.乳腺肿瘤多克隆侵袭的单细胞测序。细胞172(2):205 - 217年,2018年。PMID: 29307488。
- 梁ML,戴维斯A,Gao R,赌场A,Wang Y,Sei E,VILAR E,MARU D,KOPETZ,Navin,N.单细胞DNA测序显示转移性结肠直肠癌中的晚期播散模型。Genome Res 27(8):1287-1299,2017。PMID:28546418。
- Gao R, Davis A, McDonald TO, Sei E, Shi X, Wang Y, Tsai PC, Casasent A, Waters J, Zhang H, Meric-Bernstam F, Michor F, Navin NE. 三阴性乳腺癌的间断拷贝数演变和克隆停滞。Nat Genet 48(10):1119-302016。电子出版物2016。PMID:27526321。
- Mann Km,Newberg Jy,Black Ma,Jones Dj,Amaya-Rojas L,Guzman-Rojas L,Kodama T,Ward JM,Rust AG,Van der Weyden L,Yew CC,Waters JL,Leung ML,Rogers K,Rogers SM,Mcnoe La,Selvanesan L,Navin N,Jenkins Na,Copeland Ng,Mann MB.用SBCapseq分析单髓性白血病细胞中肿瘤异质性和驾驶员基因。自然生物科技34(9):962-72,2016。PMID:27479497。
- Zafar H,Wang Y,Nakhlem L,Navin N,Chen K. 单变异:单细胞中的单核苷酸变异检测。《自然方法》,2016年。PMID:27088313。
- 梁ml,王y,金c,gao r,姜j,sei e,navin ne. 来自单核的高度多重靶向DNA测序。Nat协议11(2):214-352016。电子出版物2016。PMID:26741407。
- 梁明,王毅,沃特斯J,纳文.SNES:单核外壳测序。基因组BIOL 25(16):55,2015。PMID:25853327。
- Molhatra A,王Y,沃特斯Ĵ,我馆,纳文ñ.倍增性SEQ:通过测序多倍体肿瘤群推断突变年表。Genomic Med 7(1):6,2015。PMID:25729435。
- Wang Y, Waters J, Unruh A, Roh W, Shi X, Chen K, Scheet P, Vattathil S, Liang H, Multani A, Zhang H, Zhao R, Michor F, Meric-Bernstam F, Navin NE。. 单核基因组测序揭示乳腺癌克隆进化。《自然》杂志512(7513):155-602014。PMID:25079324。
- Baslan T, Kendall J, Troge J, stephansky A, Wigler M, Navin N, Hicks J. 单细胞全基因组拷贝数分析。自然协议7(6):1024-412012。PMID:225555242。
- Navin N, Kendall J, Troge J, Rodgers L, Cook K, stephansky A, Levy D, Lee Y, Esposito D, Muthuswamy L, Hicks J, Wigler M.肿瘤演进推断由单细胞测序。性质7(472):90-4,2011。PMID:21399628。
- Malihi PD,格拉夫RP,Rodriguez的A,拉梅什N,李Ĵ,萨顿R,Jiles R,Ruiz的Velasco的C,SEI E,Kolatkar A,Logothetis C,纳文NE,玉米P,阿帕里西奥AM,Dittamore R,希克斯Ĵ,库恩P,苏里塔AJ.单细胞循环肿瘤细胞分析显示基因组不稳定性是侵袭性前列腺癌的一个显著特征。Clin Cancer Res. e-Pub 2020。PMID: 32341031。
特邀文章
- 王颖,纳文.进展和单细胞测序技术的应用。分子细胞58(4):598-609,2015年PMID:26000845。
赠款和合同支助
标题: | 采用单细胞测序的TNBC乳腺癌患者的化学抑制演变 |
资金来源: | 莱夫科夫斯基基金会 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 研究TNBC的突变进化和肿瘤内异质性 |
资金来源: | 美国癌症协会 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 集成单细胞基因组学核心设施 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 利用新的测序技术表征癌症基因组的不稳定性和翻译影响 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | OMIC和转移性乳腺癌的多维空间Atlas和前列腺癌(OMS图集) |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 利用空间单细胞基因组学研究癌前乳腺癌的肿瘤起始和侵袭 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 与单细胞基因组划定化疗耐药的演变和生态乳腺癌 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 人类乳腺细胞图谱种子网络 |
资金来源: | Chan Zuckerberg主动 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 转移性乳腺癌患者治疗耐药性的空间组学分析 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 用单细胞基因组学描述乳腺癌对HER2靶向治疗的耐药性演变 |
资金来源: | 姐妹机构网络基金 |
角色: | 主要调查员 |
标题: | 通过EGLN抑制转化肠道放射防护以改善不可切除胰腺癌的临床预后 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同调查员 |
标题: | AML / MDS登月 |
资金来源: | UTMDACC登月计划 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 前列腺癌登月计划 |
资金来源: | UTMDACC登月计划 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 乳腺癌月亮射击 |
资金来源: | UTMDACC登月计划 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | LC170171肿瘤异质性和在小细胞肺癌的治疗抗性(SCLC) |
资金来源: | 国防部(国防部) |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 立即预防导管癌原位浸润性过度治疗-精确 |
资金来源: | 癌症研究英国188bet体育网址 |
角色: | 共同调查员 |