来认识一下尼古拉斯·纳文博士。
尼古拉斯·纳文博士。
遗传学系,基础科学部
关于纳文博士
纳文博士是一位副教授在MD安德森癌症中心,在生物信息学系的联合任命。他在生物医学科学的德克萨斯大学MD安德森癌症中心UTHealth研究生院教员。他也是CPRIT单细胞基因组中心(单核)和先进技术基因组学核心的MD安德森的联合主任(ATGC)的董事。
他迈克尔·威格勒博士导师下进行的冷泉港实验室他的研究生培养和博士后训练。在此期间,他发明用于测序的哺乳动物细胞的基因组中的第一单电池的DNA测序方法(单核测序)(纳文等人2011,自然)。这项工作在建立单细胞基因组学领域发挥着举足轻重的作用。在纳文实验室继续在单细胞癌基因组学领域,在那里他们发现了三阴性乳腺癌拷贝数变化的间断模型(Gao等人。2016年,自然遗传学)的前列,并阐明了作用突变phentoypes在乳腺癌演变亚克突变(Wang等人。2014年,自然)。
除了创新的计算和统计方法来分析产生的大规模数据集,Navin博士的团队继续在开发新的单细胞DNA和RNA测序技术方面发挥先锋作用。这些方法被用于研究肿瘤在侵袭、转移和治疗耐药的背景下的进化。他的实验室与MD Anderson的顶尖肿瘤学家和病理学家密切合作,将这些技术应用于临床,为降低人类患者的发病率带来重大影响。
由于他的工作,纳文博士获得了许多著名的奖项,包括戴蒙- runyon创新者奖、美国科学促进会Wachtel奖、ACS研究学者奖、威尔逊斯通奖、兰德尔创新者奖和MD安德森卓越研究总裁奖。188bet体育网址
访问纳文博士的实验室网站。查看完整列表纳文博士的出版物。纳文博士 -谷歌学术
当前标题及所属机构
主要预约
副教授,遗传学系,基础科学研究科,得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学,休斯敦,得克萨斯州188bet体育网址
董事,CPRIT单细胞基因组中心,遗传学系,基础科学研究,得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学,休斯敦,得克萨斯州的科188bet体育网址
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部,遗传学系,先进技术基因组核心,副主任188bet体育网址
双/合资/兼职任命
副教授,生物信息学系与计算生物学,得克萨斯大学MD安德森癌症中心的大学,休斯敦,得克萨斯州
副教授,生物医学科学的得克萨斯大学MD安德森癌症中心UTHealth研究生院的大学,休斯敦,得克萨斯州
188bet体育网址研究兴趣
单细胞基因组学;癌症演进;液体活检基因组学;计算生物学
我们集团已率先单细胞基因组测序技术,这是我们适用于理解人类癌症,包括肿瘤发生,侵袭,转移和治疗性复杂的生物过程的发展。我们研究癌症的进化过程,其中克隆经历选择和扩张响应于选择压力。我们了解肿瘤的复杂的生态系统,其由肿瘤细胞和间质细胞类型之间的相互作用复杂的维护。我们的使命是为了获得能够被用来改善生活和减少发病癌症患者的肿瘤质量演化的新知识。在MD安德森,我们有得天独厚的优势,以我们的基因组技术转化为诊所,在那里,他们正准备做早期发现,诊断和癌症患者的治疗策略产生重大影响。
教育与培训
授予学位教育
2010 | 冷泉港实验室和石溪大学,冷泉港,NY,USA,PHD,分子遗传学 |
2003 | 斯基德莫尔学院,萨拉托加斯普林斯,美国纽约,理学学士,细胞生物学 |
研究生培养
2010-2011 | 博士后研究员,癌症遗传学,冷泉港实验室,冷泉港,NY |
体验与服务
学术约会
2011 - 2016年,德克萨斯大学休斯顿分校安德森癌症中心定量科学系生物信息学与计算生物学助理教授
助理教授,遗传学系,基础科学研究科,得克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿大学,得克萨斯州,2011至16年188bet体育网址
助理教授,德克萨斯大学MD安德森癌症中心的生物医学科学的UTHealth研究生院,休斯顿大学,得克萨斯州,2011年至2016年
荣誉与奖励
2019 | 总统的杰出研究奖,美国德克萨斯大学医学博士的188bet体育网址安德森癌症中心 |
2019 | 布拉瓦尼克奖在生命科学,国家入围 |
2018 | 教师教育家奖,德克萨斯大学安德森癌症中心 |
2018 | 在基础研究上达拉斯/沃斯堡活着的传奇教授成就奖,美国德克萨斯大学医学博士的安德森癌症中心188bet体育网址 |
2017年 | 杰克和贝弗利兰德尔癌症治疗杰出奖,兰德尔家族基金会 |
2017年 | 挑战奖,前列腺癌基金会 |
2017年 | 40 40岁以下的奖,斯托尼布鲁克大学 |
2016 | 总统学者奖,美国德克萨斯大学医学博士的安德森癌症中心 |
2016 | 萨宾奖学金,安德鲁·萨宾家庭基金会 |
2016 | 美国癌症188bet体育网址学会(ACS)研究学者 |
