kim-anh做
生物统计学系,基础科学划分
关于博士
Kim-Anh Do,Ph.D.,MD安德森于2003年MD Anderson的教师奖,2003年和2017年癌症研究的Electa C. Taylor椅子的受援人员教授和主席。她是188bet体育网址a Fellow of the American Statistical Association, the American Association for the Advancement of Science (AAAS) and the Royal Statistical Society and is an Elected Member of the International Statistical Institute.她曾担任若干国家卫生研究院的主要统计名人或共同调查员(NIH)资助的前列腺癌,流行病学,白血病,上部气质衰弱癌症,乳腺癌和脑癌,包括早期检测研究网络(188bet体育网址EDRN) grant, the Prostate SPORE (as Director of the Biostatistics Core), the Breast SPORE, and the Brain SPORE at M. D. Anderson. She has significant publications in statistical methodology, computing, biomedical, and in other applied specialist journals. Her most recent interest is in the development of clustering and analytic methods for genomic and proteomic expressions. She has developed bioinformatics software and authored books: (i) Analyzing microarray gene expression data; (ii) Bayesian Inference for Gene Expression and Proteomics; and (iii) Advances in Statistical Bioinformatics--Models and Integrative Inference for High-Throughput Data. Her extensive contribution to statistical, medical and cancer research has resulted in more than 200 published articles to date.可以在这里找到有关DO的教育和专业活动博士的其他信息。
目前标题和隶属关系
主要的约会
教授和前部门主席(08/20),德克萨斯州德克萨斯州和德克萨斯州安德森大学安德森癌症中心,德克萨斯州康森大学
双/联合/辅助预约
德克萨斯州休斯顿统计系兼职教授
德克萨斯农工大学统计学系兼职教授
188bet体育网址研究兴趣
计算统计与生物统计学生物信息学统计遗传学非参数统计方法
教育与培训
授予学位教育
1990年 | 斯坦福大学,斯坦福大学,美国,博士,统计 |
1985年 | 斯坦福大学,斯坦福,加利福尼亚州,MS,MS,统计 |
1983年 | 昆士兰大学,布里斯班,Aus,B.SC,数学和计算机科学 |
荣誉与奖励
2017年 | Electa C. Taylor癌症研究椅,德克萨斯州大学安德森癌症188bet体育网址中心 |
2015年 | Elected to the Electorate Nominating Committee for Statistics, AAAS |
2013年 | 德克萨斯4000尊贵的尊贵,大学德克萨斯州德斯逊癌症中心 |
2013年 | 当选研究员,美国科学促进会 |
2012年 | Elected Member, International Statistical Institute |
2006年 | 美国统计学会会员 |
2005年 | 皇家统计社会 |
2003年 | 教师学者奖,德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
1994年 | 澳大利亚科学学院奖 |
1983年 | 艾米R.休斯奖,澳大利亚大学妇女联合会,澳大利亚 |
1982年 | 年度加德士女毕业生,昆士兰大学研究生奖学金 |
专业的会员
美国科学促进协会(AAAS),华盛顿,D.C
Elected Member, 2015 - Present
伦敦皇家统计会
获选院士(2005年至今
美国统计协会休斯顿分会(HACASA),休斯顿,德克萨斯州
2003年至2004年担任总裁
国际贝叶斯分析协会,圣克鲁斯,加州
会员,2003年 - 至今
