Mark T. Bedford博士
基础科学部表观遗传与分子癌变学系
关于贝德福德博士
贝德福德博士的实验室专注于两个研究课题:188bet体育网址1)阐明精氨酸甲基化的生物学作用——精氨酸甲基化是一种涉及信号转导、转录控制和DNA修复的丰富修饰,2)开发一个蛋白质结构域微阵列平台来研究翻译后修饰在信号转导中驱动蛋白-蛋白相互作用中的作用。他们已经为这些精氨酸甲基转移酶建立了靶向破坏和功能获得小鼠模型,主要关注于CARM1。利用他们的蛋白结构域芯片平台,他们已经鉴定和表征了新的蛋白质相互作用;他们使用这些阵列来“读取”组蛋白密码。他们已经确定了一些与赖氨酸和精氨酸甲基化基序相互作用的新蛋白质,以及与能与这些相互作用竞争的小分子相互作用的新蛋白质。最近,贝德福德实验室扩大了他们的阵列平台,包括所有的人类磷酸化解读域,乙酰解读域,以及大部分的人类PDZ结构域和泛素结合结构域。
目前职务及工作关系
主要的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心表观遗传学和分子致癌学系教授
188bet体育网址研究兴趣
贝德福德实验室研究表观遗传学和癌症之间的交集,特别关注一类表观遗传学标记-精氨酸甲基化。为了更好地理解精氨酸甲基化的生物学作用,他们的研究小组使用了许多不同的生物学方法来询问PRMT的功能。188bet体育网址这些包括小鼠功能增加和丢失的PRMT模型、甲基结合蛋白的蛋白质微阵列筛选、PRMT底物的生化筛选和PRMT家族成员的化学抑制剂筛选。他们已经在小鼠体内产生了一些精氨酸甲基转移酶基因的靶向破坏,希望揭示这种翻译后修饰的细胞和组织特异性作用。目前他们有CARM1, PRMT3和PRMT6缺失小鼠。他们正在对这些空鼠进行转录组分析(RNA-seq)和ChIP-seq,以确定它们调节的基因库。贝德福德小组也在进行双敲除以研究不同prmt之间的冗余。他们还建立了功能获得转基因小鼠模型,以确定PRMT在体内过表达的影响。这些是转基因小鼠,可以通过跨越到一个组织特异性cre系激活。Cre表达去除lox/STOP/los盒,激活PRMT的表达。 They have already generated PRMT6 gain-of-function mice using this approach. They are currently producing CARM1, PRMT1, PRMT5 and TDRD3 transgenic mice using the same approach.
教育和培训
授予教育
1996 | 魏茨曼科学研究所,ISR,博士,发育生物学 |
1989 | Stellenbosch大学,ZAF,硕士,医学生物化学 |
1986 | Stellenbosch大学,ZAF,理学学士,生物化学荣誉 |
1985 | Stellenbosch大学,ZAF,BS |
研究生培训
1996-2000 | 博士后团契,哈佛医学院,波士顿,马 |
选定的出版物
同行评议的文章
- Avasarala S,Wu Py,Khan Sq,Yanlin S,Van Scoyk M,Bao J,Di Lorenzo A,David O,Bedford Mt,Gupta V,Winn Ra,Bikkavilli RK.PRMT6通过肿瘤相关巨噬细胞的交替激活促进肺肿瘤进展。Mol Cancer Res 18(1):166- 178,2020。e-Pub 2019。
- Manickavinayaham S,Vélez-Cruz R,Biswas Ak,Bedford E,Klein Bj,Kutateladze Tg,Liu B,Bedford Mt,Johnson DG.E2F1乙酰化直接P300 / CBP介导的DNA双链突破的组酮乙酰化,以促进修复。NAT Commun 10(1):4951,2019。
- Bao J,Di Lorenzo A,Lin K,Lu Y,Zhong Y,Sebastian MM,Muller WJ,Yang Y,Bedford Mt.小鼠过表达模型揭示了不同I型蛋白精氨酸甲基转移酶的不同致癌作用。癌症研究79(1):21-32,2019。e-Pub 2018。
- Wu X, Liu S, Sagum C, Chen J, Singh R, Chaturvedi A, Horton JR, Kashyap TR, Fushman D, Cheng X, Bedford MT, Wang B ..在DNA损伤部位的Lys63和Lys11-络合蛋白信号传导之间的串扰由Cezanne驱动。基因DEV 33(23-24):2019年1702-1717。E-PUB 2019。
- Hupalowska A,Jedrusik A,Zhu M,Bedford Mt,Glover DM,Zernicka-Goetz M.CARM1和ParaSpeckles规范预植入小鼠胚胎发育。Cell 175(7):1902-1916,2018。
- Cheng D, Vemulapalli V, Lu Y, Shen J, Aoyagi S, Fry CJ, Yang Y, Foulds CE, Stossi F, Trevino LS, Mancini MA, O'Malley BW, Walker CL, Boyer TG, Bedford MT ..CARM1甲基化MED12调节其RNA结合能力。生活SCI联盟1(5):E201800117,20101817,2018。
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