马克·贝德福德博士
基础科学部表观遗传学和分子癌变学系
关于贝德福德博士
Dr. Bedford’s laboratory focuses on two research topics: 1) elucidating the biological role of arginine methylation – an abundant modification that has been implicated in signal transduction, transcriptional control and DNA repair, and 2) developing a protein domain microarray platform to interrogate the role of posttranslational modifications in driving protein-protein interactions in signal transduction. They have generated targeted disruptions and gain-of-function mouse models for these arginine methyltransferase enzymes, with a primary focus on CARM1. Using their protein-domain microarray platform, they have identified and characterized novel protein interactions; they have used these arrays to “read” the histone code. They have identified a number of novel proteins that interact with lysine and arginine methylated motifs, as well as with small molecules that can compete with these interactions. Recently, the Bedford lab expanded their array platform to include all the human phospho-reader domains, acetyl-reader domains, and most of the human PDZ domains and ubiquitin-binding domains.
目前职称及所属单位
主要的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心表观遗传学和分子致癌系教授
188bet体育网址研究兴趣
贝德福德实验室研究表观遗传学和癌症之间的交集,特别关注一类表观遗传学标记——精氨酸甲基化。为了更好地理解精氨酸甲基化的生物学作用,他们的研究小组使用了许多不同的生物学方法来研究PRMT功能。188bet体育网址这些包括小鼠获得和丧失功能的PRMT模型,筛选甲基结合蛋白的蛋白微阵列,筛选PRMT底物的生化筛选,以及筛选PRMT家族成员的化学抑制剂。他们已经在小鼠中产生了一些精氨酸甲基转移酶基因的靶向破坏,希望揭示这种翻译后修饰的细胞和组织特异性作用。目前他们手头上有CARM1、PRMT3和PRMT6缺失小鼠。他们正在对这些无基因小鼠进行转录组分析(RNA-seq)和芯片seq,以确定它们调控的全部基因。贝德福德小组还在执行双重敲除,以调查不同PRMTs之间的冗余性。他们也正在制造获得功能的转基因小鼠模型,以确定PRMT在体内过表达的影响。这些是可以通过与组织特异性cre系杂交而激活的转基因小鼠。Cre表达移除lox/STOP/los卡带并激活PRMT的表达。 They have already generated PRMT6 gain-of-function mice using this approach. They are currently producing CARM1, PRMT1, PRMT5 and TDRD3 transgenic mice using the same approach.
教育与培训
授予学位教育
1996 | 魏茨曼科学研究所,ISR,博士,发育生物学 |
1989年 | 斯泰伦博斯,ZAF,MS,医学生物化学大学 |
1986年 | 斯泰伦博斯大学,ZAF,BS,生物化学荣誉 |
1985年 | Stellenbosch大学,ZAF,理学学士 |
研究生培训
1996 - 2000 | 博士后奖学金,哈佛医学院,波士顿,MA |
发表论文
同行评议的文章
- Avasarala S, Wu PY, Khan SQ, Yanlin S, Van Scoyk M, Bao J, Di Lorenzo A, David O, Bedford MT, Gupta V, Winn RA, Bikkavilli RK。PRMT6通过肿瘤相关巨噬细胞的替代激活促进肺肿瘤进展。摩尔癌症研究18(1):166-178,2020年电子酒吧2019。
- 马尼卡维纳亚姆S,贝莱斯-克鲁兹R,比斯瓦什AK,贝德福德E,克莱因BJ,库塔拉泽TG,刘B,贝德福德MT,约翰逊DG。E2F1乙酰化引导p300/ cbp介导的组蛋白乙酰化在DNA双链断裂处促进修复。Nat Commun 10(1):4951, 2019。
- 包,迪洛伦佐A,林K,陆,钟,塞巴斯蒂安MM,穆勒WJ,杨,贝德福德山。过度表达的小鼠模型揭示了不同类型的I蛋白精氨酸甲基独特的致癌作用。癌症研究79(1):21-32,2019年电子酒吧2018。
- 吴X,刘S,Sagum C,陈军,辛格R,维迪A,霍顿JR,卡什亚普TR,Fushman d,程X,贝德福德MT,王斌。DNA损伤位点的Lys63-和lys11 -多聚泛素信号之间的串扰是由塞尚驱动的。基因Dev 33(23-24):1702-1717, 2019。e-Pub 2019。
- Hupalowska A, Jedrusik A, Zhu M, Bedford MT, Glover DM, Zernicka-Goetz M。CARM1和paraspeckles调节着床前小鼠胚胎发育。细胞175(7):1902 - 1916年,2018年。
- Cheng D, Vemulapalli V, Lu Y, Shen J, Aoyagi S, Fry CJ, Yang Y, Foulds CE, Stossi F, Trevino LS, Mancini MA, O’malley BW, Walker CL, Boyer TG, Bedford MT。CARM1将MED12甲基化以调节其rna结合能力。生命科学联盟1(5):e201800117, 2018。
- 汉Z,Schwoerer MP,希克斯P,梁Ĵ,Ruthel G,浆果CT,弗里德曼BD,Sagum CA,贝德福德MT,Sidhu SS,Sudol男,哈蒂RN。宿主蛋白BAG3是Lassa VLP出口的负调控因子。疾病6(3):64、2018。
- 裴N,维维亚诺男,苏X,吕Ĵ,程d,Sagum C,卡斯特拉诺S,白X,约翰逊C,方MI,沉Ĵ,陈K,李H,Sbardella G,贝德福德MT。利用蛋白质芯片研制小分子抑制剂Spindlin 1。Nat Chem Biol 13(7):750-756, 2017。e-Pub 2017。
- 高,达尔S,贝德福德山。PRMT5依赖调节IRES-通过核糖核蛋白A1的甲基化平移。核酸研究45(8):4359-69,2017年电子酒吧2017。
- Shanle EK, Shinsky SA, Bridgers JB, Bae N, Sagum C, Krajewski K, Rothbart SB, Bedford MT*, Strahl BD*(*通讯作者)。组蛋白肽芯片筛选chromo和Tudor域定义了新的组蛋白赖氨酸甲基化相互作用。表观遗传学染色质10:12,2017。
- Espejo AB, Gao G, Black K, Gayatri S, Veland N, Kim J, Chen T, Sudol M, Walker C, Bedford MT。PRMT5 c端磷酸化调节14-3-3/PDZ交互开关。J Biol Chem 292(6):2255-65, 2017。
- 加亚特里讷S,考尔斯兆瓦,Vemulapalli V,程d,孙ZW,贝德福德MT。利用定向肽阵列文库评估甲larginine特异性抗体和精氨酸甲基转移酶底物基序。Sci代表6:28718,2016。
- 杨,Hadjikyriacou A, Xia Z, Gayatri S, Kim D, Zurita-Lopez C, Kelly R, Guo A, Li W, Clarke SG, Bedford MT。PRMT9是II型甲基是甲基化的剪接因子SAP145。纳特COMMUN 6:6428,2015年。
- 迪洛伦佐A,杨,马卡鲁索M,贝德福德山。甲增益的功能小鼠模型识别PRMT6作为NF-kB的共活化剂。核酸研究42(13):8297-309,2014。
- 杨,麦克布莱德,汉斯莱,卢,切丁F,贝德福德山。精氨酸甲基化促进TOP3B招募到染色质,防止R环积累。Mol Cell 53(3):484-97, 2014。