生物资讯及计算生物学学系

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BREPA

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概述
描述 通过成对对齐的断点分辨率
发展信息
语言 Perl
许可证 GPL v3
状态 不活跃的
最后一次更新 2015/01/23
帮助和支持
联系 肯•陈

BREPA

BREPA是一种工具,用于准确推断结构变异类型,核苷酸分辨断点,断点的局部上下文(微同源性,微插入),给定一个覆盖断点的contig/long read。它通过BWA-MEM将contig/long read对齐到引用,并解释对齐结果。

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BREPA的源代码和示例测试数据可以在以下网站免费获得https://bitbucket.org/xianfan/brepa