小组视图

这小组视图用于研究一组样品的骨料拼接模式。要使用此视图，必须已将组已加载到数据库中。（看加载数据中有关创建组的信息。）

这小组视图通常在的功能相似样本视图，唯一的主要区别是小组视图列出了本集团成员的平均统计数据。（例如，如果一个组分别具有10,15和20的三个样本，则外显子A的平均读取总量为15）同样，所有数值诸如PSI和幅度均来自平均统计。

要到达此视图，请首先选择组视图查看ComboBox.在里面数据选择栏。接下来，选择要使用的组DataSet ComboBox.同样在这一点数据选择栏。

当组负载时，结果面板将装入所选组中标识的所有拼接事件。

组视图结果面板

基因摘要标签的结果面板允许您对当前选定组中每个基因的结果进行排序、筛选、显示和导出。

需要进一步解释的列是::

• num样本- 表达此拼接事件的组中的样本数。如果基因未在特定样品中表达，则对于在该基因中检测到的任何接头事件，该样品不会朝该数量计数。
• 拼接事件- 平均分类为本集团检测到的差分剪切事件的分类列表。例如，ES（4）表示和外显子跳过在一个样品中更频繁地发生的外显子4。使用拼接事件过滤器下拉列表以查看每个事件类型的描述和代码。
• Uniprot事件- 分类为平均本集团中替代剪接事件影响的Uniprot注释区域。例如，B（9）表示外显子9上的结合位点，其在一个样本的同种型中更频繁地排除。有关Uniprot注释类别的全部列表，请参阅基因面板的蛋白质序列选项卡中的图例。

要访问表的过滤功能，请使用更改过滤器按钮。以下过滤器可用：

拼接事件选项卡在里面结果面板将包含一个检测到每个拼接事件的行。

可能需要附加说明的列是：

• Psi.- 百分比 - 剪接。所有异构体的异构素的百分比均为平均表达给定的拼接事件的所有同种型
• 震级- 拼接事件平均影响的同种型的比例
• ％OBS。：表达给定拼接事件的组的百分比。如果样品不表达特定基因，则不会在该样品上观察到该基因的任何事件。

要在组中查看各个样本PSIS的散点图，请右键单击拼接事件表中的行并选择显示psi taskplot.。

要访问表的过滤功能，请使用更改过滤器按钮。以下过滤器可用：

UNIPROT事件选项卡在里面结果面板包含一个由替代拼接影响的每一个Uniprot注释的特征区域的行。

要访问表的过滤功能，请使用更改过滤器按钮。以下过滤器可用：

组视图详细信息面板

图形图像选项卡的细节面板展示RNASEQ读取一组样本的读取平均对齐相同的接头图。

这显示价值观左侧的单选按钮可为每个外显子和拼接切换数字值的显示。有4个选项：

• 没有任何- 没有显示数值
• 读- 平均总读数重叠每个外显子/拼接
• opkm.- 本集团每百万千次读取平均观察。（请参阅OPKM的定义这里）
• 比率：平均基因RPKM的外显子/接头的群体平均OPKM的比率。

组视图中提供的一个附加功能是调查任何外显子或拼接的值的分布。使用opkm，总读取或选择的比率，右键单击外显子或拼接线，然后选择散点图或框和胡须图。另一个窗口将打开为该组中每个成员的外显子/拼接显示OPKM，总读取或比例值。这些图有助于确定外显子或剪接表达模式是否一致在组或广泛变量上。

蛋白质序列标签的细节面板显示蛋白质序列，功能注释，和相对表达水平推断剪接模式的基因从组。有关此选项卡的基本信息，请参阅蛋白质序列标签。

外显子信息选项卡的细节面板显示基因模型中每个外显子的位置，性质和核苷酸序列。更多信息可以在GUI概述部分中找到。