常见问题
表的内容
- SurvNet是什么?
SurvNet是一个用于识别与患者生存数据最相关的基于网络的生物标记的应用程序。以生物网络(如基因调控网络或蛋白-蛋白相互作用网络)为平台,SurvNet采用系统方法识别与患者生存数据最相关的子网络。
web app需要一个网络文件(默认提供人类蛋白交互网络)、一个分子分析文件(如基因微阵列表达、蛋白表达、DNA甲基化或突变数据)和一个患者生存数据文件作为输入。结果将以用户友好的方式显示。SurvNet将是生物医学社区的生物学家、临床医生和生物信息学家的一个有价值的资源。
- 为什么SurvNet ?
生物医学研究的一个主要任务是识别生物标记物和患者生存之间的188bet体育网址相关性,这为疾病的诊断和治疗提供了基础。传统上,这种分析是基于单个基因进行的。然而,结果往往是非常嘈杂和难以解释的机制水平。利用网络作为平台,基于网络的生物标记有望增强生物信号并返回更可靠的结果。更重要的是,这些生物标记为疾病的分子机制提供了洞见。
- SurvNet是如何工作的?
网络生物标志物一直是这一领域的热点,已经发表了多篇相关研究。一般来说,识别基于网络的生物标志物的方法有三个组成部分:
- 网络评分功能(汇总节点评分和网络属性)
- 搜索算法
- 统计评估
SurvNet的创新之处是使用单变量Cox比例风险回归模型计算节点得分,该模型被广泛用于量化基因活性和患者生存数据之间的相关性(考克斯和奥克斯,1984年)。在搜索算法和统计评估方面,SurvNet采用与所描述的完全相同的方案Chuang等,2007和Jia等,2011。因此,SurvNet使用的基本方法是有效的。
- 上网需要登录吗?
不,登录不必需——任何人都可以免费使用。