美国统计协会休斯顿分会(HACASA),休斯顿,德克萨斯州
总统选民,2002年 - 2003年
国际生物识别学会,华盛顿特区
成员,1999 - 至今
美国统计协会,亚历山大,弗吉尼亚州
成员,1985年 - 至今
选定的出版物
同行评审文章
- Kim J,Do Ka,Ha MJ,Peterson CB.多网络枢纽节点的贝叶斯推理。生物识别技术75(1):172 - 182年,2019年。e-Pub 2018。PMID: 30051914。
- Ha MJ,Banerjee S,Akbani R,Liang L,Mills GB,Do Ka,Baladandayuthapani V.个性化综合网络建模癌症蛋白质组图集。SCI REP 8(1):14924,2018。E-PUB 2018. PMID:30297783。
- CA类,HA MJ,Baladandayuthapani V,Do Ka.闪亮应用中基因组学的Idingo - 综合差异网络分析。生物信息学34(7):2018年1243-1245,2018。E-PUB 2017. PMID:29194470。
- Tayob N,Stingo F,Do Ka,Lok Asf,Feng Z.一种使用多个纵向生物标志物的肝细胞癌的贝叶斯筛查方法。Biometrics 74(1):2018年249-259,2018。E-Pub 2017. PMID:28482112。
- Chekouo T,Stingo Fc,Doecke JD,Do Ka.多平台基因组数据的贝叶斯综合方法:肾癌案例研究。Biometrics 73(2):615-624,20177。E-Pub 2016. PMID:27669160。
- Hunt KK, Karakas C, Ha MJ, Biernacka, Yi M, Sahin AA, Adjapong O, Hortobagyi GN, Bondy M, Thompson P,张KL, Ellis IO, Bacus S, Symmans WF, Do KA, Keyomarsi K.细胞质细胞周期素E预测乳腺癌患者复发。中华肿瘤杂志,2017,29(3):429 - 434。e-Pub 2016。PMID: 27881578。
- Jonasch E, Hasanov E, Corn PG, Moss T, Shaw KR, Stovall S, Marcott V, Gan B, Bird S, Wang X, Do KA, Altamirano PF, Zurita AJ, Doyle LA, Lara PN, Tannir NM.MK-2206与依维莫司治疗难治性肾细胞癌的随机2期研究西安交通大学学报(自然科学版),2017。PMID: 28049139。
- Çeliktasm,tanaka i,tripathi sc,fahrmann jf,aguilar-bonavides c,villalobos p,delgado o,dhillon d,dennison jb,鸵素ej,王h,behrens c,do ka,gazdar af,hanash sm,taguchi a.CPS1在lkb1灭活肺腺癌细胞生长、代谢和预后中的作用。中华肿瘤杂志19(3):1-9,2017。PMID: 28376202。
- 杨Q,陈LS,哈MJ,Do Ka,Neelapu SS,Gandhi V.idealisib通过抑制套细胞淋巴瘤翻译调控机制影响细胞生长。临床肿瘤研究(1):1 - 4,2017。e-Pub 2016。PMID: 27342398。
- x,胡j,做ka.SIFORM:用于多平台生物信息数据集成的共享信息因子模型。生物信息学32(21):3279 - 3290年,2016年。e-Pub 2016。PMID: 27381342。
- Tayob N,Do Ka,Feng Z.在一组序列设计中结合训练和测试数据时生物标志物面板表现的无偏估计。生物识别技术72(3):888 - 96年,2016年。e-Pub 2016。PMID: 26845527。
- 江y,陈健康,苏X,汤普森Pa,刘X,做Ka,Wierda W,Keating MJ,Plunkett W.ATM功能及其与慢性淋巴细胞白血病患者的关系及其复发缺失(11Q22.3-23.2)。血癌J 6(6,E465):E465,2016。E-PUB 2016. PMID:27588518。
- 辛格Kebriaei P, H, hul MH, Figliola MJ,巴R,集中政策,耶拿B,道森MJ, Kumaresan公关,苏年代,Maiti年代,戴J, Moriarity B,忘记马,Senyukov V,奥罗斯科,刘T,麦卡蒂J,杰克逊RN,莫耶斯JS, Rondon G, Qazilbash M, Ciurea年代,Alousi,分担Y, Rezvani K,马林D, Popat U,用软管冲洗C, Shpall EJ, Kantarjian H,基廷M, Wierda W,是KA, Largaespada DA, Lee DA, Hackett PB, Champlin RE, Cooper LJ吗.I阶段使用睡美观试验,产生CD19特定的汽车T细胞。J Clin Invest 126(9):3363-76,2016。E-Pub 2016. PMID:27482888。
