组群比较的观点

的组群比较的观点用于研究平均两组样本之间的差异剪接模式。要使用这个视图，组比较必须已经加载到数据库中。(见加载数据有关创建组比较的信息。)

的组群比较的观点在功能上是相同的样本比较的观点．两者之间唯一的区别是，不是给出两个样本的比较数据，而是组群比较的观点表示两组样本之间的差异。的日志2比组视图中的值表示比率，表明两组间外显子或剪接表达的log2差异。每个值都根据基因表达水平进行了校正，因此该比率表明在组之间的任何表达差异之上的剪接差异。一个日志2比1.0的含量为1.0表示组中的包含（阳性）或排除（阴性）的双重差异。在该视图中呈现的p值是在归一化的外显子或两者的接头表达上进行的T检验的结果团体。

要获得此视图，首先选择视图组合框在数据选择栏．然后，选择您希望使用数据组合框还在数据选择栏．

当组比较加载时，结果面板将加载在所选组比较中标识的所有拼接事件。

组比较视图结果面板

基因汇总选项卡的结果面板允许您对当前选择的组比较中的每个基因进行排序、筛选、显示和导出结果。

需要进一步解释的栏目是::

• 平均RPKM组1-第一组总体平均基因表达水平。
• 平均RPKM组2-第二组平均整体基因表达水平。
• 组1- 在第1组中表达给定基因的样品数
• 第2组- 在第2组中表达给定基因的样品数
• 剪接事件- 检测到的差分拼接事件的分类列表。例如，ES（4）表示和外显子跳过在一个样品中更频繁地发生的外显子4。使用拼接事件过滤器下拉列表以查看每个事件类型的描述和代码。
• UniProt事件- UniProt注释区域的分类列表，这些区域受样本之间的交替剪接差异的影响。例如，B(9)表示第9外显子上的一个结合位点，在一个样本的亚型中被排除的频率更高。UniProt注释类别的完整列表，请参阅基因面板的蛋白质序列标签中的图例。

若要访问表的筛选函数，请使用改变过滤器按钮。以下过滤器可用:

拼接事件选项卡在结果面板将为检测到的每个拼接事件包含一行。

需要其他解释的列：

• DPSI.- - - - - -δPercent-Spliced-In。第二组的平均PSI减去第一组的。
• p值:采用不等方差t检验计算，使用每组的PSI平均值和方差。
• 级-拼接事件影响的异构体比例

要在组中查看各个样本PSIS的散点图，请右键单击拼接事件表中的行并选择显示PSI散点图．

若要访问表的筛选函数，请使用改变过滤器按钮。以下过滤器可用:

Uniprot事件选项卡在结果面板将包含一行，以获取每个替代拼接影响的每个Uniprot注释功能。

要访问表的筛选功能，请使用Change筛选按钮。以下过滤器可用:

组比较视图详细面板

图形图像选项卡的详细信息面板显示了一组样本的RNASeq读取如何平均对齐到相同的拼接图上。

组比较视图中提供的唯一附加功能是能够调查任何外显子或剪接值的分布。选择log2 ratio, OPKM，或Total Reads，然后右键单击一个外显子或剪接线。这将弹出一个菜单，您将能够选择散点图或盒须图来表示组的样本值。这些图有助于确定组成员之间的差异有多显著(相对于平均值中由离群值驱动的差异)。选择Log2 Ratio，然后求一个plot，将每个样本的外显子表达(或剪接表达)除以整体基因表达值的比值。这通常是一个很好的方法来探索组之间的剪接差异，因为每个样本值被修正为基因表达水平的变异。

蛋白质序列标签的详细信息面板显示了蛋白质序列，功能注释和相对表达水平的异构体推断剪接模式的基因从一对样本。有关此选项卡的基本信息，请参阅蛋白质序列标签．

下面的例子显示，第1组(正常样本组)的外显子4和5上的核苷酸磷酸结合位点表达量高于第2组(肿瘤样本组)。

外显子信息选项卡的详细信息面板显示基因模型中每个外显子的位置、性质和核苷酸序列。更多的信息可以在GUI概述部分找到。