2016 | 德克萨斯大学安德森癌症中心,校长对卓越教员的认可 |
2016 | 学院学者奖,得克萨斯州医学博士安德森癌症中心的大学 |
2015年 | AAAS马丁玫瑰Wachtel先生奖,美国科学促进会 |
2014 | 教师教育家奖,德克萨斯大学安德森癌症中心 |
2013 | 徐t.c.奖,青年研究者奖 |
2013 | 威尔逊S.石纪念奖 |
2013 | 金石奖,威尔逊石基 |
2013 | 达蒙 - 鲁尼恩创新奖,达蒙 - 鲁尼恩Rachleff基金会 |
2010 | 青年研究者奖,基因组技术杂志 |
2009年 | T32 NCI研究员,国家癌症研究所 |
2009年 | 亚伯拉罕奖,石溪大学 |
2008年 | 国王和米勒奖学金,石溪大学 |
2006年 | 科学海报奖,分子遗传学研讨会,石溪,NY |
2005年 | 林德斯-戈德堡奖学金,冷泉港实验室 |
发表论文
同行评议的文章
- 戴维斯A,高R,纳文Ñ。SCOPIT:计算样本量为单细胞测序实验。BMC生物信息学20(1):566,2019年PMID:31718533。
- 扎法尔H,纳文N,陈K,Nakhleh大号。SiCloneFit:人口结构,基因型,和从单细胞基因组测序数据肿瘤克隆的系统发育的贝叶斯推理。基因组RES(11):1847年至1859年,2019年PMID:31628257。
- 王峰,梁S,库马尔T,纳文N,陈凯。SCMarker:单细胞转录组分析的从头选择标记。PLoS Comput Biol 15(10):e1007445, 2019。PMID: 31658262。
- 玉米PG,希思EI,苏里塔A,拉梅什N,小L,SEI E,李宁塔皮亚E,涂SM,Subudhi SK,王静,王X,Efstathiou E,汤普森TC,特龙科索P,纳文N,LogothetisCJ,阿帕里西奥AM。卡巴他赛联合卡铂的男性患有转移性去势抵抗性前列腺癌治疗:一项随机,开放标签,阶段1-2试验。刺血针20 ONCOL(10):1432至1443年,2019年PMID:31515154。
- 张,熊S,刘B,潘特V,西利F,周G, Elizondo-Fraire AC,杨P,你MJ, El-Naggar AK, Navin NE, Lozano G。体细胞Trp53突变差异驱动乳腺癌和转移的演变。Nat Commun 9(1):3953, 2018。e-Pub 2018。PMID: 30262850。
- Kim C & Gao R, Sei E, Brandt R, Hartman J, Hatshek T, Crosetto N, Foukakis T和Navin N。。耐药演化三重阴性乳腺癌笔下的单细胞测序。细胞173(4):879-893,2018。PMID:29681456。
- Casasent AK,Schalck A,高R,SEI E,龙甲,Pangburn W,Casasent T,梅里克-Bernstam楼埃杰顿ME,NE纳文。乳腺肿瘤的多克隆侵袭由地形单细胞测序鉴定。细胞172(2):205 - 217年,2018年。PMID: 29307488。
- 梁ML,戴维斯A,高R,Casasent A,王Y,SEI E,维拉尔E,丸d,Kopetz,纳文,N。单细胞DNA测序揭示转移性结直肠癌后期的传播模式。基因组RES 27(8):1287至1299年,2017年PMID:28546418。
- 高,Davis A, McDonald TO, Sei E, Shi X, Wang Y, Tsai PC, Casasent A, Waters J, Zhang H, m - bernstam F, Michor F, Navin NE。间断复制在三阴性乳腺癌数的演化和克隆瘀。纳特遗传学48(10):1119至1130年,2016年电子公布2016 PMID:27526321。
- 曼KM,纽伯格JY,黑MA,琼斯DJ,阿马亚 - 曼萨纳雷斯楼古斯曼 - 罗哈斯L,儿玉T,沃德JM,防锈AG,范·德尔·维登L,红豆杉CC,沃特斯JL,梁ML,罗杰斯K,罗杰斯SM,McNoe LA,Selvanesan L,纳文N,詹金斯NA,科普兰NG,曼恩MB。分析肿瘤的异质性和在单粒细胞性白血病细胞与SBCapSeq驱动基因。自然生物技术34(9):962-72,2016年PMID:27479497。
- 扎法尔H,王Y,Nakhlem L,纳文N,陈ķ。Monovar:单核苷酸变异的检测单细胞中。自然的方法,2016年PMID:27088313。
- 梁ML,王Y,金C,高R,江Ĵ,SEI E,NE纳文。高度从单核复针对性DNA测序。纳特Protoc 11(2):214-35,2016年电子公布2016 PMID:26741407。
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- Molhatra A,王Y,沃特斯Ĵ,我馆,纳文ñ。倍性-SEQ:通过测序多倍体肿瘤细胞亚群推断突变年表。基因组医学7(1):6,2015年PMID:25729435。
