Wenyi王博士。
生物信息学与计算生物学系,基础科学部
关于王博士
王文义教授是一位大数据科学家,具有统计学和生物学的学术背景。她的主要兴趣在于利用数据争论来理解癌症多组学产生的大数据。她的实验室的统计方法和工具开发是数据驱动的,并以解决重要和新颖的生物学问题为动力。
她的实验室网站位于:https://odin.mdacc.tmc.edu/~wwang7/.
目前职务及所属单位
主要任命
德克萨斯大学安德森癌症中心定量科学部生物信息学和计算生物学系教授
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心生物统计学系定量科学部教授
德州农工大学统计学系教授
188bet体育网址研究兴趣
实验室目前的主要研究重点是:188bet体育网址
1) 利用转录组和基因组数据(inter-gromics)的计算反褶积,从大样本和单细胞测序数据中分析肿瘤异质性和进化。我们的目标是了解a)可能导致不同预后或治疗反应的肿瘤微环境,b)正常组织中细胞间相互作用的分子机制。
2) 个性化癌症风险预测模型,使用TP53突变相关的Li-Fraumeni综合征作为疾病模型;以及新的统计建模和研究设计,以进一步了解TP53突变对泛癌的影响。
实验室根据需要使用统计/计算工具箱,包括深度学习方法。我们目前的重点是高维数据中的混合建模和机器学习。
教育和培训
授予教育
2007 | 约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院,美国巴尔的摩医学博士,生物统计学博士 |
2003 | 哥伦比亚大学内科医生和外科医生学院,纽约市,美国,马萨诸塞州,人类营养 |
2001 | 复旦大学生物学学士 |
体验和服务
行政任命/责任
2018-2020年德克萨斯州休斯顿市GSBS招生委员会成员
定量科学计划合作主任,德克萨斯大学生物医学研究生院在休斯敦,休斯敦,德克萨斯州,2014 - 2018
其他任命/职责
贝勒医学院定量计算生物学研究生项目教员,休斯顿,德克萨斯州,2017年至今
选定的出版物
同行评议的文章
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- 申淑娟,李娟,宁杰,Bojadzieva J, Strong LC,王伟.半参数复发事件模型的贝叶斯估计及其在Li-Fraumeni综合征多原发癌外显率估计中的应用生物统计学21(3):467 - 482年,2020年。e-Pub 2018。PMID: 30445420。
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- 张宁,徐勇,O’hely M,速度TP, Scharfe C,王伟.SRMA:用于重测序阵列数据分析的R包。生物信息学28(14):1928 - 2012。e-Pub 2012。PMID: 22581181。
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- 莫里斯JS,哈桑MM,佐纳叶,王Z,肖L,拉希德A,哈克A,阿卜杜勒瓦哈布R,穆罕默德易,巴拉德吉隆坡,沃尔夫拉,乔治B,李L,艾伦G,韦兰特M,李D,王W,拉格哈夫K,姚J,阿明HM,卡塞博AO.肝动物 - 14:生物异质性测量显着提高了对肝细胞癌风险的预测。肝脏。E-PUB 2020. PMID:32931023。
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- 方,afshar pt,chibber a,mohiyuddin m,风扇y,mu j,gibeling g,bars,asadi nb,gerstein m,koboldt d,王伟,黄色,林H..一种使用SOMITALSEQ准确地检测SO-Matic突变的集合方法。基因组生物学。e-Pub 2015。
书章节
- 王伟,风扇Y,速度T. DNA变体呼叫目标测序数据。在:统计生物信息学的进步:高吞吐量的模型和综合推理。剑桥大学出版社:纽约,2013年。
赠款和合同支助
标题: | TP53种系突变家族癌症风险预测的统计方法和工具 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 神经视网膜的细胞图谱 |
资金来源: | Chan Zuckerberg倡议通过Subaward Bayly医学院 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 改善Li-Fraumeni综合征的风险预测:临床医疗服务提供者的实用工具 |
资金来源: | 德州癌症预防与研究所188bet体育网址 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 间变性甲状腺癌的肿瘤内异质性:对新辅助BRAF和免疫导向治疗反应的影响 |
资金来源: | 标志基金会 |
角色: | 共同主体调查员 |
标题: | 原发性和转移性结直肠癌亚克隆扩增和免疫环境的综合基因组分析 |
资金来源: | MD安德森孢子在胃肠道癌症发展研究计划奖188bet体育网址 |
角色: | 首席研究员 |