特拉弗哈特博士。
生物信息学与计算生物学系,基础科学部
目前职务及所属单位
主要的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息学和计算生物学系助理教授
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心癌症生物学系助理教授
教育和培训
授予学位教育
2008 | 美国德克萨斯大学奥斯汀分校,细胞与分子生物学博士 |
2003 | 德克萨斯大学奥斯汀分校,美国德克萨斯州奥斯汀,学士,中东研究 |
研究生培训
2012 - 2015 | 多伦多大学癌症功能基因组学博士后 |
2009 - 2012 | 加州斯克里普斯研究所基因组学/免疫学博士后188bet体育网址 |
选定的出版物
同行评议的文章
- Wang C, Wang G, Feng X, Shepherd P, Zhang J, Tang M, Chen Z, Srivastava M, McLaughlin ME, Navone NM, Hart GT, Chen J.全基因组CRISPR筛选显示RNASEH2缺陷和ATR抑制的合成致死率。致癌基因38(14):2451 - 2463年,2019年。e-Pub 2018。PMID: 30532030。
- 黄S,金CY,杨S,金E, Hart T, Marcotte EM,李I.人类网络v2:用于疾病研究的人类基因网络。188bet体育网址核酸Res 47(D1):D573-D580, 2019。e-Pub 2018。PMID: 30418591。
- Noordermeer SM,亚当年代,Setiaputra D, Barazas M,佩蒂特是SJ,凌AK, Olivieri M, Alvarez-Quilon, Moatti N,齐默尔曼,Annunziato年代,Krastev DB,歌F, Brandsma我Frankum J,布拉夫R, Sherker,兰德里,西拉德RK, Munro MM,麦克尤恩,Goullet de Rugy T,林ZY,哈特T,莫法特J, Gingras AC,马丁,van Attikum H, jonker J, CJ勋爵罗滕贝格,杜洛彻,D.shield复合物介导53bp1依赖的DNA修复。自然560(7716):117 - 121年,2018年。e-Pub 2018。PMID: 30022168。
- Zimmermann M, Murina O, Reijns MAM, Agathanggelou A, Challis R, Tarnauskaite Ž, Muir M, Fluteau A, Aregger M, McEwan A, Yuan W, Clarke M, Lambros MB, Paneesha S, Moss P, Chandrashekhar M, Angers, Moffat J, Brunton VG, Hart T, de Bono J, Stankovic T, Jackson AP, Durocher D.CRISPR筛选确定基因组核糖核苷酸是parp诱捕病变的来源。自然559(7713):285 - 289年,2018年。e-Pub 2018。PMID: 29973717。
- 林忠礼,林忠礼,林忠礼.PICKLES:聚合体外CRISPR敲除文库关键筛选数据库。核酸Res 46(D1):D776-D780, 2018。PMID: 29077937。
- 哈特T通AHY陈K, Van Leeuwen J, Seetharaman,沙土荒漠M, Chandrashekhar M, Hustedt N,赛斯年代,努南,Habsid, Sizova O, Nedyalkova L, Climie R, Tworzyanski L,劳森K, Sartori MA Alibeh年代,越南计量D,马苏德•年代,Mero P,维斯,布朗KR Usaj M, Billmann M,拉赫曼M, Constanzo M,迈尔斯CL,安德鲁斯BJ,布恩C, Durocher D,莫法特J.CRISPR/SpCas9全基因组敲除筛选的评估和设计。北京航空航天大学学报(自然科学版)7(8):2719-2727,2017。e-Pub 2017。PMID: 28655737。
- Steinhart Z, Pavlovic Z, Chandrashekhar M, Hart T, Wang X, Zhang X, Robitaille M, Brown KR, Jaksani S, Overmeer R, Boj SF, Adams J, Pan J, Clevers H, Sidhu S, Moffat J, Angers.全基因组CRISPR屏幕显示Wnt-FZD5信号通路是rnf43突变胰腺肿瘤的一个可药物脆弱性。中华医学杂志23(1):60-68,2017。e-Pub 2016。PMID: 27869803。
- 哈特T,莫法特J.百吉饼:从汇集的文库屏幕中识别基本基因的计算框架。BMC生物信息学17:164,2016。e-Pub 2016。PMID: 27083490。
