Calin实验室

mirna和其他ncrna在癌症开始、进展和转移中的研究

2007年，据预测，美国将有大约60万人死于癌症——也就是说，全年每分钟约有一人死于癌症。近三十年来，蛋白质编码癌基因和抑癌基因的改变一直被认为是肿瘤发生的原因。因此，所有开发和测试新的癌症基因治疗策略以及开发新的诊断和预后标志物的尝试都涉及到蛋白编码基因。在过去的几年里，人们发现了数千个产生小的、非编码RNA (ncRNA)转录本的基因，这些转录本没有被命名为microrna (mirna)的重要开放阅读框。很明显，癌细胞的基因组复杂性远远超出了人们的预期。开发和检测非编码grnas癌症标记物和基于mirna的癌症基因治疗是确定治疗癌症患者的新选择的合理进一步步骤。

非编码rna (ncrna)是基因组星系中的陌生人，代表不能转化为蛋白质的基因，大小从19个核苷酸到25个核苷酸(nt)不等。包括哺乳动物在内，在高等真核生物中涉及基因沉默的RNAs超过10,000 nt。mirna通常是从60 nt到110 nt的发夹前体(折叠)RNA结构(pre-miRNA)中切除，该结构是从较大的初级转录本(pri-miRNA)中转录的。在功能上，miRNA通过与信使RNA (miRNA::mRNA)的直接或不完全相互作用降低了许多靶转录本的水平，以及这些转录本编码的蛋白质的数量。

提出的miRNA功能列表包括造血b细胞谱系命运(miR-181)， b细胞存活(miR-15a和miR-16-1)，细胞增殖控制(miR-125b和let-7)，大脑模式(miR-430)，胰腺细胞胰岛素分泌(miR-375)和脂肪细胞发育(miR-145)。我的实验室还专注于新长ncrna的鉴定，如超保守基因(UCGs)，这是一类新的非编码rna，是直接miRNA靶点，在人类癌症中也发生了改变。根据定义，超保守序列(ucr)是位于人类、大鼠和小鼠基因组同源区域之间的基因内和基因间绝对保守的人类基因组片段——100%的同源性，没有插入或删除。

我们发现，ucr通常位于与癌症有关的脆弱位点和基因组区域，而对全基因组ucr的分析揭示了人类癌症的独特特征。这些发现表明，非编码基因在肿瘤发生中的作用比以往认为的更大，并为识别由不同类别的非编码RNA基因组成的与诊断、预后和治疗反应相关的信号提供了前景。

在过去的几年里，我们率先提出了小的非编码rna - microRNA基因(mirna)参与人类肿瘤发生的想法(Calinet al。， 2002年美国国立科学研究院）.我们还证明了另一个名为超保守基因(UCGs)的ncrna家族参与了人类癌症，并直接与mirna相互作用(Calinet al。，《癌症细胞》，2007）.最后，我们聚焦于如何快速将这些发现转化为更好的诊断和治疗癌症患者(Fabbriet al。2011年《美国医学会杂志》,）.