Wenyi王博士。
生物信息学与计算生物学系,基础科学部
关于王博士
王文义教授是一位大数据科学家,拥有统计学和生物学的学术背景。她的主要兴趣在于利用数据争论来理解癌症多组学产生的大数据。她的实验室的统计方法和工具开发是数据驱动的,并以解决重要和新颖的生物学问题为动力。
她的实验室网站是:https://odin.mdacc.tmc.edu/~wwang7/.
目前职务及所属单位
主要的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部生物信息学与计算生物学系副教授(终身教授188bet体育网址
双/共同/兼职的约会
德克萨斯农工大学统计学系兼职教授
188bet体育网址研究兴趣
实验室目前主要研究方向为:188bet体育网址
1)利用转录组和基因组数据(基因组间数据)的计算反褶积,从大样本和单细胞测序数据获得肿瘤异质性和进化。我们的目标是了解a)肿瘤微环境可能导致预后或治疗反应的不同结果,b)正常组织中细胞-细胞相互作用的分子机制。
2)个性化癌症风险预测模型,以TP53突变相关Li-Fraumeni综合征作为疾病模型;以及新的统计模型和研究设计,以进一步了解TP53突变对泛癌症的影响。
该实验室根据需要使用统计/计算工具箱,包括深度学习方法。我们目前的重点是高维数据中的混合建模和机器学习。
教育和培训
授予学位教育
2007 | 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院,美国巴尔的摩医学博士,生物统计学博士 |
2003 | 哥伦比亚大学内科医生和外科医生学院,纽约市,美国,马萨诸塞州,人类营养 |
2001 | 复旦大学生物学学士 |
体验和服务
学术任命
德克萨斯大学安德森癌症中心定量科学部生物信息学和计算生物学系助理教授,休斯顿,德克萨斯州,2010 - 2015年
行政任命/责任
招生委员会成员,gbs,休斯顿,德克萨斯州,2018 - 2020
德克萨斯大学休斯顿分校生物医学科学研究生院定量科学项目联合主任,德克萨斯州休斯顿,2014 - 2018年
其他的约会/责任
美国统计协会统计遗传学和基因组学分会项目主席,弗吉尼亚州亚历山大,2018 - 2018年
贝勒医学院定量计算生物学研究生项目教员,休斯顿,德克萨斯州,2017年至今
荣誉和奖励
2014 | 德克萨斯大学休斯顿分校生物医学科学研究生院对研究生教育的杰出服务 |
2011 | 恒星摘要奖,第五届数量基因组学年度计划,哈佛大学公共卫生学院 |
2008 | 简和史蒂夫·迪卡兹奖,约翰·霍普金斯大学,马里兰州巴尔的摩市 |
2008 | 美国大学优等生学会会员,约翰霍普金斯大学优等生学会分会会员 |
2008 | 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院德尔塔·欧米茄·阿尔法入会会员 |
2007 | 第十一届国际计算与分子生物学研究会议旅行奖188bet体育网址 |
2006 | 国际遗传流行病学协会第十五届年会旅行奖 |
2005 | 6月B. Culley奖,约翰霍普金斯大学,巴尔的摩,医学博士 |
1997 | 复旦大学人民奖学金中国上海 |
1994 | 复旦大学荣誉科学项目,上海,中国 |
选定的出版物
同行评议的文章
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- Ewing AD, Houlahan KE, Hu Y, Ellrott K, Caloian C, Yamaguchi TN, Bare JC, P 'ng C, Waggott D, Sabelnykova VY;ICGC-TCGA DREAM体细胞突变呼叫挑战赛参与者:Kellen MR, Norman TC, Haussler D, Friend SH, Stolovitzky G, Margolin AA, Stuart JM, Boutros PC。.将肿瘤基因组模拟与众包相结合,实现体细胞单核苷酸变异检测的基准。自然的方法。e-Pub 2015。
- Davis CF等人,癌症基因组图谱研究网络。188bet体育网址.嫌色肾细胞癌的体细胞基因组景观。癌症细胞。e-Pub 2014。
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授权与合同支持
标题: | TCGA数据分析与转化应用综合管道(GDAC)补充 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 共同 |
标题: | 19q家族性Wilms肿瘤易感基因的下一代基因组序列鉴定 |
资金来源: | 德州癌症预防与研究所188bet体育网址 |
角色: | 共同 |
标题: | TCGA数据分析与转换应用的集成管道(GDAC) |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 共同 |
标题: | TCGA数据分析与转换应用的集成管道(GDAC) |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 共同 |
标题: | 黑色素瘤中NF1功能缺失的改变:新的分类、分子机制和翻译应用 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 咨询委员会成员 |
标题: | 液体活检选择治疗复发性炎性乳腺癌 |
资金来源: | 美国癌症研究协会188bet体育网址 |
角色: | OSC |