RNA干扰和非编码RNA研究中心(RNA Center)是由美国癌症早期检测和治疗研究所(Red and Charline McCombs Institute for The Early Detection and Treatment of Cancer)成立的MD安德森癌症研究中心,贝勒医学院,德克萨斯大学休斯顿健康科学中心,莱斯大学和休斯敦大学将重点了解新发现的rna在癌症开始,进展和传播中的作用。
我们的任务是识别、设计和加速非编码RNA (ncRNA)发现的突破,从而导致癌症生物标志物和治疗方法。
我们的短期目标是在现有的临床研究的基础上188bet体育网址MD安德森通过与RNA中心的合作和成员关系,创建一个以ncRNA为中心的努力,通过评估、共同开发、促进和传播新的ncRNA技术来推动癌症分子标志物的发现。
我们的长期目标是创建一个机构范围内的ncRNA资源,在临床和基础研究的ncRNA和RNAi领域进行合作和出借专业知识。188bet体育网址
联系我们
拉胡尔Mitra博士。
RNA中心项目主任
电子邮件:rmitra@mdanderson.org或rnacenter@mdanderson.org
概述
在从癌症相关慢性疼痛的缓解到致命脑转移的管理等广泛领域,RNAi对各种癌症都有潜在的应用价值。RNAi提供了一种强大和高度特异性的方法来关闭促进癌症生长的基因。我们的研188bet体育网址究人员的目标是在整个癌症护理过程中开发这种潜力。
MicroRNA和其他短或长非编码rna改变参与了人类癌症的起始、进展和转移。主要的分子改变表现为基因表达的变化,通常是温和的,并对大量靶蛋白编码基因造成后果。与正常细胞相比,非编码rna在恶性细胞中广泛表达差异的原因可以通过这些基因在癌症相关基因组区域的位置、表观遗传机制和加工机制的改变来解释。
人类肿瘤中microRNA和其他短或长非编码rna的表达谱已经识别出与诊断、分期、进展、预后和治疗反应相关的特征。此外,谱分析已经被用来识别非编码rna,这些非编码rna可能代表激活的致癌途径的下游靶点,或者靶向与癌症有关的蛋白质编码基因。最近的研究表明,mirna和非编码超保守基因是难以捉摸的癌症易感基因的主要候选基因,而其他类型的非编码rna参与了导致恶性表型的遗传之谜。这些发现可用于开发有用的诊断和预后标记物,以及开发新的基于rna的癌症治疗方法。
RNAi at a Glance
RNAi是一种通过破坏蛋白质制造过程来“沉默”基因的基因疗法。科学家们称之为“分子生物学的中心法则”的一项声明基本上解释了这一过程:DNA制造RNA制造蛋白质。
DNA生活在细胞核中,由数千个基因组成,每一个基因都拥有构建特定蛋白质分子的密码或“蓝图”,从而确保该蛋白质执行特定的细胞功能。(蛋白质执行几乎所有的细胞功能,包括激活其他基因。)当身体需要某种特定的蛋白质时,它的遗传密码就会从DNA中复制出来;这个“拷贝”是一个被称为信使RNA (mRNA)的单链分子。这个过程被称为转录,发生在细胞核中。
但蛋白质是在细胞核外制造的,在被称为核糖体的微观结构中。信使rna是至关重要的环节:它是“信使”,从DNA中获取制造蛋白质的指令,并将它们传递给制造蛋白质的核糖体。
RNA干扰包括将mirna或sirna引入到它们的目标细胞中,结合并破坏特定的mrna——有效地关闭特定蛋白质的生产以及它们触发或抑制的任何基因表达。
术语表
核糖核酸核糖核酸的首字母缩写,是在每一种生物的细胞中发现的两种核酸之一(另一种是脱氧核糖核酸,或DNA)。RNA是由排列在一条链上的核苷酸小分子组成的。RNA传递制造蛋白质所需的信息。
非编码RNA (ncRNA)一种没有被翻译成蛋白质的功能性RNA分子。ncrna的例子有短干扰rna和microrna。
短干扰rna (sirna)小的双链分子,用于RNA干扰,防止基因转化为蛋白质。sirna也被称为小干扰rna或沉默rna。
小分子核糖核酸(microrna的)-单链RNA分子的小型发夹状结构,可以调节蛋白质编码基因的表达。
核糖核酸干扰(RNAi)一种基因沉默的革命性技术。在这项技术中,RNA被引入细胞,扰乱信使RNA,并阻止它被翻译成蛋白质。
服务
RNA干扰和非编码RNA中心(RNA Center)目前使用Ventana Discovery Ultra为microRNA和非编码RNA分析提供高通量原位杂交(ISH)技术。该中心提供设备和服务,以确定小鼠和人体组织中的基因表达模式。
设备:
- VENTANA发现超
灵活性:
- 无与伦比的方案灵活性,用于快速分析开发&
- 运行30个完全独立的协议以改进工作流
再现性:
- 全自动幻灯片处理,通过染色烘烤
- 现成的优化的试剂
- 对每个幻灯片进行精确加热
材料与方法:
- 冷冻和FFPE组织样本
- 来自Exiqon的microRNA探针或定制LNA探针
- 其他ncRNA特异性探针与LNA技术
- 用抗地高皂苷或抗fitc抗体/AP偶联第二抗体/ NBT-BCIP底物检测
- 在亮场显微镜下成像
- 数据解释由研究者自行决定(我们将使用徕卡应用套件提供信号强度的量化)
处理时间:
- miRNA杂交最多7个工作日
- 其他ncRNA特异性杂交最多10个工作日
在这个阶段,RNA中心可以提供显色ISH服务。在不久的将来,我们还将提供基于荧光的ISH和多重ISH/IHC。
更多信息,包括价格和提交申请,请联系张新娜博士,助理教授,RNA中心xzhang12@mdanderson.org.