- Caruso HG, Torikai H, Zhang L, Maiti S, Dai J, Do KA, Singh H, Huls H, Lee DA, Champlin RE, Heimberger AB, Cooper LJ.利用嵌合抗原受体自限表达mRNA重定向t细胞对EGFR的特异性。中国免疫学杂志,39(5):205- 17,2016。PMID: 27163741。
- Kim J,Davis JW,Klein EA,Magi-Galluzzi C,Lotan Y,Ward JF,Pesters LL,Basler JW,Pettaway Ca,Stephenson A,Li Ning Tapia Em,Efstathiou E,王X,Do Ka,Lee JJ,GorlovIP,Vornik La,Hoque Am,Prokhorova在,Parnes HL,Lippman Sm,Thompson Im,棕色ph,ogothetis cj,troncoso p.早期前列腺癌短期半甾胺随机对照试验中的组织作用。eBiomedicine 7:85-93,20106。E-Pub 2016. PMID:27322462。
- Tayob N,Lok As,Do Ka,Feng Z.利用纵向甲胎蛋白筛选算法改进肝癌的检测。临床肝胆病14(3):469-475,2016。e-Pub 2015。PMID: 26260109。
- Powell E,Shao J,Yuan Y,Chen HC,Cai S,Echeverria GV,Mistry N,Decker Kf,Schlosberg C,Do Ka,Edwards Jr,Liang H,Piwnica-Worms D,Piwnica-Worms H..P53缺乏与B细胞易位基因2(BTG2)损失有损失通过促进三重阴性乳腺癌的患者衍生的异种移植物(PDX)模型中的原发性和转移位点中的肿瘤生长增强了转移性潜力。乳腺癌Res 18(1):2016年,2016年E-PUB。PMID:26818199。
- Chekouo T,Tuingo Fc,Guindani M,Do Ka.贝叶斯预测模型,用于精神分裂症的成像遗传学。应用统计数据10(3):2016年1547-1571,2016。
- McAuliffe PF, Evans KW, Akcakanat A, Chen K, Zheng X, Zhao H, Eterovic AK, Sangai T, Holder AM, Sharma C, Chen H, Do KA, Tarco E, Gagea M, Naff KA, Sahin A, Multani AS, Black DM, Mittendorf EA, Bedrosian I, Mills GB, Gonzalez-Angulo AM, Meric-Bernstam F.矫正:在化学疾病中提高了产生患者衍生的乳腺癌异种移植物,并预测患者结果不佳。PLOS一11(3):E0151121,2016。E-PUB 2016. PMID:26953790。
- Ha Mj,Baladandayuthapani v,做Ka.Dingo:基因组学中的差异网络分析。生物信息学31(21):3413-3420,2015。E-PUB 2015. PMID:26148744。
- 王y,霍布斯bp,hu j,ng cs,做ka.用功能性CT成像预测靶向相关靶标的相关靶标的分类。生物识别71(3):792-802,2015. E-PUB 2015. PMID:25851056。
- Chekouo T,Stingo Fc,Doecke JD,Do Ka.纳入MicroRNA监管网络和通路:贝叶斯图形方法选择MiRNA和Genes的审查结果。Biometrics 71(2):428-38,2015。E-PUB 2015. PMID:25639276。
- Rembach A,Stingo Fc,Peterson C,Vannucci M,Do Ka,Wilson WJ,Macaulay S1,Ryan TM,Martins RN,Ames D,Masters Cl,Doecke JD,AIBL研究组188bet体育网址.贝叶斯图形网络分析揭示了阿尔茨海默病特有的复杂生物相互作用。中国老年痴呆症杂志(3):917- 25,2015。PMID: 25613103。
- Ha Mj,Baladandayuthapani v,做Ka.采用因果结构学习的预后基因特征识别:肾癌中的应用。癌症Inform 14(SOMPL 1):23-35,2015。电子专家2015. PMID:25861215。
