肯Chen博士。
生物信息学和计算生物学,基础科学部的部
关于陈博士
陈博士在清华大学(北京)获得学士学位,在伊利诺伊大学香槟分校获得博士学位,在加州大学圣地亚哥分校接受博士后培训。2005年至2011年,他在位于圣路易斯的华盛顿大学医学院(Washington University School of Medicine)担任高级科学家和研究人员。188bet体育网址拥有机器学习、统计信号处理和癌症基因组学的背景,他的主要目标是开发计算工具来分析和解释人类基因组学和临床数据,从而实现基因组医学。陈竺设计、开发和联合开发的一套计算工具,如跳霹雳舞,系波峰,BreakTrans, BreakFusion, PolyScan SomaticSniper, VarScan,已被广泛应用于描述个人和人口基因组学等各种大型下一代测序项目的癌症基因组图谱(TCGA)和1000人基因工程。他特别感兴趣的是全面和准确地构建各种癌症细胞群体的基因组和转录组,以了解异质性和癌症的进化作为遗传学和环境的结果。他还对开发综合方法来识别对诊断和预后有用的生物标记物感兴趣。关于他的研究小组的更多信息可以参考188bet体育网址在这里。
目前职称及所属单位
主要的约会
副教授,生物信息学系与计算生物学,定量科学部,得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学,休斯敦,得克萨斯州
谢赫·哈利法·本·扎耶德·阿勒纳哈扬个性化癌症治疗研究所生物信息学主任,休斯敦,德克萨斯州
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学休斯敦健康科学中心生物医学科学研究生院常规成员
兼职教师,计算机科学系,莱斯大学,休斯敦,得克萨斯州
教育和培训
授予学位教育
2004年 | 伊利诺伊大学香槟分校,伊利诺伊州,美国,PHD,电子和计算机工程大学 |
1996 | 清华大学,北京,中国,北京,精密仪器 |
研究生培养
2004- 2005年 | 188bet体育网址加州大学圣迭戈分校生物化学与生物物理学研究员 |
体验和服务
学术约会
助理教授,定量科学部,得克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿大学,TX,二○一一年至2016年
188bet体育网址研究教师,遗传学,华盛顿大学,圣路易斯,密苏里州,2009年科 - 2011
其他的约会/责任
资深科学家,该基因组研究所在医学,圣路易斯,密苏里州,2005年的华盛顿大学医学院 - 2011
实习生,微软亚洲研究院,北京,二零零188bet体育网址一年至2001年
荣誉和奖励
2016 | 安德鲁·萨宾家庭院士 |
2016 | 提名,罗伯特·张伯伦杰出导师奖 |
2014 | 《ICGC-TCGA DREAM 8.5 Somatic Mutation Calling Challenge》最佳表演奖,dreamchallenge.org |
2003 | 披披卡帕,伊利诺伊大学厄巴纳 - 香槟分校 |
专业的会员
美国癌症研究协会188bet体育网址
积极成员,2012年至今
国际社会对计算生物学
成员,2011年-至今
电气电子工程师学会
高级会员,2009年至今
选定的出版物
同行评议的文章
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邀请的文章
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- 纳文NE,陈ķ。根据单细胞数据对肿瘤克隆进行基因分型。Nat方法13(7):555 - 2016。PMID: 27355792。
拨款及合约支持
标题: | 描述癌症基因组的异质性结构复杂性 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 1000个基因组项目结构变异的综合分析(U41) |
资金来源: | 美国国家卫生研究院/国家癌症研究所(杰克逊实验室附属奖) |
角色: | 首席研究员,MDACC |
标题: | 联合细胞类型识别泛组学单细胞数据集成 |
资金来源: | 陈扎克伯格倡议 |
角色: | 首席研究员 |