乍得哈夫博士
流行病学系,癌症预防和人口科学分工
关于哈夫博士
我的研188bet体育网址究重点是通过统计、计算和人口基因组学来理解人类进化和人类疾病的遗传基础。我的工作跨越了人类遗传学的多个分支学科,包括疾病基因鉴定、突变率估计、近期阳性选择的检测和人口历史的重建。我目前主要集中在开发新的方法来分析基因组数据和运用这些方法去发现新奇的见解关于人类疾病的遗传基础,特别强调识别和描述基因增加发展中常见的癌症的风险(结肠癌、乳腺癌、头颈部、肺癌、胰腺癌、前列腺癌、和甲状腺)。主要成就
发表记录良好,有超过20篇同行评议论文,包括3篇科学论文、2篇自然遗传学论文、3篇基因组研究论文,以及一篇分别发表在《美国人类遗传学杂志》、《公共科学图书馆遗传学》和《美国国家科学院学报》上的论文。作为独立调查员,第一年在获得校外资金方面取得了出色的进展,有两份已确定的分包188bet体育网址合同,两份提交的R01提案作为PI,八份提交的R01提案作为共同调查员。变体注释、分析和搜索工具(VAAST)中算法的主要设计者,VAAST是一种用于从下一代序列数据中识别致病变异的工具(专利申请号61/381239)。设计了用于软件包估算最近共享祖先(ERSA)的算法和软件,这大大扩展了可从基因组数据中检测到的家族关系范围(专利申请号61/433921)。188bet体育网址研究兴趣
*从稀有遗传变异分析中识别中间风险和高风险癌症敏感性基因座。*开发方法和软件以识别来自序列数据的疾病导致基因。*从基因组数据开发谱系分析和密码关系识别的新方法。*估算人类突变率。*揭示近期人类阳性选择的遗传基础。*重建人口统计历史。
教育和培训
学位授予教育
2008 | 犹他州盐湖城,犹他州,美国,PHD,生物人类学的大学 |
2004 | 犹他大学,盐湖城,UT,美国,MS,生物人类学 |
1996年 | 密苏里州立大学,美国密苏里州斯普林菲尔德,计算机信息系统学士 |
经验与服务
学术任命
美国德克萨斯大学MD Anderson癌症中心,OVP,癌症预防与人口科学部,休斯敦,2012,2017
其他约会/职责
软件开发人员,怀特海德生物医学研究所,剑桥,马萨诸塞州,2001 - 2002年188bet体育网址
2000-2000年密苏里州圣路易斯市美洲开发银行数据库顾问
数据库架构师,斯托克尔咨询公司,密苏里州圣路易斯,1999-2000年
数据库顾问,圣路易斯,密苏里州,1998 - 1999
数据库顾问,麦肯齐和罗斯,密苏里州圣路易斯,1997-1998
数据库管理员,Southwestern Bell,圣路易斯,莫,1996 - 1997年
荣誉与奖励
2011 | Ruth L. Kirschstein国家研究服务奖(T3188bet体育网址2) |
2010 | 卓越科学AAAS /科学计划 |
1993年 | 密苏里州立大学校长学者 |
1993年 | 密苏里州高等教育学术奖学金 |
1993年 | 国家优秀奖学金 |
专业会员资格
美国科学促进协会
会员,2011年 - 至今
美国人遗传学学会
会员,2010年 - 至今
美国物理人类学家协会
2007年至今成员
选定的出版物
同行评审文章
- 胡锦涛H,发怒的CD.从下一代序列数据中检测体细胞突变事件和种系变异之间的统计交互作用。生物工程学报,2014。PMID: 24297533。
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- 邢Ĵ,Wuren T,西蒙森TS,金丝WS,威瑟斯庞DJ,吴W,秦政,发怒的CD,Jorde LB,葛RL.高空蒙古族自然选择及表型变异的基因组分析。PLOS GEET 9(7):E1003634,2013。E-PUB 2013. PMID:23874230。
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- Shapiro医学博士,Kronenberg Z,Li C,Domyan ET,Pan H,Campbell M,Tan H,发怒的CD, Hu H, Vickrey AI, Nielsen SC, Stringham SA, Willerslev E, Gilbert MT, Yandell M, Zhang G, Wang J.基因组多样性和头冠的演变在岩石鸽。科学339(6123):1063-7,2013年E-2013酒吧结论:23371554。
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- 罗阿赫jc *,glusman g *,smit af *,Huff CD *, Hubley R, Shannon PT, Rowen L, Pant KP, Goodman N, Bamshad M, Shendure J, Drmanac R, Jorde LB, Hood L, Galas DJ, *共同第一作者.全基因组测序分析家庭四重奏的遗传遗传。科学328(5978):2010年636-9.E-PUB 2010.PMID:20220176。
- 西蒙森TS,张颖,发怒的CD邢Ĵ,金丝WS,威瑟斯庞DJ,伍德沃德SR,Jorde LB. 一种心肌病相关变异在印度的有限分布。安•胡•基因74(2):184-82010。电子出版物2010。PMID:20201939。
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- 邢杰,沃特金斯WS,胡Y,发怒的CD, Sabo A, Muzny DM, Bamshad MJ, Gibbs RA, Jorde LB, Yu F.印度的遗传多样性和欧亚种群扩张的推断。中国生物医学工程学报11(11):R113, 2010。e-Pub 2010。PMID: 21106085。
- 发怒的CD哈宾顿HC,罗杰斯AR.检测从连锁不平衡的基因组扫描积极选择。BMC基因组学11:8,2010年E-酒吧2010.结论:20051139。
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补助金支持
标题: | 常见结肠癌基因的大规模平行测序 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 肺癌(TRICL)癌症的跨学科研究;188bet体育网址3区域:肺癌和吸烟的流行病学建筑 |
资金来源: | NIH / NCI |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 结合生理学和基因组学揭示高原藏族人的功能适应 |
资金来源: | nih / nhlbi. |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | VAAST+:用于变量优先排序、风险评估和疾病基因发现的工具 |
资金来源: | NIH /美国 |
角色: | 校长Investigator-MDACC |
标题: | 林奇综合征的预期遗传分析 |
资金来源: | 德克萨斯州癌症预防研究所(Cprit)188bet体育网址 |
角色: | 共同调查员 |
标题: | 下一代测序技术识别和描述西班牙裔美国妇女乳腺癌风险基因 |
资金来源: | 安德鲁·萨宾家庭研究员奖 |
角色: | 首席研究员 |