- Tam CS,O'Brien S,Plunkett W,Wierda W,Ferrajoli A,Wang X,Do Ka,Cortes J,Khouri I,Kantarjian H,Lerner S,Keating MJ.FCR后的生活:慢性淋巴细胞白血病患者的结果,在氟氮胺,环磷酰胺和利妥昔单抗进行前线处理后进展。血液124(20):3059-64,2014。E-PUB 2014. PMID:25281606。
- Hassan B,Akcakanat A,Sangai T,Evans KW,Adkins F,eRovic Ak,Zhao H,Chen K,Chen H,Do Ka,Xie Sm,Holder Am,Niing A,Mills GB,Mer-Bernstam F.催化MTOR抑制剂可以克服对颠覆性MTOR抑制剂的内在和获得的抗性。Oncotarget 5(18):2014年8544-57,2014。E-PUB 2014. PMID:25261369。
- Pande M, Bondy ML, Do KA, Sahin AA, Ying J, Mills GB, Thompson PA, Brewster AM.PI3K-AKT-MTOR途径,肥胖和乳腺癌无病生存中的种系单核苷酸多态性之间的关系。乳腺癌RES治疗147(2):381-7,2014。E-PUB 2014. PMID:25108739。
- 张L,Baladandayuthapani V,Mallick BK,ManyAM GC,Thompson Pa,Bondy Ml,Do Ka.贝叶斯分层结构化可变选择方法,应用于MIP癌症研究。J R STAT SOC SEC CATR STAT 63(4):595-620,2014。PMID:25705056。
- Meric-Bernstam F, Akcakanat A, Chen H, Sahin A, Tarco E, Carkaci S, Adrada BE, Singh G, Do KA, Garces ZM, Mittendorf E, Babiera G, Bedrosian I, Hwang R, Krishnamurthy S, Symmans WF, Gonzalez-Angulo AM, Mills GB.生物学中变量对乳腺癌蛋白质组学生物标志物的影响。Clin Cancer Res 20(14):3870-83,2014:E-Pub 2014. PMID:24895461。
- Blanco E, Sangai T, Wu S, Hsiao A, Ruiz-Esparza GU, Gonzalez-Delgado CA, Cara FE, Granados-Principal S, Evans KW, Akcakanat A, Wang Y, Do KA, Meric-Bernstam F, Ferrari M.雷帕霉素和紫杉醇共定位给药可增强PI3K/Akt/mTOR通路的协同靶向性。中国科学(d辑):地球科学(d辑),2014。e-Pub 2014。PMID: 24569835。
- Gonzalez-Angulo, Akcakanat,刘年代,绿色的MC,默里杰,陈H, Palla SL, Koenig KB,布鲁斯特,瓦莱罗能源V,易卜拉欣NK, Moulder-Thompson年代,利顿JK, Tarco E,摩尔J,弗洛雷斯P,克劳福德D,德莱顿MJ, Symmans WF,领域,佐丹奴SH, Pusztai L, KA,米尔斯GB, Hortobagyi GN, Meric-Bernstam F.标准Neoadjuvant化疗的开放标签随机临床试验与紫杉醇,然后FEC与紫杉醇和艾柳猴的组合,随后FEC患有三重受体阴性乳腺癌的女性。Ann on Col 25(6):2014年1122-7。2014年E-PUB 2014. PMID:24669015。
- Doecke JD,Chekouo T,Stingo FC,并做K-A.miRNA靶基因鉴定:用于分析TCGA Illumina Miseq和RNA-SEQ HiSeq平台数据的分析MiRNA-靶基因关系。国际人类遗传学杂志14(1):17-22,2014。
- Chavez-MacGregor M,Liu S,De Melo-Gagliato D,Chen H,Do Ka,Pusztai L,Fraser Symmans W,Nair L,Hortobagyi GN,Mills GB,Meric-Bernstam F,Gonzalez-Angulo AM.基因和蛋白质表达的差异以及种族/种族对乳腺癌亚型的影响。癌症流行病生物标志物预期23(2):316-23,2014。电子专家2013年。PMID:24296856。
- Gorlov IP,杨杰,Byun J,Logothetis C,Gorlova Oy,Do Ka,Amos C.如何从微阵列数据中获得最大的数据:反向基因组学的建议。BMC基因组学15:223,2014。E-PUB 2014. PMID:24656147。
