癌症中非编码RNA的图谱

长期非编码RNA（LNCRNA）已成为癌症生物学的基本球员。使用最近的大规模RNA-SEQ数据集，尤其是来自癌症基因组Atlas（TCGA）的数据集，我们开发了一种用户友好的开放式WebApp，用于癌症中LNCRNA的互动探索。它表征了20个癌症类型的大型患者群组中LNCRNA的表达谱，包括TCGA和独立数据集（总体上的样本8,000个样品）。Tanric使研究人员能够在临188bet体育网址床和其他分子数据的背景下快速直观地分析患有的兴趣（注释的LNCRNA或任何用户定义的患者）内部和肿瘤类型。使用TANRIC，我们已经确定了大量具有潜在生物医学意义的LNCRNA，其中许多许多含量与肿瘤类型的已建立的治疗靶标和生物标志物具有强烈的相关性，或者在细胞系中具有药物敏感性。Tanric代表了研究LNCRNA在癌症中的功能和临床相关性的宝贵工具，大大促进了与LNCRNA相关的生物学发现和临床应用。

Broswer要求

我们建议使用最新版本的HTML5兼容浏览器，如Safari，Chrome和Firefox;根据版本，即可能不合适。javascript.必须通过浏览器启用。

经常问的问题

什么是tanric？

Tanric是癌症中LNCRNA互动探索的开放式资源。它表征了20个癌症类型的LNCRNA表达谱，包括TCGA，CCL和其他独立数据集。

我们如何量化长的非码-RNA表达？

基于BAM文件，我们使用RPKM量化LNCRNA的表达式级别。请参阅快速教程中显示的管道。

TANRRIN包含哪些数据集？

• TCGA（20种癌症类型）
• ccle（20个癌症谱系）
• 其他（三个独立数据集）

对从TANRIC获得的数据使用的任何限制？

TANRIC网站上可用的所有数据可以自由用于教育和研究目的。188bet体育网址如需其他目的，请联系韩亮博士。

TANRRIC中的模块是什么？

• 概括
• 可视化
• 下载
• 我的lncra ..
• 分析所有LNCRNA.
• 在细胞系中的lncrnas

我如何快速学习使用TANRIC？

查看Tanric的快速教程，其中包括有关如何使用每个模块的视频。

执照

学术用途不需要登录。对于行业或商业用户，请联系李军博士讨论许可证问题。

支持

对于与使用TANRIC Web应用程序相关的问题或支持，请联系李军博士。有关其他咨询，请联系汉良博士。

免责声明

在使用TCGA数据之前，请阅读TCGA出版和暂停指南。

此Web应用程序仅供教育和研究目的。188bet体育网址