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这生物信息学与计算生物学系是世界上计算癌症基因组学和医学中的首屈一指的计划之一,它是各种癌症联盟项目的主要参与者,如癌症基因组图集, 这国际癌症基因组联盟,而且NCI癌症研究信息技术188bet体育网址程序。我们的教师研究测序分析,蛋白质组学,统计遗传学,功能基因组学,扰动生物学,单细胞分析,肿瘤演化和癌症发育和耐药性的细胞和分子机制,以及开发广泛使用的计算算法和生物信息学工具。
目前的研究项目:188bet体育网址
- 一种用于检测,定量,解释和批量效应的专门基因组数据中心在分子分析数据上的癌症,作为NIH的基因组数据分析网络(GDAN)的一部分。
- 一种来自反相蛋白阵列(RPPA)平台的蛋白质表达数据综合分析的专用基因组数据中心,作为NIH的基因组数据分析网络(GDAN)的一部分。
- 下一代聚类热量图
- 癌症蛋白质组阿特拉斯
- 梅特布匹配
- 将药物敏感性结果与基因表达曲线相结合
- 在反相蛋白溶酶体阵列(RPPA)数据中发现和验证癌症签名
- 甲基化阵列分析
- 使用Exon阵列寻找替代拼接
- 微阵列和蛋白质组学分析实验的示例大小计算
- 质谱蛋白质组学数据的低级处理
许多教师还有小型湿式实验室可以补充他们的定量研究计划。188bet体育网址
合作研究188bet体育网址
MD Anderson为与临床医生合作提供了绝佳的机会,允许调查人员将其基本研究转化为癌症问题。188bet体育网址
生物信息学共享资源
该部门主持MD Anderson的生物信息学共享资源(BISR)(导演:约翰韦恩斯坦,联合主任:景王)。BISR通过癌症中心支持赠款,P30 CA016672部分由国家癌症研究所的国家癌症研究所部分资助。
BISR提供咨询服务,并通过临床和基础科学部门进行协作研究,并通过基因组学,蛋白质组学,分子和细胞生物学,放疗,计算机辅助诊断和图像分析来增强188bet体育网址定量方法。