生物信息学与计算生物学系

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swakk.

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概要
描述 一种生物信息学网络应用,用于使用滑动窗口替换率分析检测蛋白质中的阳性选择。单击下面的链接以使用swakk。
发展信息
URL. http://ibl.mdanderson.org/swakk/
语言 Perl CGI.
当前版本 2.1.0
执照 不需要
状态 活性
最近更新时间 2016-01-15
新闻 从普林斯顿迁移更新了代码库。
参考资料
引文 韩良,威华周,劳拉F. Landweber;Swakk:用于使用滑动窗口替换率分析检测蛋白质中阳性选择的Web服务器,核酸研究,第34卷,发行SUP188bet体育网址PLE_2,2006年7月1日,页面W382-W384https://doi.org/10.1093/nar/gkl272
帮助和支持
联系 韩亮

swakk.

Swakk是一种有价值的生物信息工具,用于检测阳性选择下蛋白质的氨基酸位点或地区。估计非同义与同义替代率的比率(k一种/ K.S.)在一对蛋白质编码DNA序列之间,通过在一个参考结构上滑动3D窗口或球形。该程序在3D蛋白质结构上显示结果。另外,为了比较或当参考结构不可用时,Web应用程序还可以对主序列进行滑动窗口分析。

浏览器要求

Swakk与所有主要浏览器兼容,包括Internet Explorer,Firefox,Safari和Chrome。javascript.必须通过浏览器启用。

用法

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