- Hart T, Chandrashekhar M, Aregger M, Steinhart Z, Brown KR, MacLeod G, Mis M, Zimmermann M, Fradet-Turcotte A, Sun S, Mero P, Dirks P, Sidhu S, Roth FP, Rissland OS, Durocher D, Angers, Moffat J.高分辨率CRISPR筛选揭示健康基因和基因型特异性癌症的责任。细胞163(6):1515 - 26日,2015年。e-Pub 2015。PMID: 26627737。
- 托莱多厘米,丁Y, Hoellerbauer P,戴维斯RJ, Basom R,吉拉德EJ,李E,科林P,哈特T, Bolouri H,戴维森J,张问,Hardcastle J, Aronow BJ, Plaisier CL, Baliga NS,莫法特J,林问,李XN,南DH,李J波拉德SM,朱J, Delrow JJ,克拉曼,奥尔森JM, Paddison PJ.全基因组CRISPR-Cas9筛选显示胶质母细胞瘤干细胞样细胞中PKMYT1和WEE1之间的冗余缺失。中国生物医学工程学报,2015,33(11):2425- 39,2015。e-Pub 2015。PMID: 26673326。
- Pandyra AA, Mullen PJ, Goard CA, Ericson E, Sharma P, Kalkat M, Yu R, Pong JT, Brown KR, Hart T, Gebbia M, Lang KS, Giaever G, Nislow C, Moffat J, Penn LZ.全基因组RNAi分析显示,同时抑制特定的甲戊酸通路基因可增强肿瘤细胞的死亡。Oncotarget 6(29): 26909 - 2015。PMID: 26353928。
- Vu V, Verster AJ, Schertzberg M, Chuluunbaatar T, Spensley M, Pajkic D, Hart GT, Moffat J, Fraser AG.基因表达的自然变异调节突变表型的严重程度。细胞162(2):391 - 402年,2015年。PMID: 26186192。
- Hart T, Brown KR, Sircoulomb F, Rottapel R, Moffat J.测量基因组干扰筛选的错误率:人类功能基因组学的黄金标准。Mol Syst Biol 10:733, 2014。e-Pub 2014。PMID: 24987113。
- haugimana PC, Hart GT, Nepusz T, Yang H, Turinsky AL, Li Z, Wang PI, Boutz DR, Fong V, Phanse S, Babu M, Craig SA, Hu P, Wan C, Vlasblom J, Dar VU, Bezginov A, Clark GW, Wu GC, Wodak SJ, Tillier ER, Paccanaro A, Marcotte EM, Emili A.人类可溶性蛋白复合物的普查。细胞150(5):1068 - 81年,2012年。PMID: 22939629。
- Narayanaswamy R, Moradi EK, Niu W, Hart GT, Davis M, McGary KL, Ellington AD, Marcotte EM.沿着主极化轴的蛋白质组分的系统定义揭示了信息素处理芽殖酵母中极化机制的适应性重用。中国生物医学工程学报,2012,30(1):1 - 8。PMID: 19053807。
- Ramani AK, Li Z, Hart GT, Carlson MW, Boutz DR, Marcotte EM.从人类mrna的共表达及其同源性衍生出的人类蛋白质相互作用图。Mol Syst Biol 4:180, 2008。e-Pub 2008。PMID: 18414481。
- Hart GT, Lee I, Marcotte ER.酵母蛋白复合物的高精度共识图揭示了基因本质的模块化性质。BMC生物信息学8:236,2007。e-Pub 2007。PMID: 17605818。
- 哈特GT,拉马尼AK,马克特EM.目前酵母和人类蛋白质相互作用网络的完整程度如何?中国生物医学工程学报7(11):120,2006。PMID: 17147767。
授权与合同支持
标题: | 利用人类细胞中的基因重要性模式预测基因功能、合成致死率和癌症靶点 |
资金来源: | NIH /美国 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 识别前列腺癌新治疗靶点的合成基本方法 |
资金来源: | 前列腺癌基金会 |
角色: | 共同 |
标题: | 三阴性乳腺癌化疗耐药和多器官转移的肿瘤内异质性特征和靶向性 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 导师 |