- Liu Y, Zhou R, Baumbusch LO, Tsavachidis S, Brewster AM, Do KA, Sahin A, Hortobagyi GN, Taube JH, Mani SA, Aarøe J, Wärnberg F, Børresen-Dale AL, Mills GB, Thompson PA, Bondy ML.与早期乳腺癌骨和非骨转移相关的基因组拷贝数失衡乳腺癌研究进展[j]。e-Pub 2013。PMID: 24305980。
- Shirazi F, Farmakiotis D, Yan Y, Albert N, Do KA, Kim-Anh D, Kontoyiannis DP.饮食改变和二甲双胍对肥胖和毛霉菌病有有益的影响。PLoS One 9(9):e108635, 2014。e-Pub 2014。PMID: 25268492。
- león-novelo lg,müllerp,arap w,sun j,pasqualini r,do ka.贝叶斯决策理论多个比较程序:跳闸显示数据的应用。BIOM J 55(3):478-89,2013。E-PUB 2012. PMID:23281047。
- león-novelo lg,müllerp,arap w,kolonin m,sun j,pasqualini r,do ka.Semiparametric Bayesian推论噬菌体显示数据。Biometrics 69(1):174-83,2013。E-PUB 2013. PMID:23339534。
- 王W,Baladandayuthapani v,莫里斯js,扫帚bm,manyam g,做ka.IBAG:综合性贝叶斯高维多平台基因组学数据分析。生物信息学29(2):149-59,2013。电子专家2012. PMID:23142963。
- 王W,Baladandayuthapani v,福尔摩斯CC,做Ka.基于综合网络的贝叶斯分析不同的基因组学数据。BMC BioInformatics 14 Slock 13:S8,2013. E-PUB 2013. PMID:24267288。
- Bonato V,Baladandayuthapani V,扫帚BM,Sulman EP,aldape Kd,Do Ka.贝叶斯集合方法在基因表达数据中存活预测。生物信息学27(3):359-67,1111。E-PUB 2010. PMID:21148161。
- 张某,穆勒P,做KA.具有纵向标记的贝叶斯半粉末救生模型。Biometrics 66(2):435-43,2010。E-PUB 2009. PMID:19508243。
- ji y,yin g,tsui k-w,kolonin mg,sun j,arap w,pasqualini r,做k-a.贝叶斯混合模型用于噬菌体展示实验中的复杂高尺寸计数数据。皇家统计社会杂志:C系列(应用统计)56(2):139-52,2007。
- K-A, McLachlan GJ, Bean R, Wen S.基因剃料与混合模型进行微阵列基因表达数据。癌症信息学2:25-43,2007. PMID:没有PUBMED。
- Kim Sj,Uehara H,Yazici S,Busby Je,Nakamura T,He J,Maya M,Logothetis C,Mathew P,Wang X,Do Ka,Fan D,Fidler IJ.靶向抗抗性前列腺癌内皮细胞的血小板衍生生长因子受体。J Natl Cancer Inst 98(11):783-93,2006。PMID:16757703。
- 做k-a mueller p,tang f.差异基因表达的贝叶斯混合模型。皇家统计社会学报,C型综合统计54(3):1-18,2005。PMID:没有Pubmed。
- Do Ka,Johnson MM,Lee Jj,Wu XF,Dong Q,Hong WK,Khuri Fr,Spitz Mr.纵向研究吸烟模式与上部气体抗病性患者吸烟有关的二次原发性肿瘤的发展。癌症101(12):2837-42,2004. PMID:15536619。
- Do K-A,Green A,Guthrie JR,Dudley Ec,Burger Hg,Dennerstein L.绝经期冠心病危险因素的纵向研究流行病学杂志151:584- 93,2000PMID: 10733040。
- K- a, Kirk K.事件相关电位曲线的判别分析使用平滑主成分。生物识别技术55:174 - 81,1999。PMID: 11318152。
- 木ata,做k-a,扫帚bm.用对U形统计的经验似然约束的顺序线性化。中国计算与图形统计学报5:365-85,1996。
- 展位jg,做k-a.用于构建引导置信区间的简单有效方法。计算统计8:333-46,1994。