- 王,沃斯杰,翁鲁阿,卢威,史,陈,谢普,瓦塔泰尔斯,梁H,穆尔塔尼A,张H,赵R,米何F,麦里斯-伯恩斯坦F,纳文奈。。在乳腺癌克隆演变揭示的单核基因组测序。自然512(7513):155-60,2014年PMID:25079324。
- Baslan T, Kendall J, Troge J, Stepansky A, Wigler M, Navin N, Hicks J。全基因组单细胞的拷贝数分析。性质协议7(6):1024至1041年,2012。PMID:22555242。
- Navin N, Kendall J, Troge J, Rodgers L, Cook K, Stepansky A, Levy D, Lee Y, Esposito D, Muthuswamy L, Hicks J, Wigler M。肿瘤演进推断由单细胞测序。性质7(472):90-4,2011。PMID:21399628。
- Malihi PD,格拉夫RP,Rodriguez的A,拉梅什N,李Ĵ,萨顿R,Jiles R,Ruiz的Velasco的C,SEI E,Kolatkar A,Logothetis C,纳文NE,玉米P,阿帕里西奥AM,Dittamore R,希克斯Ĵ,库恩P,苏里塔AJ。单细胞循环肿瘤细胞分析显示,基因组不稳定是侵袭性前列腺癌的一个显著特征。Clin Cancer Res. e-Pub 2020。PMID: 32341031。
特邀文章
- 王,Navin N。进展和单细胞测序技术的应用。分子细胞58(4):598-609,2015年PMID:26000845。
格兰特和合同支持
标题: | 集成的单细胞基因组学核心设施 |
资金来源: | 德州癌症预防和研究所(CPRIT)188bet体育网址 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 在三阴乳腺癌患者与单细胞测序研究化疗耐药进化 |
资金来源: | 莱夫科夫斯基基金会 |
角色: | 首席研究员 |
标题: | OMIC和转移性乳腺癌的多维空间Atlas和前列腺癌(OMS图集) |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 联合调查 |
标题: | 使用新的测序技术表征癌症基因组不稳定和平移的影响 |
资金来源: | 德州癌症预防和研究所(CPRIT)188bet体育网址 |
角色: | 联合调查 |
标题: | 调查突变进化和肿瘤内异质性TNBC |
资金来源: | 美国癌症协会(ACS) |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 防止导管原位癌侵入过度治疗现在 - PRECISION |
资金来源: | 英国癌症研究中188bet体育网址心 |
角色: | 联合调查 |
标题: | LC170171肿瘤异质性和在小细胞肺癌的治疗抗性(SCLC) |
资金来源: | 国防部(DOD) |
角色: | 联合调查 |
标题: | 乳腺癌登月 |
资金来源: | UTMDACC登月计划 |
角色: | 联合调查 |
标题: | 前列腺癌登月 |
资金来源: | UTMDACC登月计划 |
角色: | 联合调查 |
标题: | AML / MDS登月 |
资金来源: | UTMDACC登月计划 |
角色: | 联合调查 |
标题: | 通过抑制EGLN平移肠辐射防护提高不可切除胰腺癌临床结果 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 联合调查 |
标题: | 使用单细胞基因组描绘抵抗HER2靶向治疗的演变在乳腺癌 |
资金来源: | 姊妹机构网络基金,UTMDACC |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 转移性乳腺癌患者治疗耐药的空间组学分析 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 联合调查 |
标题: | 人类乳腺细胞图谱种子网络 |
资金来源: | 陈扎克伯格倡议 |
角色: | 协调PI |
标题: | 与单细胞基因组划定多器官转移的演变乳腺癌 |
资金来源: | 埃默森集合资金,UTMDACC |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 与单细胞基因组划定化疗耐药的演变和生态乳腺癌 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 首席研究员 |
标题: | 空间单细胞基因组学研究恶性前乳腺癌的肿瘤起始和侵袭 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 首席研究员 |