BreakFusion
概述 | |
描述 | 从RNA-seq数据中识别基因融合的计算管道。 |
发展信息 | |
语言 | Perl和c++ |
当前版本 | 1.0 |
许可证 | GPL v3 |
状态 | 活跃的 |
最后一次更新 | 01/05/2012 |
新闻 | 应用于TCGA AML和BRCA融合鉴定 |
参考文献 | |
引用 | 陈凯,Wallis, J.W., kandies, C.等,BreakFusion:全转录组配对测序数据中基因融合的靶向装配鉴定,生物信息学第28卷,1923(2012)页。https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts272 |
帮助和支持 | |
联系 | 肯•陈 |
从RNA-seq数据中识别基因融合的计算管道
BreakTrans包包括两部分,可执行文件和针对每种特定癌症的注释数据文件。用户需要下载可执行文件和注释数据库才能运行。
整个软件包(6.5 Mb)
自述
注释数据库(202mb)