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BREPA
概述 | |
描述 | 通过成对对齐的断点分辨率 |
发展信息 | |
语言 | Perl |
许可证 | GPL v3 |
状态 | 不活跃的 |
最后一次更新 | 2015/01/23 |
帮助和支持 | |
联系 | 肯•陈 |
BREPA是一种工具,用于准确推断结构变异类型,核苷酸分辨断点,断点的局部上下文(微同源性,微插入),给定一个覆盖断点的contig/long read。它通过BWA-MEM将contig/long read对齐到引用,并解释对齐结果。
BREPA的源代码和示例测试数据可以在以下网站免费获得https://bitbucket.org/xianfan/brepa