- 做K-A,Hall P..使用阶统计量的伴随分布估计,并应用于bootstrap的蒙特卡罗刺激。皇家统计学会学报,B辑54:1-14,1992。
- 做K-A,Hall P..论引导的重要性抽样。Biometrika 78:161-167,1991。
- 做k-a,mclachlan gj.混合比例的估计:案例研究。应用统计33:134-40,1984。
- Brewster Am,Do Ka,Thompson Pa,Hahn Km,Sahin AA,Cao Y,Stewart MM,Murray JL,Hortobagyi Gn,Boldy ML.流行病学危险因素与乳腺癌复发的关系。J clinical Oncol 25(28):4438-44。e-Pub 2007。PMID: 17785707。
书的章节
- 黄X, Do K-A。评论:一种新的病例对照设计,用于评估由于有组织的基于人群的乳房x线照像筛查导致的乳腺癌过度诊断的程度。见:乳腺疾病:年鉴季刊,211-214,2015。
- 扫帚BM,DO K-A,Boldy M,Thompson P,Coombes K.分析癌症研究中拷贝数数据的方法。188bet体育网址在:统计生物信息学的进展:高通量数据的模型和综合推断。剑桥大学出版社,2013年出版社。
- Wang W, Baladandayuthapani V, Broom BM, Do K-A。用于整合多平台基因组数据的贝叶斯图形模型。癌症研究中拷贝数数据的分析方法。188bet体育网址在:统计生物信息学的进展:高通量数据的模型和综合推断。剑桥大学出版社,2013年出版社。
- 王W,Baladandayuthapani v,扫帚bm,做k-a。多平台高维数据的贝叶斯图形模型。在:统计生物信息学的进步:用于高吞吐量数据的模型和综合推理。剑桥大学出版社,2013年出版社。
书籍(编辑和书面)
- Do K-A,Qin Z,Vannucci M ..统计生物信息学的进步:高吞吐量数据的模型和集成推广。剑桥大学出版社,2013年出版社。
- 基因表达和蛋白质组学的贝叶斯推理。剑桥大学出版社,456,2006。
- McLachlan GJ,做K-A,Ambroise C.分析微阵列基因表达数据。在:Wiley系列概率和统计。Wiley-Interscience:新泽西州,352,2004。
补助金支持
标题: | 临床与转化科学中心(PP-2) |
资金来源: | NIH / NCI(来自UT Health Science Center - 休斯顿的分包) |
角色: | 合作者 - 统计领导者 |
标题: | ER阴性乳腺癌复发的风险预测 |
资金来源: | NIH / NCI(贝勒医学院分包) |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 慢性淋巴细胞白血病研究联盟(核心B)188bet体育网址 |
资金来源: | NIH/NCI(通过加州大学圣地亚哥分校的分包协议) |
角色: | 核心领导人 |
标题: | 癌症中心支持赠款(CCSG) - 生物统计资源集团(BRG) |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 生物静止学家 |
标题: | AML / MDS旗舰1 Moonshot计划 |
资金来源: | MD安德森癌症中心Moonshot |
角色: | 生物统计学总监 |
标题: | 前列腺癌旗舰登月计划 |
资金来源: | MD安德森癌症中心Moonshot旗舰 |
角色: | 生物统计学总监 |
标题: | 亚胺酸急性淋巴母细胞白血病靶向病变的定义和治疗 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | MD Anderson癌症中心前列腺癌孢子。核心1:生物统计学和生物信息学核心 |
资金来源: | NIH / NCI. |
角色: | 共同董事 |
标题: | 早期检测研究网络:数据管理和协调中心188bet体育网址 |
资金来源: | 来自Fred Hutchinson Cancer Research Cen188bet体育网址ter / NIH / NCI的Subaward |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 免疫抑制微环境中的急性髓系白血病- CPRIT MIRA Core 3 -生物统计学/生物信息学 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址 |
角色: | 核心导演 |
标题: | AML / MDS旗舰3 Moonshot项目 |
资金来源: | MD安德森癌症中心Moonshot |
角色: | 生物静止学家 |
标题: | 结合临床流行病学和宏基因组学开发预测抗生素耐药微生物定殖和感染结果的模型 |
资金来源: | NIH |
角色: | 联合原代导师 |